Difference between revisions of "Team:USTC/Notebook/8 16"

(Created page with "<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="...")
 
 
(13 intermediate revisions by 4 users not shown)
Line 1: Line 1:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
+
<html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">
+
 
   <head>
 
   <head>
     <title>MarkdownPad Document</title>
+
    <meta charset="utf-8">
     <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
+
    <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0, user-scalable=yes">
     <style type="text/css">
+
     <title>Modeling</title>
    /* GitHub stylesheet for MarkdownPad (http://markdownpad.com) */
+
     <!--<link rel="stylesheet" type="text/css" class="ui" href="semantic.min.css">-->
    /* Author: Nicolas Hery - http://nicolashery.com */
+
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:USTC/semantics?action=raw&ctype=text/css">
     /* Version: b13fe65ca28d2e568c6ed5d7f06581183df8f2ff */
+
     <style>
     /* Source: https://github.com/nicolahery/markdownpad-github */
+
     /********************Dealing with default Mediawiki setting*******************/
    /* RESET
+
     #top_title {
    =============================================================================*/
+
     display:none;
     html, body, div, span, applet, object, iframe, h1, h2, h3, h4, h5, h6, p, blockquote, pre, a, abbr, acronym, address, big, cite, code, del, dfn, em, img, ins, kbd, q, s, samp, small, strike, strong, sub, sup, tt, var, b, u, i, center, dl, dt, dd, ol, ul, li, fieldset, form, label, legend, table, caption, tbody, tfoot, thead, tr, th, td, article, aside, canvas, details, embed, figure, figcaption, footer, header, hgroup, menu, nav, output, ruby, section, summary, time, mark, audio, video {
+
     position:absolute;
     margin: 0;
+
     padding: 0;
+
    border: 0;
+
 
     }
 
     }
     /* BODY
+
     #content {
    =============================================================================*/
+
     padding:0px; width:auto; margin-top:-11px; margin-left:0px;
    body {
+
     font-family: Helvetica, arial, freesans, clean, sans-serif;
+
    font-size: 14px;
+
    line-height: 1.6;
+
    color: #333;
+
    background-color: #fff;
+
    padding: 20px;
+
    max-width: 960px;
+
    margin: 0 auto;
+
 
     }
 
     }
     body>*:first-child {
+
     #globalWrapper{
    margin-top: 0 !important;
+
 
     }
 
     }
     body>*:last-child {
+
     body {
    margin-bottom: 0 !important;
+
 
     }
 
     }
     /* BLOCKS
+
     #bodyContent {
    =============================================================================*/
+
    p, blockquote, ul, ol, dl, table, pre {
+
    margin: 15px 0;
+
 
     }
 
     }
     /* HEADERS
+
     div#top_menu_14{
    =============================================================================*/
+
     height:21px;
    h1, h2, h3, h4, h5, h6 {
+
     border-bottom-color:#383838;
     margin: 20px 0 10px;
+
     padding: 0;
+
    font-weight: bold;
+
    -webkit-font-smoothing: antialiased;
+
 
     }
 
     }
     h1 tt, h1 code, h2 tt, h2 code, h3 tt, h3 code, h4 tt, h4 code, h5 tt, h5 code, h6 tt, h6 code {
+
     div#top_menu_under{
     font-size: inherit;
+
      
 
     }
 
     }
     h1 {
+
     div#globalWrapper{
     font-size: 28px;
+
     padding-bottom: 0;
    color: #000;
+
 
     }
 
     }
     h2 {
+
     #top_menu_under{
     font-size: 24px;
+
     height:0;
    border-bottom: 1px solid #ccc;
+
    color: #000;
+
 
     }
 
     }
     h3 {
+
     #sideMenu{
     font-size: 18px;
+
     display:none;
 +
    position:fixed;
 +
    left:220px;
 
     }
 
     }
     h4 {
+
     /******************************************************************************/
     font-size: 16px;
+
    </style>
 +
    <style>
 +
    div.ui.inverted.vertical.sticky.basic.menu a.item{
 +
     -webkit-transition: background-color 0.6s , color 0.6s;
 
     }
 
     }
     h5 {
+
     div.ui.inverted.vertical.sticky.basic.menu a.item:hover{
     font-size: 14px;
+
     background-color: #FFFA99;
 +
    color:#6E47B2;
 
     }
 
     }
     h6 {
+
     p{
     color: #777;
+
     font-family: 'Lato'!important;
     font-size: 14px;
+
     font-size:16px !important;
 +
    line-height: 150%;
 
     }
 
     }
     body>h2:first-child, body>h1:first-child, body>h1:first-child+h2, body>h3:first-child, body>h4:first-child, body>h5:first-child, body>h6:first-child {
+
     </style>
     margin-top: 0;
+
      
     padding-top: 0;
+
     <!--For multiple devices-->
    }
+
     <style>
    a:first-child h1, a:first-child h2, a:first-child h3, a:first-child h4, a:first-child h5, a:first-child h6 {
+
     @media only screen
    margin-top: 0;
+
     and (min-width: 1025px){
    padding-top: 0;
+
     div#menuForTablet{
    }
+
     display:none;
    h1+p, h2+p, h3+p, h4+p, h5+p, h6+p {
+
    margin-top: 10px;
+
    }
+
    /* LINKS
+
    =============================================================================*/
+
    a {
+
    color: #4183C4;
+
    text-decoration: none;
+
    }
+
    a:hover {
+
    text-decoration: underline;
+
    }
+
    /* LISTS
+
    =============================================================================*/
+
    ul, ol {
+
    padding-left: 30px;
+
    }
+
    ul li > :first-child,
+
     ol li > :first-child,
+
    ul li ul:first-of-type,
+
    ol li ol:first-of-type,
+
    ul li ol:first-of-type,
+
    ol li ul:first-of-type {
+
    margin-top: 0px;
+
    }
+
    ul ul, ul ol, ol ol, ol ul {
+
    margin-bottom: 0;
+
    }
+
    dl {
+
    padding: 0;
+
    }
+
    dl dt {
+
    font-size: 14px;
+
    font-weight: bold;
+
    font-style: italic;
+
    padding: 0;
+
    margin: 15px 0 5px;
+
    }
+
    dl dt:first-child {
+
    padding: 0;
+
    }
+
    dl dt>:first-child {
+
     margin-top: 0px;
+
     }
+
    dl dt>:last-child {
+
    margin-bottom: 0px;
+
    }
+
    dl dd {
+
     margin: 0 0 15px;
+
    padding: 0 15px;
+
    }
+
    dl dd>:first-child {
+
    margin-top: 0px;
+
    }
+
    dl dd>:last-child {
+
    margin-bottom: 0px;
+
    }
+
    /* CODE
+
    =============================================================================*/
+
    pre, code, tt {
+
    font-size: 12px;
+
    font-family: Consolas, "Liberation Mono", Courier, monospace;
+
    }
+
    code, tt {
+
    margin: 0 0px;
+
    padding: 0px 0px;
+
    white-space: nowrap;
+
    border: 1px solid #eaeaea;
+
    background-color: #f8f8f8;
+
    border-radius: 3px;
+
    }
+
    pre>code {
+
     margin: 0;
+
    padding: 0;
+
    white-space: pre;
+
    border: none;
+
    background: transparent;
+
    }
+
    pre {
+
    background-color: #f8f8f8;
+
    border: 1px solid #ccc;
+
    font-size: 13px;
+
    line-height: 19px;
+
    overflow: auto;
+
    padding: 6px 10px;
+
    border-radius: 3px;
+
 
     }
 
     }
     pre code, pre tt {
+
     div#main_page_content{
     background-color: transparent;
+
     margin-top:-13px;
     border: none;
+
     left:210px;
 +
    max-width: 1070px;
 
     }
 
     }
     kbd {
+
     #ui_article{
     -moz-border-bottom-colors: none;
+
     width:64%;
    -moz-border-left-colors: none;
+
    -moz-border-right-colors: none;
+
    -moz-border-top-colors: none;
+
    background-color: #DDDDDD;
+
    background-image: linear-gradient(#F1F1F1, #DDDDDD);
+
    background-repeat: repeat-x;
+
    border-color: #DDDDDD #CCCCCC #CCCCCC #DDDDDD;
+
    border-image: none;
+
    border-radius: 2px 2px 2px 2px;
+
    border-style: solid;
+
    border-width: 1px;
+
    font-family: "Helvetica Neue",Helvetica,Arial,sans-serif;
+
    line-height: 10px;
+
    padding: 1px 4px;
+
 
