Difference between revisions of "Team:USTC/Notebook/8 24"

 
Line 154: Line 154:
 
         <div class="menu">
 
         <div class="menu">
 
           <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
 
           <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
+
          <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
 
         </div>
 
         </div>
 
       </div>
 
       </div>
Line 219: Line 219:
 
               <div class="menu">
 
               <div class="menu">
 
                 <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
 
                 <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team"> Members  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Sponsor"> Sponsor  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/AboutUSTC"> About USTC  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Acknowledgements"> Acknowledgements  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Team/Gallery"> Gallery  </a>
<a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
+
                <a class="item" href="https://2016.igem.org/Team:USTC/Collaborations"> Collaborations </a>
 
               </div>
 
               </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 260: Line 260:
 
            
 
            
 
            
 
            
<p><strong>DATE:8.24</strong></p>
+
          <p><strong>DATE:8.24</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
          <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Plasmid Extraction for sfGFP11</strong></p>
+
          <strong>Plasmid Extraction for sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
          <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>PCR of sup35</strong></p>
+
          <strong>PCR of sup35</strong></p>
<p>Procedure:</p>
+
          <p>Procedure:</p>
<p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
+
          <p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
<table class="ui celled small table">
+
          <table class="ui celled small table">
<thead>
+
            <thead>
<tr>
+
              <tr>
  <th>sample</th>
+
                <th>sample</th>
  <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
+
                <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
</tr>
+
              </tr>
</thead>
+
            </thead>
<tbody>
+
            <tbody>
<tr>
+
              <tr>
  <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
+
                <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
  <td>9 μL</td>
+
                <td>9 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
<tr>
+
              <tr>
  <td>2×HiFi-PCR Master</td>
+
                <td>2×HiFi-PCR Master</td>
  <td>12.5 μL</td>
+
                <td>12.5 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
<tr>
+
              <tr>
  <td>Template</td>
+
                <td>Template</td>
  <td>1.5 μL</td>
+
                <td>1.5 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
<tr>
+
              <tr>
  <td>Primer 1</td>
+
                <td>Primer 1</td>
  <td>1 μL</td>
+
                <td>1 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
<tr>
+
              <tr>
  <td>Primer 2</td>
+
                <td>Primer 2</td>
  <td>1 μL</td>
+
                <td>1 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
<tr>
+
              <tr>
  <td>total</td>
+
                <td>total</td>
  <td>25 μL</td>
+
                <td>25 μL</td>
</tr>
+
              </tr>
</tbody>
+
            </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
            <table class="ui celled small table">
<p>2.PCR reaction
+
              <p>2.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
              Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
              <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                <thead>
<tr>
+
                  <tr>
  <th>stage</th>
+
                    <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                    <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                    <th>time</th>
</tr>
+
                  </tr>
</thead>
+
                </thead>
<tbody>
+
                <tbody>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Pre-Duration</td>
+
                    <td>Pre-Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                    <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                    <td>10 min</td>
</tr>
+
                  </tr>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Duration</td>
+
                    <td>Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                    <td>95℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                    <td>1 min</td>
</tr>
+
                  </tr>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Anneal</td>
+
                    <td>Anneal</td>
  <td>58℃</td>
+
                    <td>58℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                    <td>1 min</td>
</tr>
+
                  </tr>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Extend</td>
+
                    <td>Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                    <td>72℃</td>
  <td>1 min 50 s</td>
+
                    <td>1 min 50 s</td>
</tr>
+
                  </tr>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Post-Extend</td>
+
                    <td>Post-Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                    <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                    <td>10 min</td>
</tr>
+
                  </tr>
<tr>
+
                  <tr>
  <td>Final</td>
+
                    <td>Final</td>
  <td>4℃</td>
+
                    <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                    <td>--</td>
</tr>
+
                  </tr>
</tbody>
+
                </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
+
                  <p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Double digestion of sup35</strong></p>
+
                  <strong>Double digestion of sup35</strong></p>
<p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
+
                  <p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
<strong>Ligation of sup35 and pUC57-sfGFP11</strong></p>
+
                  <strong>Ligation of sup35 and pUC57-sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11</strong></p>
+
                  <strong>Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>PCR of sup35</strong></p>
+
                  <strong>PCR of sup35</strong></p>
<p>Procedure:</p>
+
                  <p>Procedure:</p>
<p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
+
                  <p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                  <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                    <thead>
<tr>
+
                      <tr>
  <th>sample</th>
+
                        <th>sample</th>
  <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
+
                        <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
</tr>
+
                      </tr>
</thead>
+
                    </thead>
<tbody>
+
                    <tbody>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
+
                        <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
  <td>9 μL</td>
+
                        <td>9 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>2×HiFi-PCR Master</td>
+
                        <td>2×HiFi-PCR Master</td>
  <td>12.5 μL</td>
+
                        <td>12.5 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>Template</td>
+
                        <td>Template</td>
  <td>1.5 μL</td>
+
                        <td>1.5 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>Primer 1</td>
+
                        <td>Primer 1</td>
  <td>1 μL</td>
+
                        <td>1 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>Primer 2</td>
+
                        <td>Primer 2</td>
  <td>1 μL</td>
+
                        <td>1 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
<tr>
+
                      <tr>
  <td>total</td>
+
                        <td>total</td>
