Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/06 06 16"

 
(12 intermediate revisions by 4 users not shown)
Line 1: Line 1:
 
{{IONIS_HEADER}}   
 
{{IONIS_HEADER}}   
 
<html>  
 
<html>  
−
        <!-- ====Google font==== -->
 
−
        <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic,300' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
 
          
 
          
−
        <!-- ====Open Sans==== -->
 
−
        <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
  
−
        <!-- Nos feuilles de style -->
+
  <!-- Nos feuilles de style -->
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-test?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css-template?action=raw&ctype=text/css" />
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 
    
 
    
 
          
 
          
Line 35: Line 31:
 
                             <div class="bloggrid_right">
 
                             <div class="bloggrid_right">
 
                                 <div class="blog_top">
 
                                 <div class="blog_top">
−
                                     <h4 class="blog_topHd">
+
                                     <h2 class="blog_topHd"> <font color =”#279AD3”>  
−
                                     Transformation efficiency test : Competent DH5⍺ cells with pSB1C3-RFP plasmid</h4>
+
                                     Transformation efficiency test : Competent DH5⍺ cells with pSB1C3-RFP plasmid</font></h2>
 
                                   </div>                                             
 
                                   </div>                                             
−
                                    <h4 class="blog_topHd">Objectives</h4>                       
+
                                  <h3><font color =”94FAF1”> Objectives </font></h3>  
 +
                        
 
             <p>To test the competency of the DH5⍺ cells done on the 05/06/16 with the stock of pSB1C3-RFP plasmid.</p>
 
             <p>To test the competency of the DH5⍺ cells done on the 05/06/16 with the stock of pSB1C3-RFP plasmid.</p>
−
                                    <h4 class="blog_topHd">Materials</h4>
+
                             
 +
  <h3><font color =”94FAF1”> Materials </font></h3>  
 
                                          
 
                                          
 
                                  
 
                                  
 
                               <li><p>Plasmid DNA : pSB1C3-RFP at 200 pg/µL</p>
 
                               <li><p>Plasmid DNA : pSB1C3-RFP at 200 pg/µL</p>
 
                               </li>
 
                               </li>
−
                               <li><p>DH5⍺ competent cells <a href - "https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/05_06_16">(See 05/06/16)</a></p>
+
                               <li><p>DH5⍺ competent cells (<a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/05_06_16"><font color="DeepPink"See 05/06/16</font></a>)</p>
 
                               </li>
 
                               </li>
 
                               <li><p>Petri dish LB+Cm: Cm concentration = 25 µg/mL</p>
 
                               <li><p>Petri dish LB+Cm: Cm concentration = 25 µg/mL</p>
 
                               </li>
 
                               </li>
  
−
                                            <h4 class="blog_topHd">Protocol</h4>
+
                                        <h3><font color =”94FAF1”> Protocol </font></h3>  
  
 
                                 <figure class="postImg waves-effect">
 
                                 <figure class="postImg waves-effect">
−
                                     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/a/ac/T--Ionis_Paris--Notebook06_06Table1.png" alt="">
+
                                     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/f/f6/T--Ionis_Paris--Notebook06_06TableMAJ.png" alt="">
 
                                 </figure>
 
                                 </figure>
  
Line 83: Line 81:
 
                               </li>
 
                               </li>
  
 +
                          </ol>
  
−
                                          <h4 class="blog_topHd">Results</h4>
+
                                    <h3><font color =”94FAF1”> Results </font></h3>  
  
−
<b>Expected results :</b>
+
<p><font color =”46BB0A”> Expected results :</font></p>
 
<p>Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 1% of transformed bacteria, more with 10%, a lot with 100% and a bacterial lawn with the pellet.<br/>
 
<p>Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 1% of transformed bacteria, more with 10%, a lot with 100% and a bacterial lawn with the pellet.<br/>
−
A bacterial lawn is expected on the LB petri dish plated with pSB1C3-RFP (+ control).<br/>
+
A bacterial lawn is expected on the LB petri dishes (+ control).<br/>
−
No colony is expected on the 2 petri dishes plated with no plasmid (- control).<br/>
+
No colony is expected on the LB+Cm petri dish plated with no plasmid (- control).<br/>
 
All obtained colonies are expected to be red because of the RFP gene that codes for a red fluorescent protein.</p>
 
All obtained colonies are expected to be red because of the RFP gene that codes for a red fluorescent protein.</p>
  
−
<p><b>Obtained results:</b><br/>
+
<p> <font color =”46BB0A”> Obtained results:</font><br/>
 
We obtained expected results.</p>
 
We obtained expected results.</p>
  
  
−
                          </ol>
+
                                        <h3><font color =”94FAF1”> Interpretation</font></h3>
 +
<p>The transformation worked, as we obtained satisfying results. Colonies contain a plasmid with the Chloramphenicol resistance gene, present in pSB1C3. The DH5α cells are therefore competent.</p>
 +
 
  
 