     }
 
     }
    /* QUOTES
 
    =============================================================================*/
 
    blockquote {
 
    border-left: 4px solid #DDD;
 
    padding: 0 15px;
 
    color: #777;
 
 
     }
 
     }
     blockquote>:first-child {
+
     @media only screen
     margin-top: 0px;
+
    and (max-width : 1024px)
 +
    and (orientation : landscape) {
 +
    div#main_page_content{
 +
     margin-top:40px;
 
     }
 
     }
     blockquote>:last-child {
+
     div#menuForComputer{
     margin-bottom: 0px;
+
     display:none;
 +
    width:0;
 +
    height:0;
 
     }
 
     }
     /* HORIZONTAL RULES
+
     #ui_article{
    =============================================================================*/
+
     width:63%;
    hr {
+
     clear: both;
+
    margin: 15px 0;
+
    height: 0px;
+
    overflow: hidden;
+
    border: none;
+
    background: transparent;
+
    border-bottom: 4px solid #ddd;
+
    padding: 0;
+
 
     }
 
     }
    /* TABLES
 
    =============================================================================*/
 
    table th {
 
    font-weight: bold;
 
 
     }
 
     }
     table th, table td {
+
     @media only screen
     border: 1px solid #ccc;
+
     and (max-width : 1024px)
     padding: 6px 13px;
+
    and (orientation : portrait) {
 +
    div#main_page_content{
 +
     margin-top:40px;
 
     }
 
     }
     table tr {
+
     div#menuForComputer{
     border-top: 1px solid #ccc;
+
     display:none;
     background-color: #fff;
+
     width:0;
 +
    height:0;
 
     }
 
     }
     table tr:nth-child(2n) {
+
     #ui_article{
     background-color: #f8f8f8;
+
     width:63%;
 
     }
 
     }
    /* IMAGES
 
    =============================================================================*/
 
    img {
 
    max-width: 100%
 
 
     }
 
     }
 
     </style>
 
     </style>
 
   </head>
 
   </head>
 +
 
 +
 
 
   <body>
 
   <body>
     **Date: 8.28**
+
      
    **Recorder: Yu Xie**
+
    <div class="ui inverted vertical sidebar basic menu" style="border-radius:0; background-color: #44a17d; padding-top:9px;font-size:medium;">
     **Plasmid Extraction for pSB1C3 containing sfGFP1-10**
+
      <div class="item">
    **Recorder: Yu Xie**
+
        <img class="ui image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/36/T--USTC--a_prion%27s_life.png">
    **PCR of bacteria which have recombinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10**
+
      </div>
    Procedure:
+
      <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC">Home </a>
    1.Prepare 4 PCR tubes and sequentially add:
+
      <div class="item">
    |sample|1,2,3,4|
+
        <div class="header">Project</div>
    |-|
+
        <div class="menu">
    |Sterilized ddH<sub>2</sub>O|9 μL|
+
          <a class="item" id="Description" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Description"> Description </a>
    |2×HiFi-PCR Master|12.5 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Design"> Design </a>
    |Template(bacteria)|1.5 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Proof"> Proof of Concept </a>
    |Primer 1|1 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Demonstrate"> Demonstrate </a>
    |Primer 2|1 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Results"> Results </a>
    |total|25 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Notebook"> Notebook </a>
    2.PCR reaction
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Spin_off"> Spin-off </a>
    Parameters setting:
+
        </div>
    |stage|temperature|time|
+
      </div>
    |-|
+
      <div class="item">
    |Pre-Duration|95|10 min|
+
        <div class="header">Parts</div>
    |Duration|95|1 min|
+
        <div class="menu">
    |Anneal|58|1 min|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Basic_Part"> Basic Parts </a>
    |Extend|72|1 min 50s|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Composite_Part"> Composite Parts </a>
    |Post-Extend|72|10 min|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Part_Collection"> Part Collection </a>
    |Final|4|--|
+
        </div>
    30 cycles(Duration ~ Extend)
+
      </div>
    Agarose gel electrophoresis Results:
+
      <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Safety">Safety </a>
    ![图片名称](https://attachments.tower.im/tower/322d4f0fa26e46e3b9d85ffceb7a807a?filename=pSB1C3-sfGFP1-10.JPG)
+
      <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Attributions">Attributions </a>
    succeed!
+
      <div class="item">
    **Recorder: Yu Xie**
+
        <div class="header">Human Practices</div>
    **PCR of recombinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10**
+
        <div class="menu">
    Procedure:
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/HP/Silver">Silver </a>
    1. Prepare 4 PCR tubes and sequentially add:
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/HP/Gold">Gold </a>
    |sample|1,2,3,4|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Integrated_Practices"> Integrated Practices </a>
    |-|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Engagement">Engagement </a>
    |Sterilized ddH<sub>2</sub>O|9.5 μL|
+
        </div>
    |2×HiFi-PCR Master|12.5 μL|
+
      </div>
    |Template(plasmid)|1 μL|
+
      <div class="item">
    |Primer 1|1 μL|
+
        <div class="header">Awards</div>
    |Primer 2|1 μL|
+
        <div class="menu">
    |total|25 μL|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Model"> Model </a>
    2. PCR reaction
+
        </div>
    Parameters setting:
+
      </div>
    |stage|temperature|time
+
      <div class="item">
    |-|
+
        <div class="header">Team</div>
    |Pre-Duration|95|10 min|
+
        <div class="menu">
    |Duration|95|1 min|
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
    |Anneal|58|1 min|
+
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
    |Extend|72|1 min 15s|
+
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
    |Post-Extend|72|10 min|
+
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
    |Final|4|--|
+
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
    30 cycles(Duration ~ Extend)
+
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
    Agarose gel electrophoresis Results:
+
        </div>
    ![A](https://attachments.tower.im/tower/322d4f0fa26e46e3b9d85ffceb7a807a?filename=pSB1C3-sfGFP1-10.JPG)
+
      </div>
    succeed!
+
     </div>
    **Date: 8.29**
+
   
    **Colony PCR to examine ADW**
+
   
    **Recorder: Yinchenguang Lyu**
+
    <div class="pusher">
    6.25 μL  2×Taq PCR Master Mix
+
      <div class="ui menu top fixed" id="menuForTablet" style="background-color: #FBBD08; top:21px;">
    2 μL  culture containing Ecoli
+
        <div class="ui fluid container">
    0.4 μL bio-p
+
          <a class="item" id="sidebarMenuTrigger">Navigation<i class="right arrow icon"></i></a>
    0.4 μL  M13-f
+
          <div class="right item">A Prion's Life</div>
    3.45 μL ddH<sub>2</sub>O
+
        </div>
    **Double Digest to examine ADW and C3AD35**
+
      </div>
    **Recorder: Yinchenguang Lyu**
+
      <div class="ui basic segment" id="main_page_content" style="margin-bottom:0;padding:0 0 20px 0;">
    *result(along with that of the former part)*
+
        <div class="ui left attached rail" id="menuForComputer" style=" width:210px;">
    ![a](https://attachments.tower.im/tower/c10a8a319b124764940c266b56d7938f?filename=0801.JPG)
+
          <div class="ui inverted vertical sticky basic menu" style="border-radius:0; background-color: #44a17d; padding-top:9px;font-size:medium;">
    (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred), digested-ADW1, digested-ADW2, C3AD35(1), C3AD35(2), ADW1, ADW2, ADW3, ADW4, ADW5, ADW6)
+
            <div class="item">
    **Date:8.30**
+
              <img class="ui image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/36/T--USTC--a_prion%27s_life.png">
    **Plasmid extraction of pGAL1(site mutation)**
+
            </div>
    **Recorder: Xuefeng Meng**
+
            <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC">Home </a>
    |sample|1|2|3|4|
+
            <div class="item">
    |-|
+
              <div class="header">Project</div>
    |concentratin(ng/μL)|379.6|232.9|277.2|375.4|
+
              <div class="menu">
    |A260/A280|1.81|1.85|1.90|1.90|
+
                <a class="item" id="Description" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Description"> Description </a>
    |A260/A230|1.42|1.72|2.33|2.31|
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Design"> Design </a>
  </body>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Proof"> Proof of Concept </a>
</html>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Demonstrate"> Demonstrate </a>
<!-- This document was created with MarkdownPad, the Markdown editor for Windows (http://markdownpad.com) -->
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Results"> Results </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Notebook"> Notebook </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Spin_off"> Spin-off </a>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="item">
 +
              <div class="header">Parts</div>
 +
              <div class="menu">
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Basic_Part"> Basic Parts </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Composite_Part"> Composite Parts </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Part_Collection"> Part Collection </a>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
            <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Safety">Safety </a>
 +
            <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Attributions">Attributions </a>
 +
            <div class="item">
 +
              <div class="header">Human Practices</div>
 +
              <div class="menu">
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/HP/Silver">Silver </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/HP/Gold">Gold </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Integrated_Practices"> Integrated Practices </a>
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Engagement">Engagement </a>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="item">
 +
              <div class="header">Awards</div>
 +
              <div class="menu">
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Model"> Model </a>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
            <div class="item">
 +
              <div class="header">Team</div>
 +
              <div class="menu">
 +
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
 +
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
 +
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
 +
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
 +
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
 +
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
 +
       