  <td>25 μL</td>
+
                        <td>25 μL</td>
</tr>
+
                      </tr>
</tbody>
+
                    </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                    <table class="ui celled small table">
<p>2.PCR reaction
+
                      <p>2.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
                      Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                      <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                        <thead>
<tr>
+
                          <tr>
  <th>stage</th>
+
                            <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                            <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                            <th>time</th>
</tr>
+
                          </tr>
</thead>
+
                        </thead>
<tbody>
+
                        <tbody>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Pre-Duration</td>
+
                            <td>Pre-Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                            <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                            <td>10 min</td>
</tr>
+
                          </tr>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Duration</td>
+
                            <td>Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                            <td>95℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                            <td>1 min</td>
</tr>
+
                          </tr>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Anneal</td>
+
                            <td>Anneal</td>
  <td>58℃</td>
+
                            <td>58℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                            <td>1 min</td>
</tr>
+
                          </tr>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Extend</td>
+
                            <td>Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                            <td>72℃</td>
  <td>1 min 50s</td>
+
                            <td>1 min 50s</td>
</tr>
+
                          </tr>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Post-Extend</td>
+
                            <td>Post-Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                            <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                            <td>10 min</td>
</tr>
+
                          </tr>
<tr>
+
                          <tr>
  <td>Final</td>
+
                            <td>Final</td>
  <td>4℃</td>
+
                            <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                            <td>--</td>
</tr>
+
                          </tr>
</tbody>
+
                        </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                        <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
+
                          <p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
<p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
+
                          <p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
<strong>Colony picking of sfGFP11</strong></p>
+
                          <strong>Colony picking of sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
+
                          <p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
<strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
+
                          <strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
<p><strong>Procedure:</strong></p>
+
                          <p><strong>Procedure:</strong></p>
<p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
+
                          <p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
4 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
+
                            4 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
6.5 μL 2XHiFi Pfu,
+
                            6.5 μL 2XHiFi Pfu,
0.5 μL primer F,
+
                            0.5 μL primer F,
0.5 μL primer R,
+
                            0.5 μL primer R,
1 μL DNA template.</p>
+
                          1 μL DNA template.</p>
<p>4.PCR reaction
+
                          <p>4.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
                          Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                          <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                            <thead>
<tr>
+
                              <tr>
  <th>stage</th>
+
                                <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                                <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                                <th>time</th>
</tr>
+
                              </tr>
</thead>
+
                            </thead>
<tbody>
+
                            <tbody>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 1</td>
+
                                <td>step 1</td>
  <td>95℃</td>
+
                                <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                <td>10 min</td>
</tr>
+
                              </tr>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 2</td>
+
                                <td>step 2</td>
  <td>95℃</td>
+
                                <td>95℃</td>
  <td>30 s</td>
+
                                <td>30 s</td>
</tr>
+
                              </tr>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 3</td>
+
                                <td>step 3</td>
  <td>58℃</td>
+
                                <td>58℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                <td>45 s</td>
</tr>
+
                              </tr>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 4</td>
+
                                <td>step 4</td>
  <td>72℃</td>
+
                                <td>72℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                <td>45 s</td>
</tr>
+
                              </tr>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 5</td>
+
                                <td>step 5</td>
  <td>72℃</td>
+
                                <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                <td>10 min</td>
</tr>
+
                              </tr>
<tr>
+
                              <tr>
  <td>step 6</td>
+
                                <td>step 6</td>
  <td>4℃</td>
+
                                <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                                <td>--</td>
</tr>
+
                              </tr>
</tbody>
+
                            </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                            <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
+
                              <p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
<p>results:</p>
+
                              <p>results:</p>
<p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/4/45/T--USTC--NB_0823_1.jpeg/750px-T--USTC--NB_0823_1.jpeg" alt="a" />
+
                              <p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/4/45/T--USTC--NB_0823_1.jpeg/750px-T--USTC--NB_0823_1.jpeg" alt="a" />
(from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred), 1, 2, 3, 4)
+
                                (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred), 1, 2, 3, 4)
</p>
+
                              </p>
<p><strong>Plasmid Extraction for ligased YeWGAP and BD</strong>
+
                              <p><strong>Plasmid Extraction for ligased YeWGAP and BD</strong>
<strong>Recorder: Chenyang Li</strong></p>
+
                              <strong>Recorder: Chenyang Li</strong></p>
<p><strong>results</strong></p>
+
                              <p><strong>results</strong></p>
<table class="ui celled small table">
+
                              <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                <thead>
<tr>
+
                                  <tr>
  <th>sample</th>
+
                                    <th>sample</th>
  <th>YBE8241001</th>
+
                                    <th>YBE8241001</th>
  <th>YBE8241002</th>
+