                                     <div role="tabpanel" class="tab-pane fade" id="popular_post">
 
                                     <div role="tabpanel" class="tab-pane fade" id="popular_post">
Line 166: Line 167:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
−
        <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
+
    <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
−
        <div class="footer_social">
+
    <div class="footer_social">
−
            <div class="container-fluid">
+
        <div class="container-fluid">
−
                <div class="row">
+
            <div class="row">
−
                    <ul class="ft_top clearfix">
+
                <ul class="ft_top clearfix">
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
+
                            <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
+
                            <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                            <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
+
                            <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
 
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                 </ul>
−
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>
+
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
−
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>  
+
−
                    </ul>
+
−
                 </div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
−
        <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
+
    </div>
−
       
+
    <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
−
      <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
+
 
−
        <footer class="footer_area">
+
    <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
−
            <div class="footer_middle">
+
    <footer class="footer_area">
−
                <div class="container">
+
        <div class="footer_middle">
−
                    <div class="row">
+
            <div class="container">
−
                        <div class="col-xs-12">
+
                <div class="row">
−
                            <div class="scroll_area">
+
                    <div class="col-xs-12">
−
                                  
+
                        <div class="scroll_area">
 +
                            <div class="sroll_top">
 +
                                 <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
−
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>iGEM IONIS</h4>
−
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this
−
            Read More</p>
+
                                    competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field
−
                              <a href="#">Read More</a>
+
                                    given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
 +
                                <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 233: Line 230:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
−
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
−
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
−
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
−
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
−
                                 <h4>Galleries</h4>
+
                                 <h4>Download the app</h4>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://itunes.apple.com/us/app/quantifly/id1166875690?ls=1&mt=8"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/8d/IONIS_IGEM_paris_logo_apple.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                     </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                 </figure>
+
                                 </a>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://play.google.com/store/apps/details?id=fr.plnech.quantifly&hl=en"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/65/IONIS_IGEM_paris_google_play.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                    </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                </figure>
+
                                 </a>
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
 
−
                                     <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                       
−
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>  
 
                         </div>  
 +
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 316: Line 281:
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
−
                                     <ul class="ft_bottom">    
+
                                     <ul class="ft_bottom">
−
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">in the Lab</a></li>
−
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Measurement"> Side Projects</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Parts">Results</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/HPintro">Human
−
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                            Practice</a></li>
 +
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 328: Line 294:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
−
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>  
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
−
                             </div>
+
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
             </div>            
+
             </div>
−
        </footer>
+
    </footer>
−
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
+
    <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
−
     
+
 
−
        <!-- Nos scripts -->
+
    <!-- ====Google Maps API==== -->
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script src="https://maps.googleapis.com/maps/api/js"></script>
−
     
+
 
 +
    <!-- Nos scripts -->
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 19:55, 19 October 2016

Transformation efficiency test : Competent DH5⍺ cells with pSB1C3-RFP plasmid

Objectives

To test the competency of the DH5⍺ cells done on the 05/06/16 with the stock of pSB1C3-RFP plasmid.

Materials

  • Plasmid DNA : pSB1C3-RFP at 200 pg/µL

  • DH5⍺ competent cells ()

  • Petri dish LB+Cm: Cm concentration = 25 µg/mL

    • Protocol

    1. Thaw 1 tube of DH5α competent cells on ice for 10 min. Mix gently and carefully pipette 50 µL of cells into 2 transformation tubes on ice.

    2. Add 1 µL (200 pg) of plasmid DNA to the cell mixture. Carefully flick the tube 4-5 times to mix cells and DNA. Do not vortex.

    3. Place the mixture on ice for 30 min. Do not mix.

    4. Heat shock at exactly 42°C for 30 s. Do not mix.

    5. Place on ice for 5 min. Do not mix.

    6. Pipette 950 µL of room temperature SOC into the mixture.

    7. Place at 37°C for 60 min at 250 rpm.

    8. Warm selection plates to 25°C.

    9. Mix the cells thoroughly by flicking the tube and inverting.

    10. Spread 100 µL of each dilution (100%,10%,1%) onto a selection plate.

    11. Pellet the remaining cells (except for the control), discard mostly all the supernatant and resuspend the remaining cells in 100 µL of LB. Spread 100 µL onto a selection plate.

    12. Incubate all the plates O/N at 37°C.

    Results

    Expected results :

    Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 1% of transformed bacteria, more with 10%, a lot with 100% and a bacterial lawn with the pellet.
    A bacterial lawn is expected on the LB petri dishes (+ control).
    No colony is expected on the LB+Cm petri dish plated with no plasmid (- control).
    All obtained colonies are expected to be red because of the RFP gene that codes for a red fluorescent protein.

    Obtained results:
    We obtained expected results.

    Interpretation

    The transformation worked, as we obtained satisfying results. Colonies contain a plasmid with the Chloramphenicol resistance gene, present in pSB1C3. The DH5α cells are therefore competent.

    Creative and impressive building

    How you can be a super creative

    World best photographer and photography