 +
        <!--Page content starts here-->
 +
        <div class="ui basic segment">
 +
          <div class="ui basic segment" style="padding-top: 20px; font-size:xx-large;">
 +
            <h1 class="ui center aligned icon header">
 +
            <i class="circular calendar icon"></i>
 +
            <div class="content">Notebook
 +
              <div class="sub header">Together we stand</div>
 +
            </div>
 +
            </h1>
 +
          </div>
 +
          <div class="ui basic segment">
 +
            <h3 class="ui center aligned header">Performers</h3>
 +
            <div class="ui three column grid">
 +
              <div class="column"></div>
 +
              <div class="column">
 +
                <div class="ui fluid card">
 +
                  <div class="image">
 +
                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/b/b3/T--USTC--TeamPhoto.jpeg">
 +
                  </div>
 +
                  <div class="content">
 +
                    <div class="description">Everybody</div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
              <div class="column"></div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
 +
        <div class="ui segment" id="ui_article" style="min-height:800px; margin-left: 35px;margin-top:30px;">
 +
         
 +
         
 +
          <p><strong>Plasmid Extraction for sg11</strong>
 +
          <strong>Recorder: Dong Yan &amp; Kaiyue Ma</strong></p>
 +
          <p>Sample:bacteria containing recombinant plasmid pYeT containing sg11</p>
 +
          <table class="ui celled small table">
 +
            <thead>
 +
              <tr>
 +
                <th>Number</th>
 +
                <th>1</th>
 +
                <th>2</th>
 +
                <th>3</th>
 +
                <th>4</th>
 +
                <th>5</th>
 +
                <th>6</th>
 +
                <th>7</th>
 +
                <th>8</th>
 +
              </tr>
 +
            </thead>
 +
            <tbody>
 +
              <tr>
 +
                <td>A260/A280</td>
 +
                <td>1.89</td>
 +
                <td>1.86</td>
 +
                <td>1.76</td>
 +
                <td>1.88</td>
 +
                <td>1.87</td>
 +
                <td>1.81</td>
 +
                <td>1.86</td>
 +
                <td>1.88</td>
 +
              </tr>
 +
              <tr>
 +
                <td>A260/230</td>
 +
                <td>2.27</td>
 +
                <td>2.02</td>
 +
                <td>1.23</td>
 +
                <td>2.12</td>
 +
                <td>2.23</td>
 +
                <td>1.45</td>
 +
                <td>1.82</td>
 +
                <td>2.25</td>
 +
              </tr>
 +
              <tr>
 +
                <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                <td>159.3</td>
 +
                <td>113.5</td>
 +
                <td>265.7</td>
 +
                <td>46.8</td>
 +
                <td>130.5</td>
 +
                <td>189.3</td>
 +
                <td>59.7</td>
 +
                <td>169.3</td>
 +
              </tr>
 +
            </tbody>
 +
            <table class="ui celled small table">
 +
              <p><strong>Double digestion of AD, BD and YeUGAP</strong>
 +
              <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
              <p><em>Reaction system:</em></p>
 +
              <p>AD &amp; BD:
 +
                4 μL                  template
 +
                1.35 μL              EcoRI
 +
                2 μL                  PstI
 +
                2 μL                  10× FastDigest Buffer
 +
              10.65                Sterilized ddH<sub>2</sub>O</p>
 +
              <p>YeUGAP:
 +
                5 μL                 template
 +
                1 μL                  EcoRI
 +
                0.35 μL               PstI
 +
                2 μL                  10× FastDigest Buffer
 +
              11.65                Sterilized ddH<sub>2</sub>O</p>
 +
              <p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/c/c3/T--USTC--NB_0817_1.jpeg/750px-T--USTC--NB_0817_1.jpeg" alt="0801" /></p>
 +
              <p><strong>Gel Extraction for the product of the double digestion</strong>
 +
              <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
              <table class="ui celled small table">
 +
                <thead>
 +
                  <tr>
 +
                    <th>sample</th>
 +
                    <th>AD</th>
 +
                    <th>BD</th>
 +
                    <th>YeUGAP</th>
 +
                  </tr>
 +
                </thead>
 +
                <tbody>
 +
                  <tr>
 +
                    <td>A260/A280</td>
 +
                    <td>1.89</td>
 +
                    <td>1.84</td>
 +
                    <td>1.86</td>
 +
                  </tr>
 +
                  <tr>
 +
                    <td>A260/230</td>
 +
                    <td>0.48</td>
 +
                    <td>0.85</td>
 +
                    <td>0.79</td>
 +
                  </tr>
 +
                  <tr>
 +
                    <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                    <td>13.1</td>
 +
                    <td>25.1</td>
 +
                    <td>33.9</td>
 +
                  </tr>
 +
                </tbody>
 +
                <table class="ui celled small table">
 +
                  <p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
 +
                  <strong>Plasmid Extraction for YeWGAP</strong></p>
 +
                  <table class="ui celled small table">
 +
                    <thead>
 +
                      <tr>
 +
                        <th>sample</th>
 +
                        <th>08171001</th>
 +
                        <th>08171002</th>
 +
                        <th>08171003</th>
 +
                        <th>08171004</th>
 +
                        <th>08171005</th>
 +
                        <th>08171006</th>
 +
                      </tr>
 +
                    </thead>
 +
                    <tbody>
 +
                      <tr>
 +
                        <td>A260/280</td>
 +
                        <td>1.89</td>
 +
                        <td>1.83</td>
 +
                        <td>1.80</td>
 +
                        <td>1.70</td>
 +
                        <td>2.88</td>
 +
                        <td>1.89</td>
 +
                      </tr>
 +
                      <tr>
 +
                        <td>A260/230</td>
 +
                        <td>2.36</td>
 +
                        <td>1.83</td>
 +
                        <td>1.47</td>
 +
                        <td>0.99</td>
 +
                        <td>2.07</td>
 +
                        <td>2.14</td>
 +
                      </tr>
 +
                      <tr>
 +
                        <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                        <td>916.3</td>
 +
                        <td>359.3</td>
 +
                        <td>300.5</td>
 +
                        <td>193.6</td>
 +
                        <td>53.6</td>
 +
                        <td>132.2</td>
 +
                      </tr>
 +
                    </tbody>
 +
                    <table class="ui celled small table">
 +
                      <p><strong>Ligation of YeUGAP and AD</strong>
 +
                      <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                      <p>3 μL YeUGAP
 +
                        3 μL  AD
 +
                        0.4 μL T4 DNA ligase
 +
                        2 μL  10×T4 DNA Ligase Buffer
 +
                        11.6 μL ddH<sub>2</sub>O
 +
                      20 μL in total.</p>
 +
                      <p><strong>Double digestion of AD,BD and PYU</strong>
 +
                      <strong>Recorder:Chengle Zhang</strong></p>
 +
                      <p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/9/9c/T--USTC--NB_0817_2.jpeg" alt="图片名称" /></p>
 +
                      <table class="ui celled small table">
 +
                        <thead>
 +
                          <tr>
 +
                            <th>Sample</th>
 +
                            <th>AD(0230)</th>
 +
                            <th>BD(0231)</th>
 +
                            <th>PYU(0232)</th>
 +
                          </tr>
 +
                        </thead>
 +
                        <tbody>
 +
                          <tr>
 +
                            <td>A260/A280</td>
 +
                            <td>1.97</td>
 +
                            <td>1.83</td>
 +
                            <td>1.89</td>
 +
                          </tr>
 +
                          <tr>
 +
                            <td>A260/A280</td>
 +
                            <td>0.12</td>
 +
                            <td>0.41</td>
 +
                            <td>0.75</td>
 +
                          </tr>
 +
                          <tr>
 +
                            <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                            <td>24.8</td>
 +
                            <td>62.5</td>
 +
                            <td>105.4</td>
 +
                          </tr>
 +
                        </tbody>
 +
                        <table class="ui celled small table">
 +
                          <p><strong>Plasmid Extraction for sfGFP1-10</strong>
 +
                          <strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong></p>
 +
                          <p>Sample:bacteria containing recombinant plasmid pYeT containing sfGFP1-10</p>
 +
                          <table class="ui celled small table">
 +
                            <thead>
 +
                              <tr>
 +
                                <th>Number</th>
 +
                                <th>1</th>
 +
                                <th>2</th>
 +
                                <th>3</th>
 +
                                <th>4</th>
 +
                              </tr>
 +
                            </thead>
 +
                            <tbody>
 +
                              <tr>
 +
                                <td>A260/A280</td>
 +
                                <td>1.93</td>
 +
                                <td>1.89</td>
 +
                                <td>1.92</td>
 +
                                <td>1.93</td>
 +
                              </tr>
 +
                              <tr>
 +
                                <td>A260/230</td>
 +
                                <td>2.04</td>
 +
                                <td>1.46</td>
 +
                                <td>1.38</td>
 +
                                <td>2.04</td>
 +
                              </tr>
 +
                              <tr>
 +
                                <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                <td>43.2</td>
 +
                                <td>19.7</td>
 +
                                <td>49.3</td>
 +
                                <td>20.8</td>
 +
                              </tr>
 +
                            </tbody>
 +
                            <table class="ui celled small table">
 +
                              <p>**Recorder:Chenyang Li **
 +
                              <strong>Double Digestion of YeWGAP, ADU, BDW</strong></p>
 +
                              <p>Procedure:</p>
 +
                              <table class="ui celled small table">
 +
                                <thead>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <th>number</th>
 +
                                    <th>YeWGAP18171001</th>
 +
                                    <th>YeWGAP18171002</th>
 +
                                    <th>YeWGAP18171003</th>
 +
                                    <th>YeWGAP18171004</th>
 +
                                    <th>ADU1001</th>
 +
                                    <th>ADU1002</th>
 +
                                    <th>BDW1003</th>
 +
                                    <th>BDW1004</th>
 +
                                  </tr>
 +
                                </thead>
 +
                                <tbody>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>sample</td>
 +
                                    <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                    <td>YeWGAP08171002</td>
 +
                                    <td>YeWGAP08171003</td>
 +
                                    <td>YeWGAP08171004</td>
 +
                                    <td>ADU1</td>
 +
                                    <td>ADU2</td>
 +
                                    <td>BDW3</td>
 +
                                    <td>BDW4</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>nuclease-free water(μL)</td>
 +
                                    <td>8.4</td>
 +
                                    <td>76</td>
 +
                                    <td>7.3</td>
 +
                                    <td>5.4</td>
 +
                                    <td>0</td>
 +
                                    <td>4</td>
 +
                                    <td>0</td>
 +
                                    <td>0</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>10*Green Buffer(μL)</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                    <td>1</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>plasmid(μL)</td>
 +
                                    <td>0.6</td>
 +
                                    <td>1.4</td>
 +
                                    <td>1.7</td>
 +
                                    <td>2.6</td>
 +
                                    <td>8</td>
 +
                                    <td>4</td>
 +
                                    <td>8</td>
 +
                                    <td>8</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>EcoRI(μL)</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                    <td>0.75</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                  <tr>
 +
                                    <td>PstI(μL)</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                    <td>0.25</td>
 +
                                  </tr>
 +
                                </tbody>
 +
                                <table class="ui celled small table">
 +
                                  <p>Mix gently and incubate at 37 degree Celsius  for 15 min.</p>
 +
                                  <p>result:
 +
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/4/48/T--USTC--NB_0817_3.jpeg" alt="a" />
 +
                                  (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),08171001,18171001,18171002,08171003,18171003,18171004,<br>ADU1,ADU1001,ADU2,ADU1002,BDW3,BDW1003,BDW4,BDW1004.)</p>