                                    <th>YBE8241002</th>
  <th>YBE8241003</th>
+
                                    <th>YBE8241003</th>
  <th>YBE8241004</th>
+
                                    <th>YBE8241004</th>
</tr>
+
                                  </tr>
</thead>
+
                                </thead>
<tbody>
+
                                <tbody>
<tr>
+
                                  <tr>
  <td>A260/A280</td>
+
                                    <td>A260/A280</td>
  <td>1.88</td>
+
                                    <td>1.88</td>
  <td>1.86</td>
+
                                    <td>1.86</td>
  <td>1.89</td>
+
                                    <td>1.89</td>
  <td>1.88</td>
+
                                    <td>1.88</td>
</tr>
+
                                  </tr>
<tr>
+
                                  <tr>
  <td>A260/A230</td>
+
                                    <td>A260/A230</td>
  <td>2.27</td>
+
                                    <td>2.27</td>
  <td>1.92</td>
+
                                    <td>1.92</td>
  <td>2.22</td>
+
                                    <td>2.22</td>
  <td>2.22</td>
+
                                    <td>2.22</td>
</tr>
+
                                  </tr>
<tr>
+
                                  <tr>
  <td>concentration(ng/μL)</td>
+
                                    <td>concentration(ng/μL)</td>
  <td>203.1</td>
+
                                    <td>203.1</td>
  <td>174.7</td>
+
                                    <td>174.7</td>
  <td>181.3</td>
+
                                    <td>181.3</td>
  <td>177.8</td>
+
                                    <td>177.8</td>
</tr>
+
                                  </tr>
</tbody>
+
                                </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                                <table class="ui celled small table">
<p><strong>DATE:8.24</strong>
+
                                  <p><strong>DATE:8.24</strong>
<strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
+
                                    <strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
<strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
+
                                  <strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
<p><strong>Procedure:</strong></p>
+
                                  <p><strong>Procedure:</strong></p>
<p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
+
                                  <p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
3 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
+
                                    3 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
5 μL 2XHiFi Pfu,
+
                                    5 μL 2XHiFi Pfu,
0.5 μL primer F,
+
                                    0.5 μL primer F,
0.5 μL primer R,
+
                                    0.5 μL primer R,
1 μL DNA template.</p>
+
                                  1 μL DNA template.</p>
<p>4.PCR reaction
+
                                  <p>4.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
                                  Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                                  <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                    <thead>
<tr>
+
                                      <tr>
  <th>stage</th>
+
                                        <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                                        <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                                        <th>time</th>
</tr>
+
                                      </tr>
</thead>
+
                                    </thead>
<tbody>
+
                                    <tbody>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 1</td>
+
                                        <td>step 1</td>
  <td>95℃</td>
+
                                        <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                        <td>10 min</td>
</tr>
+
                                      </tr>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 2</td>
+
                                        <td>step 2</td>
  <td>95℃</td>
+
                                        <td>95℃</td>
  <td>30 s</td>
+
                                        <td>30 s</td>
</tr>
+
                                      </tr>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 3</td>
+
                                        <td>step 3</td>
  <td>58℃</td>
+
                                        <td>58℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                        <td>45 s</td>
</tr>
+
                                      </tr>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 4</td>
+
                                        <td>step 4</td>
  <td>72℃</td>
+
                                        <td>72℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                        <td>45 s</td>
</tr>
+
                                      </tr>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 5</td>
+
                                        <td>step 5</td>
  <td>72℃</td>
+
                                        <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                        <td>10 min</td>
</tr>
+
                                      </tr>
<tr>
+
                                      <tr>
  <td>step 6</td>
+
                                        <td>step 6</td>
  <td>4℃</td>
+
                                        <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                                        <td>--</td>
</tr>
+
                                      </tr>
</tbody>
+
                                    </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                                    <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
+
                                      <p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
<p>results:</p>
+
                                      <p>results:</p>
<p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/5/54/T--USTC--NB_0820_2.jpeg/750px-T--USTC--NB_0820_2.jpeg" alt="a" />
+
                                      <p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/5/54/T--USTC--NB_0820_2.jpeg/750px-T--USTC--NB_0820_2.jpeg" alt="a" />
(from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,)
+
                                        (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,)
</p>
+
                                      </p>
<p><strong>DATE:8.25</strong></p>
+
                                      <p><strong>DATE:8.25</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                      <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Plasmid Extraction for sfGFP11</strong></p>
+
                                      <strong>Plasmid Extraction for sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                      <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11</strong></p>
+
                                      <strong>Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                      <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>PCR of sup35</strong></p>
+
                                      <strong>PCR of sup35</strong></p>
<p>Procedure:</p>
+
                                      <p>Procedure:</p>
<p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
+
                                      <p>1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                                      <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                        <thead>
<tr>
+
                                          <tr>
  <th>sample</th>
+
                                            <th>sample</th>
  <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
+
                                            <th>1,2,3,4,5,6,7,8</th>
</tr>
+
                                          </tr>
</thead>
+
                                        </thead>
<tbody>
+
                                        <tbody>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
+
                                            <td>Sterilized ddH<sub>2</sub>O</td>
