Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Bioluminescence"

(Created page with "{{IONIS_HEADER}} <html> <!-- ====Google font==== --> <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic...")
 
Line 11: Line 11:
 
         <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 
         <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 
          
 
          
          <!-- ====HEADER START==== -->
+
 
        <header class="header_area navbar hidden-xs">
+
            <div class="container-fluid">
+
                <div class="row top_menu_area">
+
                    <div class="col-xs-12 col-sm-3">
+
                        <!-- START LOGO AREA -->
+
                        <div class="logo_area">
+
                            <a href="index.html">
+
                                <img src="img/igem_logo.svg" alt="theme logo" class="main_logo ">
+
                            </a>
+
                        </div>
+
                        <!-- END LOGO AREA -->
+
                    </div>
+
                    <div class="col-xs-12 col-sm-9">
+
                        <!-- START MENU AREA -->
+
                        <nav class="navbar-collapse collapse in">
+
                            <ul class="nav navbar-nav navbar-right menu">
+
                                <li class="smoth-scroll active">
+
                                    <a data-hover="Project" href="#body">Project</a>
+
                                    <ul class="sub_menu">
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index.html">Motivation</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-2.html">Biology</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-3.html">Engineering</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-4.html">Applications and perspectives</a>
+
                                        </li>
+
                                 
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a data-hover="At the lab" href="#at the lab">At the lab</a>
+
                                    <ul class="sub_menu">
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index.html">Working at La Paillasse</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-2.html">Biobrick design</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-3.html">Strategy of conception</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-4.html">Protocol</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-4.html">Notebook</a>
+
                                        </li>
+
                                 
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                        <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a data-hover="Side-projects" href="#Side-projects">Side-projects</a>
+
                                    <ul class="sub_menu">
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index.html">CelloCad</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-2.html">Collaborations</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-3.html">Light analysis</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="index-4.html">Mobile application</a>
+
                                        </li>
+
                                       
+
                                 
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                               
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a data-hover="results" href="#reults">Results</a>
+
                                    <ul class="sub_menu">
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="blog_grid.html">Parts</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="blog-left_sidebar.html">Characterization</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="blog-right_sidebar.html">Proof of concept and Hardware</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li class="waves-effect waves">
+
                                            <a href="single_blog-full.html">Outreach</a>
+
                                        </li>
+
                                   
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                  <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a data-hover="Human Practice" href="Human Practice">Human Practice</a>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a data-hover="Team" href="team.html">Team</a>
+
                                </li>
+
                            </ul>
+
                        </nav>
+
                        <!-- END MENU AREA -->
+
                       
+
                        <!-- Mobile Menu Start -->
+
                        <nav class="mobile_menu hidden">
+
                            <ul>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#body">Project</a>
+
                                    <ul>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index.html">Home Page 1</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-2.html">Home Page 2</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-3.html">Home Page 3</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-4.html">Home Page 4</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-5.html">Home Page 5</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-6.html">Home Page 6</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-7.html">Home Page 7</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-8.html">Home Page 8</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="index-9.html">Home Page 9</a>
+
                                        </li>
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#services">Services</a>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#about">About</a>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#Portfolio">Portfolio</a>
+
                                    <ul>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="protfolio-1.html">Protfolio 1</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="protfolio-2.html">Protfolio 2</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="protfolio-3.html">Protfolio 3</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="case_study.html">Case Study</a>
+
                                        </li>
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#blog">Blog</a>
+
                                    <ul>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="blog_grid.html">Blog Grid</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="blog-left_sidebar.html">Blog Left Sidebar</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="blog-right_sidebar.html">Blog Right Sidebar</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="single_blog-full.html">Single Blog Full</a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                          <a href="single_blog-left_sidebar.html">
+
                                                Single Blog Left Sidebar
+
                                            </a>
+
                                        </li>
+
                                        <li>
+
                                            <a href="single_blog-right_sidebar.html">
+
                                                Single Blog Right Sidebar
+
                                            </a>
+
                                        </li>
+
                                    </ul>
+
                                </li>
+
                                <li class="smoth-scroll">
+
                                    <a href="#contact">Contact US</a>
+
                                </li>
+
                            </ul>
+
                        </nav>
+
                        <!-- Mobile Menu End -->
+
                    </div>
+
                </div>
+
            </div>
+
        </header>                       
+
        <!-- ====HEADER END==== --> 
+
 
          
 
          
 
         <!-- ====BREADCUM START==== -->  
 
         <!-- ====BREADCUM START==== -->  

Revision as of 13:28, 10 October 2016

What is Bioluminescence ?

Bioluminescence is a chemical reaction based on the oxidation of a substrate called luciferin, a light emitting pigment, by the luciferase enzyme, which results in energy emission in the form of light production. The energy generated is more than sufficient to provide the 60 Kcal mol-1 necessary for light emission. This is, however, an energetically costly process This phenomenon is widely observable in nature: it is used by numerous organisms (bacteria, fungi, marine organisms) for different purposes such as reproduction and predation. It must not be mistaken with fluorescence, which comes from the restitution of an absorbed photon by an excited molecule[1][2][3]

Application of Bioluminescence in environmental monitoring

Those applications include construction of biosensors for detection of contaminants, measurement of pollutant toxicity, indicators of cellular metabolic activity, detection of pathogens and monitoring of genetically engineered bacteria released into the environment. Biosensors are particularly useful in bioremediation studies and can be utilized to determine the presence and concentrations of specific pollutants as well as to distinguish between bioavailable forms of pollutants from those that exist in the environment in inert, unavailable forms[1]

[1]Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34. [2] Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399. [3] Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.