 +
                                  <p><strong>Ligation of pSB1C3 and AD</strong>
 +
                                  <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                  <p>4 μL  pSB1C3
 +
                                    2.8 μL  AD
 +
                                    0.4 μL T4 DNA ligase
 +
                                    2 μL  10×T4 DNA Ligase Buffer
 +
                                    10.8 μL ddH<sub>2</sub>O
 +
                                  20 μL in total.</p>
 +
                                  <p><strong>DATE:8.18</strong></p>
 +
                                  <p>**Recorder:Chenyang Li **
 +
                                  <strong>Double Digestion of YeWGAP,BD</strong></p>
 +
                                  <p>Procedure:</p>
 +
                                  <table class="ui celled small table">
 +
                                    <thead>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <th>number</th>
 +
                                        <th>YeWGAPD8181001</th>
 +
                                        <th>YeWGAPD8181006</th>
 +
                                        <th>BDD8181001</th>
 +
                                        <th>BDD8181002</th>
 +
                                      </tr>
 +
                                    </thead>
 +
                                    <tbody>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>sample</td>
 +
                                        <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                        <td>YeWGAP08171006</td>
 +
                                        <td>BD(336)</td>
 +
                                        <td>BD(336)</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>nuclease-free water(μL)</td>
 +
                                        <td>15.6</td>
 +
                                        <td>9</td>
 +
                                        <td>13.6</td>
 +
                                        <td>13.6</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>10* Fast Digest Buffer(μL)</td>
 +
                                        <td>2</td>
 +
                                        <td>2</td>
 +
                                        <td>2</td>
 +
                                        <td>2</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>plasmid(μL)</td>
 +
                                        <td>1</td>
 +
                                        <td>7.6</td>
 +
                                        <td>3</td>
 +
                                        <td>3</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>EcoRI(μL)</td>
 +
                                        <td>1</td>
 +
                                        <td>1</td>
 +
                                        <td>1</td>
 +
                                        <td>1</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                      <tr>
 +
                                        <td>PstI(μL)</td>
 +
                                        <td>0.4</td>
 +
                                        <td>0.4</td>
 +
                                        <td>0.4</td>
 +
                                        <td>0.4</td>
 +
                                      </tr>
 +
                                    </tbody>
 +
                                    <table class="ui celled small table">
 +
                                      <p>20 μL in total.
 +
                                      Mix gently and incubate at 37 degree Celsius  for 15 min.</p>
 +
                                      <p>result:
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6b/T--USTC--NB_0817_4.jpeg" alt="a" />
 +
                                      (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YewGAP08171001,D8181001,YewGAP08171006,D8181006,BD(363),BDD8181001,BDD8181002.)</p>
 +
                                      <p><strong>Plasmid Extraction for YeLGAP LYH</strong>
 +
                                      <strong>Recorder: Dong Yan</strong></p>
 +
                                      <table class="ui celled small table">
 +
                                        <thead>
 +
                                          <tr>
 +
                                            <th>Number</th>
 +
                                            <th>1</th>
 +
                                            <th>2</th>
 +
                                            <th>3</th>
 +
                                            <th>4</th>
 +
                                          </tr>
 +
                                        </thead>
 +
                                        <tbody>
 +
                                          <tr>
 +
                                            <td>A260/A280</td>
 +
                                            <td>1.84</td>
 +
                                            <td>1.87</td>
 +
                                            <td>1.91</td>
 +
                                            <td>1.87</td>
 +
                                          </tr>
 +
                                          <tr>
 +
                                            <td>A260/230</td>
 +
                                            <td>2.30</td>
 +
                                            <td>2.34</td>
 +
                                            <td>2.40</td>
 +
                                            <td>2.28</td>
 +
                                          </tr>
 +
                                          <tr>
 +
                                            <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                            <td>634.4</td>
 +
                                            <td>459.6</td>
 +
                                            <td>806.8</td>
 +
                                            <td>387.5</td>
 +
                                          </tr>
 +
                                        </tbody>
 +
                                        <table class="ui celled small table">
 +
                                          <p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
 +
                                          <strong>Gel Extraction of double digestion product of YeWGAP and BD</strong></p>
 +
                                          <table class="ui celled small table">
 +
                                            <thead>
 +
                                              <tr>
 +
                                                <th>sample</th>
 +
                                                <th>YeWGAPD8181001</th>
 +
                                                <th>BDD8181001</th>
 +
                                              </tr>
 +
                                            </thead>
 +
                                            <tbody>
 +
                                              <tr>
 +
                                                <td>A260/A280</td>
 +
                                                <td>1.68</td>
 +
                                                <td>1.84</td>
 +
                                              </tr>
 +
                                              <tr>
 +
                                                <td>A260/A230</td>
 +
                                                <td>0.2</td>
 +
                                                <td>0.15</td>
 +
                                              </tr>
 +
                                              <tr>
 +
                                                <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                <td>19.8</td>
 +
                                                <td>21.4</td>
 +
                                              </tr>
 +
                                              <tr>
 +
                                                <td>volume(μL)</td>
 +
                                                <td>50</td>
 +
                                                <td>25</td>
 +
                                              </tr>
 +
                                            </tbody>
 +
                                            <table class="ui celled small table">
 +
                                              <p><strong>PCR of AD, BD and sup35</strong>
 +
                                              <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                              <table class="ui celled small table">
 +
                                                <thead>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <th>sample</th>
 +
                                                    <th>AD</th>
 +
                                                    <th>BD</th>
 +
                                                    <th>sup35</th>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                </thead>
 +
                                                <tbody>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>nuclease-free water(μL)</td>
 +
                                                    <td>22</td>
 +
                                                    <td>22</td>
 +
                                                    <td>32.5</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>2×HiFi-PCR Master(μL)</td>
 +
                                                    <td>25</td>
 +
                                                    <td>25</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>template(μL)</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>5×PrimeStar Buffer(μL)</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>10</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>dNTP(μL)</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>4</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>PrimeStar</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>0</td>
 +
                                                    <td>0.5</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>Biobrick Primer-r</td>
 +
                                                    <td>2</td>
 +
                                                    <td>2</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                  <tr>
 +
                                                    <td>Biobrick Primer-p</td>
 +
                                                    <td>2</td>
 +
                                                    <td>2</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                  </tr>
 +
                                                </tbody>
 +
                                                <table class="ui celled small table">
 +
                                                  <p><strong>Purification for the product of the PCR</strong>
 +
                                                  <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                                  <p>results</p>
 +
                                                  <table class="ui celled small table">
 +
                                                    <thead>
 +
                                                      <tr>
 +
                                                        <th>Number</th>
 +
                                                        <th>AD1</th>
 +
                                                        <th>AD2</th>
 +
                                                        <th>BD1</th>
 +
                                                        <th>BD2</th>
 +
                                                        <th>sup35-1</th>
 +
                                                        <th>sup35-2</th>
 +
                                                        <th>sup35-3</th>
 +
                                                        <th>sup35-4</th>
 +
                                                      </tr>
 +
                                                    </thead>
 +
                                                    <tbody>
 +
                                                      <tr>
 +
                                                        <td>A260/A280</td>
 +
                                                        <td>1.83</td>
 +
                                                        <td>1.83</td>
 +
                                                        <td>1.85</td>
 +
                                                        <td>1.86</td>
 +
                                                        <td>1.80</td>
 +
                                                        <td>1.72</td>
 +
                                                        <td>1.84</td>
 +
                                                        <td>1.78</td>
 +
                                                      </tr>
 +
                                                      <tr>
 +
                                                        <td>A260/A230</td>
 +
                                                        <td>1.83</td>
 +
                                                        <td>2.20</td>
 +
                                                        <td>2.10</td>
 +
                                                        <td>2.18</td>
 +
                                                        <td>1.05</td>
 +
                                                        <td>0.85</td>
 +
                                                        <td>1.08</td>
 +
                                                        <td>1.27</td>
 +
                                                      </tr>
 +
                                                      <tr>
 +
                                                        <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                        <td>212.3</td>
 +
                                                        <td>200.6</td>
 +
                                                        <td>186.0</td>
 +
                                                        <td>230.9</td>
 +
                                                        <td>12.3</td>
 +
                                                        <td>21.2</td>
 +
                                                        <td>21.5</td>
 +
                                                        <td>20.9</td>
 +
                                                      </tr>
 +
                                                    </tbody>
 +
                                                    <table class="ui celled small table">
 +
                                                      <p><strong>Ligation of YeWGAP and BD</strong>