  <td>9 μL</td>
+
                                            <td>9 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>2×HiFi-PCR Master</td>
+
                                            <td>2×HiFi-PCR Master</td>
  <td>12.5 μL</td>
+
                                            <td>12.5 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>Template</td>
+
                                            <td>Template</td>
  <td>1.5 μL</td>
+
                                            <td>1.5 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>Primer 1</td>
+
                                            <td>Primer 1</td>
  <td>1 μL</td>
+
                                            <td>1 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>Primer 2</td>
+
                                            <td>Primer 2</td>
  <td>1 μL</td>
+
                                            <td>1 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
<tr>
+
                                          <tr>
  <td>total</td>
+
                                            <td>total</td>
  <td>25 μL</td>
+
                                            <td>25 μL</td>
</tr>
+
                                          </tr>
</tbody>
+
                                        </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                                        <table class="ui celled small table">
<p>2.PCR reaction
+
                                          <p>2.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
                                          Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                                          <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                            <thead>
<tr>
+
                                              <tr>
  <th>stage</th>
+
                                                <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                                                <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                                                <th>time</th>
</tr>
+
                                              </tr>
</thead>
+
                                            </thead>
<tbody>
+
                                            <tbody>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Pre-Duration</td>
+
                                                <td>Pre-Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                                                <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                                <td>10 min</td>
</tr>
+
                                              </tr>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Duration</td>
+
                                                <td>Duration</td>
  <td>95℃</td>
+
                                                <td>95℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                                                <td>1 min</td>
</tr>
+
                                              </tr>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Anneal</td>
+
                                                <td>Anneal</td>
  <td>58℃</td>
+
                                                <td>58℃</td>
  <td>1 min</td>
+
                                                <td>1 min</td>
</tr>
+
                                              </tr>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Extend</td>
+
                                                <td>Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                                                <td>72℃</td>
  <td>1 min 50 s</td>
+
                                                <td>1 min 50 s</td>
</tr>
+
                                              </tr>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Post-Extend</td>
+
                                                <td>Post-Extend</td>
  <td>72℃</td>
+
                                                <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                                <td>10 min</td>
</tr>
+
                                              </tr>
<tr>
+
                                              <tr>
  <td>Final</td>
+
                                                <td>Final</td>
  <td>4℃</td>
+
                                                <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                                                <td>--</td>
</tr>
+
                                              </tr>
</tbody>
+
                                            </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                                            <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
+
                                              <p>30 cycles(Duration ~ Extend)</p>
<p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
+
                                              <p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
<strong>Colony picking of sup35-sfGFP11</strong></p>
+
                                              <strong>Colony picking of sup35-sfGFP11</strong></p>
<p><strong>Ligation of YeWGAP and BD</strong>
+
                                              <p><strong>Ligation of YeWGAP and BD</strong>
**Recorder: Chenyang Li **</p>
+
                                              **Recorder: Chenyang Li **</p>
<p>Procedure:
+
                                              <p>Procedure:
9 μL  YeWGAPD8201002
+
                                                9 μL  YeWGAPD8201002
3.3 μL  BDD8201002
+
                                                3.3 μL  BDD8201002
0.2 μL T4 DNA ligase
+
                                                0.2 μL T4 DNA ligase
2 μL  10×T4 DNA Ligase Buffer
+
                                                2 μL  10×T4 DNA Ligase Buffer
5.5 μL ddH<sub>2</sub>O
+
                                                5.5 μL ddH<sub>2</sub>O
20 μL in total.</p>
+
                                              20 μL in total.</p>
<p>Mix gently and incubate at 22 degree Celsius for an hour.</p>
+
                                              <p>Mix gently and incubate at 22 degree Celsius for an hour.</p>
<p>The number of the product: YBL8201005, YBL8201006, YBL8201007, YBL8201008, YBL8201009.</p>
+
                                              <p>The number of the product: YBL8201005, YBL8201006, YBL8201007, YBL8201008, YBL8201009.</p>
<p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
+
                                              <p><strong>Recorder: Chenyang Li</strong>
<strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
+
                                              <strong>PCR of pYeWGAP-BD</strong></p>
<p><strong>Procedure:</strong></p>
+
                                              <p><strong>Procedure:</strong></p>
<p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
+
                                              <p>3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add:
4 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
+
                                                4 μL Sterilized ddH<sub>2</sub>O,
5 μL 2XHiFi Pfu,
+
                                                5 μL 2XHiFi Pfu,
0.5 μL primer F,
+
                                                0.5 μL primer F,
0.5 μL primer R,
+
                                                0.5 μL primer R,
0.5 μL DNA template.</p>
+
                                              0.5 μL DNA template.</p>
<p>4.PCR reaction
+
                                              <p>4.PCR reaction
Parameters setting:</p>
+
                                              Parameters setting:</p>
<table class="ui celled small table">
+
                                              <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                                <thead>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <th>stage</th>
+
                                                    <th>stage</th>
  <th>temperature</th>
+
                                                    <th>temperature</th>
  <th>time</th>
+
                                                    <th>time</th>
</tr>
+
                                                  </tr>