 +
                                                      **Recorder: Chenyang Li **</p>
 +
                                                      <p>Procedure:
 +
                                                        5 μL  YeWGAP
 +
                                                        2 μL  BD
 +
                                                        0.2 μL T4 DNA ligase
 +
                                                        2 μL  10×T4 DNA Ligase Buffer
 +
                                                        10.8 μL ddH<sub>2</sub>O
 +
                                                        20 μL in total.
 +
                                                        Mix gently and incubate at 22 degree Celsius for an hour.
 +
                                                      The number of the product: YBL8181001</p>
 +
                                                      <p><strong>Plasmid Extraction for YeWGAP</strong>
 +
                                                      <strong>Recorder: Junjie Zeng and Chenyang Li</strong></p>
 +
                                                      <p>Sample:bacteria containing recombinant plasmid YeWGAP</p>
 +
                                                      <table class="ui celled small table">
 +
                                                        <thead>
 +
                                                          <tr>
 +
                                                            <th>Number</th>
 +
                                                            <th>YeWGAP08181007</th>
 +
                                                            <th>YeWGAP08181008</th>
 +
                                                            <th>YeWGAP08181009</th>
 +
                                                            <th>YeWGAP08181010</th>
 +
                                                          </tr>
 +
                                                        </thead>
 +
                                                        <tbody>
 +
                                                          <tr>
 +
                                                            <td>A260/A280</td>
 +
                                                            <td>1.81</td>
 +
                                                            <td>1.86</td>
 +
                                                            <td>1.86</td>
 +
                                                            <td>1.85</td>
 +
                                                          </tr>
 +
                                                          <tr>
 +
                                                            <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                            <td>740.5</td>
 +
                                                            <td>841.2</td>
 +
                                                            <td>725.0</td>
 +
                                                            <td>695.9</td>
 +
                                                          </tr>
 +
                                                        </tbody>
 +
                                                        <table class="ui celled small table">
 +
                                                          <p><strong>DATE:8.19</strong></p>
 +
                                                          <p>**Recorder:Chenyang Li **
 +
                                                          <strong>Double Digestion of YeWGAP,BD</strong></p>
 +
                                                          <p>Procedure:</p>
 +
                                                          <table class="ui celled small table">
 +
                                                            <thead>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <th>number</th>
 +
                                                                <th>1</th>
 +
                                                                <th>2</th>
 +
                                                                <th>3</th>
 +
                                                                <th>4</th>
 +
                                                                <th>5</th>
 +
                                                                <th>6</th>
 +
                                                                <th>7</th>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                            </thead>
 +
                                                            <tbody>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>sample</td>
 +
                                                                <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                                                <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                                                <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                                                <td>YeWGAP08171001</td>
 +
                                                                <td>BD(336)</td>
 +
                                                                <td>BD(336)</td>
 +
                                                                <td>BD(230.9)</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>nuclease-free water(μL)</td>
 +
                                                                <td>11</td>
 +
                                                                <td>11</td>
 +
                                                                <td>11</td>
 +
                                                                <td>11</td>
 +
                                                                <td>12</td>
 +
                                                                <td>14.5</td>
 +
                                                                <td>6.4</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>10* Fast Digest Buffer(μL)</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                                <td>2</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>plasmid(μL)</td>
 +
                                                                <td>5</td>
 +
                                                                <td>5</td>
 +
                                                                <td>5</td>
 +
                                                                <td>5</td>
 +
                                                                <td>5</td>
 +
                                                                <td>3</td>
 +
                                                                <td>10</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>EcoRI(μL)</td>
 +
                                                                <td>1.5</td>
 +
                                                                <td>1.5</td>
 +
                                                                <td>1.5</td>
 +
                                                                <td>1.5</td>
 +
                                                                <td>0.7</td>
 +
                                                                <td>0.3</td>
 +
                                                                <td>1.2</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                              <tr>
 +
                                                                <td>PstI(μL)</td>
 +
                                                                <td>0.5</td>
 +
                                                                <td>0.5</td>
 +
                                                                <td>0.5</td>
 +
                                                                <td>0.5</td>
 +
                                                                <td>0.3</td>
 +
                                                                <td>0.2</td>
 +
                                                                <td>0.4</td>
 +
                                                              </tr>
 +
                                                            </tbody>
 +
                                                            <table class="ui celled small table">
 +
                                                              <p>20 μL in total.
 +
                                                                Mix 1,2,3,4,5,6 gently and incubate at 37 degree Celsius  for 45 min.
 +
                                                              Mix 7 gently and incubate at 37 degree Celsius  for 30 min.</p>
 +
                                                              <p>result:
 +
                                                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/db/T--USTC--NB_0817_5.jpeg" alt="a" />
 +
                                                              (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YewGAP08171004,1,2,3,4,5,6,7.)</p>
 +
                                                              <p><strong>Plasmid Extraction for YeWGAP</strong>
 +
                                                              <strong>Recorder: Junjie Zeng and Chenyang Li</strong></p>
 +
                                                              <p>Sample:bacteria containing recombinant plasmid YeWGAP</p>
 +
                                                              <table class="ui celled small table">
 +
                                                                <thead>
 +
                                                                  <tr>
 +
                                                                    <th>Number</th>
 +
                                                                    <th>YeWGAP08181011</th>
 +
                                                                    <th>YeWGAP08181012</th>
 +
                                                                    <th>YeWGAP08181013</th>
 +
                                                                    <th>YeWGAP08181014</th>
 +
                                                                  </tr>
 +
                                                                </thead>
 +
                                                                <tbody>
 +
                                                                  <tr>
 +
                                                                    <td>A260/A280</td>
 +
                                                                    <td>1.89</td>
 +
                                                                    <td>1.87</td>
 +
                                                                    <td>1.88</td>
 +
                                                                    <td>1.89</td>
 +
                                                                  </tr>
 +
                                                                  <tr>
 +
                                                                    <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                                    <td>818.6</td>
 +
                                                                    <td>416.9</td>
 +
                                                                    <td>807.4</td>
 +
                                                                    <td>900.6</td>
 +
                                                                  </tr>
 +
                                                                </tbody>
 +
                                                                <table class="ui celled small table">
 +
                                                                  <p><strong>Plasmid Extraction for YeLGAP</strong>
 +
                                                                  <strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong></p>
 +
                                                                  <p>Sample:bacteria containing plasmid YeLGAP</p>
 +
                                                                  <table class="ui celled small table">
 +
                                                                    <thead>
 +
                                                                      <tr>
 +
                                                                        <th>Number</th>
 +
                                                                        <th>1</th>
 +
                                                                        <th>2</th>
 +
                                                                        <th>3</th>
 +
                                                                        <th>4</th>
 +
                                                                        <th>5</th>
 +
                                                                        <th>6</th>
 +
                                                                        <th>7</th>
 +
                                                                        <th>8</th>
 +
                                                                      </tr>
 +
                                                                    </thead>
 +
                                                                    <tbody>
 +
                                                                      <tr>
 +
                                                                        <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                                        <td>128.1</td>
 +
                                                                        <td>228.7</td>
 +
                                                                        <td>60.5</td>
 +
                                                                        <td>67.0</td>
 +
                                                                        <td>398.3</td>
 +
                                                                        <td>291.6</td>
 +
                                                                        <td>80.8</td>
 +
                                                                        <td>101.1</td>
 +
                                                                      </tr>
 +
                                                                      <tr>
 +
                                                                        <td>A260/A280</td>
 +
                                                                        <td>1.83</td>
 +
                                                                        <td>1.73</td>