</thead>
+
                                                </thead>
<tbody>
+
                                                <tbody>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 1</td>
+
                                                    <td>step 1</td>
  <td>95℃</td>
+
                                                    <td>95℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                                    <td>10 min</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 2</td>
+
                                                    <td>step 2</td>
  <td>95℃</td>
+
                                                    <td>95℃</td>
  <td>30 s</td>
+
                                                    <td>30 s</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 3</td>
+
                                                    <td>step 3</td>
  <td>58℃</td>
+
                                                    <td>58℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                                    <td>45 s</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 4</td>
+
                                                    <td>step 4</td>
  <td>72℃</td>
+
                                                    <td>72℃</td>
  <td>45 s</td>
+
                                                    <td>45 s</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 5</td>
+
                                                    <td>step 5</td>
  <td>72℃</td>
+
                                                    <td>72℃</td>
  <td>10 min</td>
+
                                                    <td>10 min</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
<tr>
+
                                                  <tr>
  <td>step 6</td>
+
                                                    <td>step 6</td>
  <td>4℃</td>
+
                                                    <td>4℃</td>
  <td>--</td>
+
                                                    <td>--</td>
</tr>
+
                                                  </tr>
</tbody>
+
                                                </tbody>
<table class="ui celled small table">
+
                                                <table class="ui celled small table">
<p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
+
                                                  <p>30 cycles(step 2 ~ step 4)</p>
<p>results:</p>
+
                                                  <p>results:</p>
<p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/6/65/T--USTC--NB_0820_3.jpeg/750px-T--USTC--NB_0820_3.jpeg" alt="a" />
+
                                                  <p><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/thumb/6/65/T--USTC--NB_0820_3.jpeg/750px-T--USTC--NB_0820_3.jpeg" alt="a" />
(from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,YeWGAP08171001,YeWGAPD8191002,BDD8191002,YBL8201005,Sterilized ddH<sub>2</sub>O)
+
                                                    (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,YeWGAP08171001,YeWGAPD8191002,BDD8191002,YBL8201005,Sterilized ddH<sub>2</sub>O)
</p>
+
                                                  </p>
<h2>Date: 8.26</h2>
+
                                                  <h2>Date: 8.26</h2>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>PCR of sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>PCR of sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Double Digestion of sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>Double Digestion of sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Double Digestion of pSB1C3</strong></p>
+
                                                  <strong>Double Digestion of pSB1C3</strong></p>
<h2>Date: 8.27</h2>
+
                                                  <h2>Date: 8.27</h2>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Ligation of pSB1C3 and sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>Ligation of pSB1C3 and sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Transformation of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>Transformation of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder:Yu Xie</strong>
<strong>Colony picking of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>Colony picking of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>PCR of sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>PCR of sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
+
                                                  <p><strong>Recorder: Yu Xie</strong>
<strong>Double Digestion of sfGFP1-10</strong></p>
+
                                                  <strong>Double Digestion of sfGFP1-10</strong></p>
<p><strong>Plasmid Extraction for plasmid C3BD35</strong>
+
                                                  <p><strong>Plasmid Extraction for plasmid C3BD35</strong>
<strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong></p>
+
                                                  <strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong></p>
<p><strong>results</strong></p>
+
                                                  <p><strong>results</strong></p>
<table class="ui celled small table">
+
                                                  <table class="ui celled small table">
<thead>
+
                                                    <thead>
<tr>
+
                                                      <tr>
  <th>sample</th>
+
                                                        <th>sample</th>
  <th>1</th>
+
                                                        <th>1</th>
  <th>2</th>
+
                                                        <th>2</th>
  <th>3</th>
+
                                                        <th>3</th>
</tr>
+
                                                      </tr>
</thead>
+
                                                    </thead>
<tbody>
+
                                                    <tbody>
<tr>
+
                                                      <tr>
  <td>A260/A280</td>
+
                                                        <td>A260/A280</td>
  <td>2.02</td>
+
                                                        <td>2.02</td>
  <td>1.90</td>
+
                                                        <td>1.90</td>
  <td>1.91</td>
+
                                                        <td>1.91</td>
</tr>
+
                                                      </tr>
<tr>
+
                                                      <tr>
  <td>A260/A230</td>
+
                                                        <td>A260/A230</td>
  <td>1.19</td>
+
                                                        <td>1.19</td>
  <td>1.07</td>
+
                                                        <td>1.07</td>
  <td>1.31</td>
+
                                                        <td>1.31</td>
</tr>
+
                                                      </tr>
<tr>
+
                                                      <tr>
  <td>concentration(ng/μL)</td>
+
                                                        <td>concentration(ng/μL)</td>
  <td>17.0</td>
+
                                                        <td>17.0</td>
  <td>15.5</td>
+
                                                        <td>15.5</td>
  <td>27.9</td>
+
                                                        <td>27.9</td>
</tr>
+
                                                      </tr>
</tbody>
+
                                                    </tbody>
</table>
+
                                                  </table>
<p><strong>PCR of sfGFP11</strong>
+
                                                  <p><strong>PCR of sfGFP11</strong>
<strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong>
+
                                                    <strong>Recorder: Xuefeng Meng</strong>
<strong>results</strong>
+
                                                    <strong>results</strong>
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6a/T--USTC--NB_0826_1.jpeg" />
+
                                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6a/T--USTC--NB_0826_1.jpeg" />
         
+
                                                  </div>
        </div>
+
                                                  </div><!--End of ui basic segment id="main_page_content"-->
        </div><!--end of pusher-->
+
                                                 
        <script src="https://2015.igem.org/common/MathJax-2.5-latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"></script>
+
                                                  <div style="background-color:#44a17d; color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/semanticsjs?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
                                                    <div class="ui grid">
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/Notebook_right_menu_js?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
                                                     
        <script type="text/javascript">
+
                                                      <div class="ui three wide column">
        </script>
+
                                                      </div>
        <script>
+
                                                      <div class="ui five wide column">
        $(document).ready(function(){
+
                                                        <h3 class="ui header" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Contact us</h3>
        $('.ui.sticky.basic.menu').sticky({
+
                                                        <div class="ui massive link list" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">
        context: '#main_page_content'
+
                                                          <a class="item" href="mailto:yukae@mail.ustc.edu.cn">
        });
+
                                                            <i class="mail icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
        $("a.item#Description").mouseenter(function(){
+
                                                            <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">e-mail</div>
        $(".sticky.note.outline.icon").transition({
+
                                                          </a>
        animation : 'fly right',
+
                                                          <a class="item" href="https://www.facebook.com/ustcigem">
        duration : '0.5s'
+
                                                            <i class="facebook icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
        });
+
                                                            <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Facebook</div>
        });
+
                                                          </a>
        $("a.item#Description").mouseleave(function(){
+
                                                          <a class="item" href="http://weibo.com/3929719655/fans?topnav=1&amp;wvr=6&amp;mod=message&amp;need_filter=1">
        $(".sticky.note.outline.icon").transition({
+
                                                            <i class="weibo icon" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);"></i>
        animation : 'fly right',
+
                                                            <div class="content" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Weibo</div>
        duration : '0.5s'
+
                                                          </a>
        });
+
                                                        </div>
        //$(this).css({"background-color":"inherit","color":"inherit"});
+
                                                      </div>
        });
+
                                                      <div class="ui two wide column">
        $container.find('img').css('max-width','100%');
+
                                                      </div>
        createMenu();
+
                                                      <div class="ui five wide column">
        });//End of $(document).ready(function())
+
                                                        <h3 class="ui header" style="color:rgba(255, 255, 255, 0.9);">Sponsors</h3>
       