 +
                                                                        <td>1.93</td>
 +
                                                                        <td>1.93</td>
 +
                                                                        <td>1.86</td>
 +
                                                                        <td>1.82</td>
 +
                                                                        <td>1.90</td>
 +
                                                                        <td>1.86</td>
 +
                                                                      </tr>
 +
                                                                      <tr>
 +
                                                                        <td>A260/230</td>
 +
                                                                        <td>2.00</td>
 +
                                                                        <td>1.12</td>
 +
                                                                        <td>2.75</td>
 +
                                                                        <td>2.69</td>
 +
                                                                        <td>2.39</td>
 +
                                                                        <td>1.84</td>
 +
                                                                        <td>2.48</td>
 +
                                                                        <td>1.99</td>
 +
                                                                      </tr>
 +
                                                                    </tbody>
 +
                                                                    <table class="ui celled small table">
 +
                                                                      <p><strong>Recorder:Weijie Jin and Chenyang Li</strong>
 +
                                                                      <strong>Gel Extraction of double digestion product of YeWGAP and BD</strong></p>
 +
                                                                      <table class="ui celled small table">
 +
                                                                        <thead>
 +
                                                                          <tr>
 +
                                                                            <th>sample</th>
 +
                                                                            <th>YeWGAPD8191002</th>
 +
                                                                            <th>BDD8191002</th>
 +
                                                                          </tr>
 +
                                                                        </thead>
 +
                                                                        <tbody>
 +
                                                                          <tr>
 +
                                                                            <td>A260/A280</td>
 +
                                                                            <td>1.86</td>
 +
                                                                            <td>1.93</td>
 +
                                                                          </tr>
 +
                                                                          <tr>
 +
                                                                            <td>A260/A230</td>
 +
                                                                            <td>0.72</td>
 +
                                                                            <td>0.14</td>
 +
                                                                          </tr>
 +
                                                                          <tr>
 +
                                                                            <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                                            <td>315.1</td>
 +
                                                                            <td>52.5</td>
 +
                                                                          </tr>
 +
                                                                        </tbody>
 +
                                                                        <table class="ui celled small table">
 +
                                                                          <p><strong>Plasmid Extraction for SBAD-2 4 5</strong>
 +
                                                                          <strong>Recorder: Dong Yan</strong></p>
 +
                                                                          <table class="ui celled small table">
 +
                                                                            <thead>
 +
                                                                              <tr>
 +
                                                                                <th>Number</th>
 +
                                                                                <th>-2-1</th>
 +
                                                                                <th>-2-2</th>
 +
                                                                                <th>-2-3</th>
 +
                                                                                <th>-4-1</th>
 +
                                                                                <th>-4-2</th>
 +
                                                                                <th>-4-3</th>
 +
                                                                                <th>-5-1</th>
 +
                                                                                <th>-5-2</th>
 +
                                                                                <th>-5-3</th>
 +
                                                                              </tr>
 +
                                                                            </thead>
 +
                                                                            <tbody>
 +
                                                                              <tr>
 +
                                                                                <td>A260/A280</td>
 +
                                                                                <td>1.89</td>
 +
                                                                                <td>1.90</td>
 +
                                                                                <td>1.86</td>
 +
                                                                                <td>1.83</td>
 +
                                                                                <td>1.81</td>
 +
                                                                                <td>1.92</td>
 +
                                                                                <td>1.89</td>
 +
                                                                                <td>1.93</td>
 +
                                                                                <td>1.82</td>
 +
                                                                              </tr>
 +
                                                                              <tr>
 +
                                                                                <td>A260/230</td>
 +
                                                                                <td>2.29</td>
 +
                                                                                <td>2.19</td>
 +
                                                                                <td>1.56</td>
 +
                                                                                <td>1.56</td>
 +
                                                                                <td>1.88</td>
 +
                                                                                <td>2.18</td>
 +
                                                                                <td>1.71</td>
 +
                                                                                <td>2.20</td>
 +
                                                                                <td>1.33</td>
 +
                                                                              </tr>
 +
                                                                              <tr>
 +
                                                                                <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                                                <td>77.3</td>
 +
                                                                                <td>72.4</td>
 +
                                                                                <td>61.7</td>
 +
                                                                                <td>120.5</td>
 +
                                                                                <td>77.4</td>
 +
                                                                                <td>57.6</td>
 +
                                                                                <td>81.7</td>
 +
                                                                                <td>79.7</td>
 +
                                                                                <td>68.4</td>
 +
                                                                              </tr>
 +
                                                                            </tbody>
 +
                                                                            <table class="ui celled small table">
 +
                                                                              <p>The absorption peaks are normal, so the poor concentration may due to lack of bacteria growing time.</p>
 +
                                                                              <p><strong>Double digestion of PSB1C3</strong>
 +
                                                                              <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                                                              <p>6μL  PSB1C3
 +
                                                                                1μL  EcoRI
 +
                                                                                0.35μL PstI
 +
                                                                                2μL  10×Fast Digest Buffer
 +
                                                                                13.65μL  ddH<sub>2</sub>O
 +
                                                                              20μL in total.</p>
 +
                                                                              <p>result:
 +
                                                                              <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/0/04/T--USTC--NB_0817_6.jpeg" alt="0802" /></p>
 +
                                                                              <p><strong>Gel Extraction of double digestion product of PSB1C3</strong>
 +
                                                                              <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                                                              <table class="ui celled small table">
 +
                                                                                <thead>
 +
                                                                                  <tr>
 +
                                                                                    <th>sample</th>
 +
                                                                                    <th>PSB1C3:0802</th>
 +
                                                                                  </tr>
 +
                                                                                </thead>
 +
                                                                                <tbody>
 +
                                                                                  <tr>
 +
                                                                                    <td>A260/A280</td>
 +
                                                                                    <td>1.86</td>
 +
                                                                                  </tr>
 +
                                                                                  <tr>
 +
                                                                                    <td>A260/A230</td>
 +
                                                                                    <td>1.28</td>
 +
                                                                                  </tr>
 +
                                                                                  <tr>
 +
                                                                                    <td>concentration(ng/μL)</td>
 +
                                                                                    <td>119.3</td>
 +
                                                                                  </tr>
 +
                                                                                </tbody>
 +
                                                                                </table >
 +
                                                                                  <p><strong>Ligase of PSB1C3 and BD</strong>
 +
                                                                                  <strong>Recorder: Yinchenguang Lyu</strong></p>
 +
                                                                                  <p>1μL PSB1C3
 +
                                                                                    4μL BD
 +
                                                                                    2μL 10×T4 DNA Ligase Buffer
 +
                                                                                    0.4μL  T4 DNA Ligase
 +
                                                                                  12.6μL ddH<sub>2</sub>O</p>
 +
                                                                                </div>
 +
                                                                                </div><!--End of ui basic segment id="main_page_content"-->
 +
                                                                               