+
                                                        <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/cc/T--USTC--DeutscheBank.png">
        $(window).load(function(){
+
                                                        <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/1/18/T--USTC--USTCXiaohui.png">
        createWayPoints();
+
                                                        <img class="ui small image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/4/45/T--USTC--USTCJiaowuchu.png">
        $("div.pusher").prependTo("body");
+
                                                      </div>
        $("div.sidebar").prependTo("body");
+
                                                     
        $("div#sideMenu").prependTo("div.pusher");
+
                                                    </div>
        $("#ui_article").find("span").css("border-style","none");
+
                                                    <div class="ui divider"></div>
        });
+
                                                    <div class="center aligned container">
        $("#sidebarMenuTrigger").click(function(){
+
                                                      <img class="ui centered tiny image" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6b/T--USTC--MascotLogo.png">
        $(".ui.sidebar.menu")
+
                                                      <div class="ui list">
        .sidebar('setting', 'transition', 'overlay')
+
                                                        <div class="item">Designed by 2016 iGEM Team:USTC<br>Under CC License<br>Based on Semantic-UI</div>
        .sidebar('setting', 'mobileTransition', 'overlay')
+
                                                      </div>
        .sidebar('toggle');
+
                                                    </div>
        });
+
                                                   
        </script>
+
                                                  </div>
      </body>
+
                                                  </div><!--end of pusher-->
    </html>
+
                                                  <script src="https://2015.igem.org/common/MathJax-2.5-latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"></script>
 +
                                                  <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/semanticsjs?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
                                                  <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/Template:USTC/Notebook_right_menu_js?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
                                                  <script type="text/javascript">
 +
                                                  </script>
 +
                                                  <script>
 +
                                                  $(document).ready(function(){
 +
                                                  $('.ui.sticky.basic.menu').sticky({
 +
                                                  context: '#main_page_content'
 +
                                                  });
 +
                                                  $("a.item#Description").mouseenter(function(){
 +
                                                  $(".sticky.note.outline.icon").transition({
 +
                                                  animation : 'fly right',
 +
                                                  duration : '0.5s'
 +
                                                  });
 +
                                                  });
 +
                                                  $("a.item#Description").mouseleave(function(){
 +
                                                  $(".sticky.note.outline.icon").transition({
 +
                                                  animation : 'fly right',
 +
                                                  duration : '0.5s'
 +
                                                  });
 +
                                                  //$(this).css({"background-color":"inherit","color":"inherit"});
 +
                                                  });
 +
                                                  $container.find('img').css('max-width','100%');
 +
                                                  createMenu();
 +
                                                  });//End of $(document).ready(function())
 +
                                                 
 +
                                                  $(window).load(function(){
 +
                                                  createWayPoints();
 +
                                                  $("div.pusher").prependTo("body");
 +
                                                  $("div.sidebar").prependTo("body");
 +
                                                  $("div#sideMenu").prependTo("div.pusher");
 +
                                                  $("#ui_article").find("span").css("border-style","none");
 +
                                                  });
 +
                                                  $("#sidebarMenuTrigger").click(function(){
 +
                                                  $(".ui.sidebar.menu")
 +
                                                  .sidebar('setting', 'transition', 'overlay')
 +
                                                  .sidebar('setting', 'mobileTransition', 'overlay')
 +
                                                  .sidebar('toggle');
 +
                                                  });
 +
                                                  </script>
 +
                                                </body>
 +
                                              </html>

Latest revision as of 18:27, 19 October 2016

Modeling

Notebook
Together we stand

Performers

Everybody

DATE:8.24

Recorder: Yu Xie Plasmid Extraction for sfGFP11

Recorder: Yu Xie PCR of sup35

Procedure:

1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:

sample 1,2,3,4,5,6,7,8
Sterilized ddH2O 9 μL
2×HiFi-PCR Master 12.5 μL
Template 1.5 μL
Primer 1 1 μL
Primer 2 1 μL
total 25 μL

2.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
Pre-Duration 95℃ 10 min
Duration 95℃ 1 min
Anneal 58℃ 1 min
Extend 72℃ 1 min 50 s
Post-Extend 72℃ 10 min
Final 4℃ --

30 cycles(Duration ~ Extend)

Recorder: Yu Xie Double digestion of sup35

Recorder:Yu Xie Ligation of sup35 and pUC57-sfGFP11

Recorder: Yu Xie Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11

Recorder: Yu Xie PCR of sup35

Procedure:

1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:

sample 1,2,3,4,5,6,7,8
Sterilized ddH2O 9 μL
2×HiFi-PCR Master 12.5 μL
Template 1.5 μL
Primer 1 1 μL
Primer 2 1 μL
total 25 μL

2.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
Pre-Duration 95℃ 10 min
Duration 95℃ 1 min
Anneal 58℃ 1 min
Extend 72℃ 1 min 50s
Post-Extend 72℃ 10 min
Final 4℃ --

30 cycles(Duration ~ Extend)

Recorder:Yu Xie Colony picking of sfGFP11

Recorder: Chenyang Li PCR of pYeWGAP-BD

Procedure:

3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add: 4 μL Sterilized ddH2O, 6.5 μL 2XHiFi Pfu, 0.5 μL primer F, 0.5 μL primer R, 1 μL DNA template.

4.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
step 1 95℃ 10 min
step 2 95℃ 30 s
step 3 58℃ 45 s
step 4 72℃ 45 s
step 5 72℃ 10 min
step 6 4℃ --

30 cycles(step 2 ~ step 4)

results:

a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred), 1, 2, 3, 4)

Plasmid Extraction for ligased YeWGAP and BD Recorder: Chenyang Li

results

sample YBE8241001 YBE8241002 YBE8241003 YBE8241004
A260/A280 1.88 1.86 1.89 1.88
A260/A230 2.27 1.92 2.22 2.22
concentration(ng/μL) 203.1 174.7 181.3 177.8

DATE:8.24 Recorder: Chenyang Li PCR of pYeWGAP-BD

Procedure:

3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add: 3 μL Sterilized ddH2O, 5 μL 2XHiFi Pfu, 0.5 μL primer F, 0.5 μL primer R, 1 μL DNA template.

4.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
step 1 95℃ 10 min
step 2 95℃ 30 s
step 3 58℃ 45 s
step 4 72℃ 45 s
step 5 72℃ 10 min
step 6 4℃ --

30 cycles(step 2 ~ step 4)

results:

a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,)

DATE:8.25

Recorder: Yu Xie Plasmid Extraction for sfGFP11

Recorder: Yu Xie Transformation of combinant plasmid pUC57 containing sup35-sfGFP11

Recorder: Yu Xie PCR of sup35

Procedure:

1.Prepare 8 PCR tubes and sequentially add:

sample 1,2,3,4,5,6,7,8
Sterilized ddH2O 9 μL
2×HiFi-PCR Master 12.5 μL
Template 1.5 μL
Primer 1 1 μL
Primer 2 1 μL
total 25 μL

2.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
Pre-Duration 95℃ 10 min
Duration 95℃ 1 min
Anneal 58℃ 1 min
Extend 72℃ 1 min 50 s
Post-Extend 72℃ 10 min
Final 4℃ --

30 cycles(Duration ~ Extend)

Recorder:Yu Xie Colony picking of sup35-sfGFP11

Ligation of YeWGAP and BD **Recorder: Chenyang Li **

Procedure: 9 μL YeWGAPD8201002 3.3 μL BDD8201002 0.2 μL T4 DNA ligase 2 μL 10×T4 DNA Ligase Buffer 5.5 μL ddH2O 20 μL in total.

Mix gently and incubate at 22 degree Celsius for an hour.

The number of the product: YBL8201005, YBL8201006, YBL8201007, YBL8201008, YBL8201009.

Recorder: Chenyang Li PCR of pYeWGAP-BD

Procedure:

3.Prepare 4 PCR of pYeWGAP-BD tubes and sequentially add: 4 μL Sterilized ddH2O, 5 μL 2XHiFi Pfu, 0.5 μL primer F, 0.5 μL primer R, 0.5 μL DNA template.

4.PCR reaction Parameters setting:

stage temperature time
step 1 95℃ 10 min
step 2 95℃ 30 s
step 3 58℃ 45 s
step 4 72℃ 45 s
step 5 72℃ 10 min
step 6 4℃ --

30 cycles(step 2 ~ step 4)

results:

a (from left to right: Trans 2K plus 2(contain Gelred),YBE8241001,1,YBE8241002,2,YBE8241003,3,YBE8241004,4,YeWGAP08171001,YeWGAPD8191002,BDD8191002,YBL8201005,Sterilized ddH2O)

Date: 8.26

Recorder: Yu Xie PCR of sfGFP1-10

Recorder: Yu Xie Double Digestion of sfGFP1-10

Recorder: Yu Xie Double Digestion of pSB1C3

Date: 8.27

Recorder: Yu Xie Ligation of pSB1C3 and sfGFP1-10

Recorder: Yu Xie Transformation of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10

Recorder:Yu Xie Colony picking of combinant plasmid pSB1C3 containing sfGFP1-10

Recorder: Yu Xie PCR of sfGFP1-10

Recorder: Yu Xie Double Digestion of sfGFP1-10

Plasmid Extraction for plasmid C3BD35 Recorder: Xuefeng Meng

results

sample 1 2 3
A260/A280 2.02 1.90 1.91
A260/A230 1.19 1.07 1.31
concentration(ng/μL) 17.0 15.5 27.9

PCR of sfGFP11 Recorder: Xuefeng Meng results

Sponsors

Designed by 2016 iGEM Team:USTC
Under CC License
Based on Semantic-UI