 +
                                                                                <div style="background-color:#44a17d; color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">
 +
                                                                                  <div class="ui grid">
 +
                                                                                   
 +
                                                                                    <div class="ui three wide column">
 +
                                                                                    </div>
 +
                                                                                    <div class="ui five wide column">
 +
                                                                                      <h3 class="ui header" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Contact us</h3>
 +
                                                                                      <div class="ui massive link list" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">
 +
                                                                                        <a class="item" href="mailto:yukae@mail.ustc.edu.cn">
 +
                                                                                          <i class="mail icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
 +
                                                                                          <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">e-mail</div>
 +
                                                                                        </a>
 +
                                                                                        <a class="item" href="https://www.facebook.com/ustcigem">
 +
                                                                                          <i class="facebook icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
 +
                                                                                          <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Facebook</div>
 +
                                                                                        </a>
 +
                                                                                        <a class="item" href="http://weibo.com/3929719655/fans?topnav=1&amp;wvr=6&amp;mod=message&amp;need_filter=1">
 +
                                                                                          <i class="weibo icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
 +
                                                                                          <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Weibo</div>
 +
                                                                                        </a>
 +
                                                                                      </div>
 +
                                                                                    </div>
 +
                                                                                    <div class="ui two wide column">
 +
                                                                                    </div>
 +
                                                                                    <div class="ui five wide column">
 +
                                                                                      <h3 class="ui header" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Sponsors</h3>
 +
                                                                                      <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/cc/T--USTC--DeutscheBank.png">
 +
                                                                                      <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/1/18/T--USTC--USTCXiaohui.png">
 +
                                                                                      <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/4/45/T--USTC--USTCJiaowuchu.png">
 +
                                                                                    </div>
 +
                                                                                   
 +
                                                                                  </div>
 +
                                                                                  <div class="ui divider"></div>
 +
                                                                                  <div class="center aligned container">
 +
                                                                                    <img class="ui centered tiny image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6b/T--USTC--MascotLogo.png">
 +
                                                                                    <div class="ui list">
 +
                                                                                      <div class="item">Designed by 2016 iGEM Team:USTC<br>Under CC License<br>Based on Semantic-UI</div>
 +
                                                                                    </div>
 +
                                                                                  </div>
 +
                                                                                 
 +
                                                                                </div>
 +
                                                                                </div><!--end of pusher-->
 +
                                                                                <script src="https://2015.igem.org/common/MathJax-2.5-latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"></script>
 +
                                                                                <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/semanticsjs?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
                                                                                <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/Notebook_right_menu_js?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
                                                                                <script type="text/javascript">
 +
                                                                                </script>
 +
                                                                                <script>
 +
                                                                                $(document).ready(function(){
 +
                                                                                $('.ui.sticky.basic.menu').sticky({
 +
                                                                                context: '#main_page_content'
 +
                                                                                });
 +
                                                                                $("a.item#Description").mouseenter(function(){
 +
                                                                                $(".sticky.note.outline.icon").transition({
 +
                                                                                animation : 'fly right',
 +
                                                                                duration : '0.5s'
 +
                                                                                });
 +
                                                                                });
 +
                                                                                $("a.item#Description").mouseleave(function(){
 +
                                                                                $(".sticky.note.outline.icon").transition({
 +
                                                                                animation : 'fly right',
 +
                                                                                duration : '0.5s'
 +
                                                                                });
 +
                                                                                //$(this).css({"background-color":"inherit","color":"inherit"});
 +
                                                                                });
 +
                                                                                $container.find('img').css('max-width','100%');
 +
                                                                                createMenu();
 +
                                                                                });//End of $(document).ready(function())
 +
                                                                               
 +
                                                                                $(window).load(function(){
 +
                                                                                createWayPoints();
 +
                                                                                $("div.pusher").prependTo("body");
 +
                                                                                $("div.sidebar").prependTo("body");
 +
                                                                                $("div#sideMenu").prependTo("div.pusher");
 +
                                                                                $("#ui_article").find("span").css("border-style","none");
 +
                                                                                });
 +
                                                                                $("#sidebarMenuTrigger").click(function(){
 +
                                                                                $(".ui.sidebar.menu")
 +
                                                                                .sidebar('setting', 'transition', 'overlay')
 +
                                                                                .sidebar('setting', 'mobileTransition', 'overlay')
 +
                                                                                .sidebar('toggle');
 +
                                                                                });
 +
                                                                                </script>
 +
                                                                              </body>
 +
                                                                            </html>

Latest revision as of 18:21, 19 October 2016

Modeling

Notebook
Together we stand

Performers

Everybody

Plasmid Extraction for sg11 Recorder: Dong Yan & Kaiyue Ma

Sample:bacteria containing recombinant plasmid pYeT containing sg11

Number 1 2 3 4 5 6 7 8
A260/A280 1.89 1.86 1.76 1.88 1.87 1.81 1.86 1.88
A260/230 2.27 2.02 1.23 2.12 2.23 1.45 1.82 2.25
concentration(ng/μL) 159.3 113.5 265.7 46.8 130.5 189.3 59.7 169.3

Double digestion of AD, BD and YeUGAP Recorder: Yinchenguang Lyu

Reaction system:

AD & BD: 4 μL template 1.35 μL EcoRI 2 μL PstI 2 μL 10× FastDigest Buffer 10.65 Sterilized ddH2O

YeUGAP: 5 μL template 1 μL EcoRI 0.35 μL PstI 2 μL 10× FastDigest Buffer 11.65 Sterilized ddH2O

0801

Gel Extraction for the product of the double digestion Recorder: Yinchenguang Lyu

sample AD BD YeUGAP
A260/A280 1.89 1.84 1.86
A260/230 0.48 0.85 0.79
concentration(ng/μL) 13.1 25.1 33.9

Recorder: Chenyang Li Plasmid Extraction for YeWGAP

sample 08171001 08171002 08171003 08171004 08171005 08171006
A260/280 1.89 1.83 1.80 1.70 2.88 1.89
A260/230 2.36 1.83 1.47 0.99 2.07 2.14
concentration(ng/μL) 916.3 359.3 300.5 193.6 53.6 132.2

Ligation of YeUGAP and AD Recorder: Yinchenguang Lyu

3 μL YeUGAP 3 μL AD 0.4 μL T4 DNA ligase 2 μL 10×T4 DNA Ligase Buffer 11.6 μL ddH2O 20 μL in total.

Double digestion of AD,BD and PYU Recorder:Chengle Zhang

图片名称

Sample AD(0230) BD(0231) PYU(0232)
A260/A280 1.97 1.83 1.89
A260/A280 0.12 0.41 0.75
concentration(ng/μL) 24.8 62.5 105.4

Plasmid Extraction for sfGFP1-10 Recorder: Xuefeng Meng

Sample:bacteria containing recombinant plasmid pYeT containing sfGFP1-10

Number 1 2 3 4
A260/A280 1.93 1.89 1.92 1.93
A260/230 2.04 1.46 1.38 2.04
concentration(ng/μL) 43.2 19.7 49.3 20.8

**Recorder:Chenyang Li ** Double Digestion of YeWGAP, ADU, BDW

Procedure:

number YeWGAP18171001 YeWGAP18171002 YeWGAP18171003 YeWGAP18171004 ADU1001 ADU1002 BDW1003 BDW1004
sample YeWGAP08171001 YeWGAP08171002 YeWGAP08171003 YeWGAP08171004 ADU1 ADU2 BDW3 BDW4
nuclease-free water(μL) 8.4 76 7.3 5.4 0 4 0 0
10*Green Buffer(μL) 1 1 1 1 1 1 1 1
plasmid(μL) 0.6 1.4 1.7 2.6 8 4 8 8
EcoRI(μL) 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75
PstI(μL) 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25

Mix gently and incubate at 37 degree Celsius for 15 min.

result: a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),08171001,18171001,18171002,08171003,18171003,18171004,
ADU1,ADU1001,ADU2,ADU1002,BDW3,BDW1003,BDW4,BDW1004.)

Ligation of pSB1C3 and AD Recorder: Yinchenguang Lyu

4 μL pSB1C3 2.8 μL AD 0.4 μL T4 DNA ligase 2 μL 10×T4 DNA Ligase Buffer 10.8 μL ddH2O 20 μL in total.

DATE:8.18

**Recorder:Chenyang Li ** Double Digestion of YeWGAP,BD

Procedure:

number YeWGAPD8181001 YeWGAPD8181006 BDD8181001 BDD8181002
sample YeWGAP08171001 YeWGAP08171006 BD(336) BD(336)
nuclease-free water(μL) 15.6 9 13.6 13.6
10* Fast Digest Buffer(μL) 2 2 2 2
plasmid(μL) 1 7.6 3 3
EcoRI(μL) 1 1 1 1
PstI(μL) 0.4 0.4 0.4 0.4

20 μL in total. Mix gently and incubate at 37 degree Celsius for 15 min.

result: a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YewGAP08171001,D8181001,YewGAP08171006,D8181006,BD(363),BDD8181001,BDD8181002.)

Plasmid Extraction for YeLGAP LYH Recorder: Dong Yan

Number 1 2 3 4
A260/A280 1.84 1.87 1.91 1.87
A260/230 2.30 2.34 2.40 2.28
concentration(ng/μL) 634.4 459.6 806.8 387.5

Recorder: Chenyang Li Gel Extraction of double digestion product of YeWGAP and BD

sample YeWGAPD8181001 BDD8181001
A260/A280 1.68 1.84
A260/A230 0.2 0.15
concentration(ng/μL) 19.8 21.4
volume(μL) 50 25

PCR of AD, BD and sup35 Recorder: Yinchenguang Lyu

sample AD BD sup35
nuclease-free water(μL) 22 22 32.5
2×HiFi-PCR Master(μL) 25 25 0
template(μL) 1 1 1
5×PrimeStar Buffer(μL) 0 0 10
dNTP(μL) 0 0 4
PrimeStar 0 0 0.5
Biobrick Primer-r 2 2 1
Biobrick Primer-p 2 2 1

Purification for the product of the PCR Recorder: Yinchenguang Lyu

results

Number AD1 AD2 BD1 BD2 sup35-1 sup35-2 sup35-3 sup35-4
A260/A280 1.83 1.83 1.85 1.86 1.80 1.72 1.84 1.78
A260/A230 1.83 2.20 2.10 2.18 1.05 0.85 1.08 1.27
concentration(ng/μL) 212.3 200.6 186.0 230.9 12.3 21.2 21.5 20.9

Ligation of YeWGAP and BD **Recorder: Chenyang Li **

Procedure: 5 μL YeWGAP 2 μL BD 0.2 μL T4 DNA ligase 2 μL 10×T4 DNA Ligase Buffer 10.8 μL ddH2O 20 μL in total. Mix gently and incubate at 22 degree Celsius for an hour. The number of the product: YBL8181001

Plasmid Extraction for YeWGAP Recorder: Junjie Zeng and Chenyang Li

Sample:bacteria containing recombinant plasmid YeWGAP

Number YeWGAP08181007 YeWGAP08181008 YeWGAP08181009 YeWGAP08181010
A260/A280 1.81 1.86 1.86 1.85
concentration(ng/μL) 740.5 841.2 725.0 695.9

DATE:8.19

**Recorder:Chenyang Li ** Double Digestion of YeWGAP,BD

Procedure:

number 1 2 3 4 5 6 7
sample YeWGAP08171001 YeWGAP08171001 YeWGAP08171001 YeWGAP08171001 BD(336) BD(336) BD(230.9)
nuclease-free water(μL) 11 11 11 11 12 14.5 6.4
10* Fast Digest Buffer(μL) 2 2 2 2 2 2 2
plasmid(μL) 5 5 5 5 5 3 10
EcoRI(μL) 1.5 1.5 1.5 1.5 0.7 0.3 1.2
PstI(μL) 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.2 0.4

20 μL in total. Mix 1,2,3,4,5,6 gently and incubate at 37 degree Celsius for 45 min. Mix 7 gently and incubate at 37 degree Celsius for 30 min.

result: a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YewGAP08171004,1,2,3,4,5,6,7.)

Plasmid Extraction for YeWGAP Recorder: Junjie Zeng and Chenyang Li

Sample:bacteria containing recombinant plasmid YeWGAP

Number YeWGAP08181011 YeWGAP08181012 YeWGAP08181013 YeWGAP08181014
A260/A280 1.89 1.87 1.88 1.89
concentration(ng/μL) 818.6 416.9 807.4 900.6

Plasmid Extraction for YeLGAP Recorder: Xuefeng Meng

Sample:bacteria containing plasmid YeLGAP

Number 1 2 3 4 5 6 7 8
concentration(ng/μL) 128.1 228.7 60.5 67.0 398.3 291.6 80.8 101.1
A260/A280 1.83 1.73 1.93 1.93 1.86 1.82 1.90 1.86
A260/230 2.00 1.12 2.75 2.69 2.39 1.84 2.48 1.99

Recorder:Weijie Jin and Chenyang Li Gel Extraction of double digestion product of YeWGAP and BD

sample YeWGAPD8191002 BDD8191002
A260/A280 1.86 1.93
A260/A230 0.72 0.14
concentration(ng/μL) 315.1 52.5

Plasmid Extraction for SBAD-2 4 5 Recorder: Dong Yan

Number -2-1 -2-2 -2-3 -4-1 -4-2 -4-3 -5-1 -5-2 -5-3
A260/A280 1.89 1.90 1.86 1.83 1.81 1.92 1.89 1.93 1.82
A260/230 2.29 2.19 1.56 1.56 1.88 2.18 1.71 2.20 1.33
concentration(ng/μL) 77.3 72.4 61.7 120.5 77.4 57.6 81.7 79.7 68.4

The absorption peaks are normal, so the poor concentration may due to lack of bacteria growing time.

Double digestion of PSB1C3 Recorder: Yinchenguang Lyu

6μL PSB1C3 1μL EcoRI 0.35μL PstI 2μL 10×Fast Digest Buffer 13.65μL ddH2O 20μL in total.

result: 0802

Gel Extraction of double digestion product of PSB1C3 Recorder: Yinchenguang Lyu

sample PSB1C3:0802
A260/A280 1.86
A260/A230 1.28
concentration(ng/μL) 119.3

Ligase of PSB1C3 and BD Recorder: Yinchenguang Lyu

1μL PSB1C3 4μL BD 2μL 10×T4 DNA Ligase Buffer 0.4μL T4 DNA Ligase 12.6μL ddH2O

Sponsors

Designed by 2016 iGEM Team:USTC
Under CC License
Based on Semantic-UI