Difference between revisions of "Team:BGU ISRAEL"

 
(30 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 23: Line 23:
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Design">Design</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Design">Design</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Experiments">Experiments</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Experiments">Experiments</a></li>
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Demonstrate">Demonstrate</a></li>
 
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Results">Results</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Results">Results</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Protocols">Protocols</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Protocols">Protocols</a></li>
Line 41: Line 40:
 
                         <li class="dropdown" id="partsB"><a class="dropdown-toggle" href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Parts">Parts</a>
 
                         <li class="dropdown" id="partsB"><a class="dropdown-toggle" href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Parts">Parts</a>
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/PartsOverview">Overview</a></li>
+
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Parts#Overview">Overview</a></li>
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Basic_Part">Basic Part</a></li>
+
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Basic_Part">Basic Parts</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/ImprovedParts">Improved Parts</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/ImprovedParts">Improved Parts</a></li>
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/PartsCollection">Part Collection</a></li>
 
 
                             </ul>
 
                             </ul>
 
                         </li>
 
                         </li>
                         <li class="dropdown" id="humanB"><a class="dropdown-toggle" href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HumanPractice">Human Practices</a>
+
                         <li class="dropdown" id="humanB"><a class="dropdown-toggle" href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Integrated_Practices">Human Practices</a>
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HumanPractice#Overview">Overview</a></li>
+
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Integrated_Practices">Integrated Practices</a></li>
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HumanPractice#Acquiring">Acquiring Knowledge</a></li>
+
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HumanPractice#Outreach">Public Outreach</a></li>
+
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HumanPractice#Engagement">Public Engagement</a></li>
+
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/PlasticArt">Plastic Art</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/PlasticArt">Plastic Art</a></li>
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/EtichsAndSaftey">Ethics & Safety</a></li>
+
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/EthicsAndSafety">Ethics & Safety</a></li>
 
                             </ul>
 
                             </ul>
 
                         </li>
 
                         </li>
Line 61: Line 56:
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
 
                             <ul class="dropdown-menu submenubgu">
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Entrepreneurship">Entrepreneurship</a></li>
 
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Entrepreneurship">Entrepreneurship</a></li>
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Model">Model</a></li>
+
                                 <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Measurements">Measurements</a></li>
 +
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Proof">Proof Of Concept</a></li>
 +
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Demonstrate">Demonstrate</a></li>
 +
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HP/Silver">HP - Silver</a></li>
 +
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/HP/Gold">HP - Gold</a></li>
 +
                                <li><a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Engagement">Engagements</a></li>
 
                             </ul>
 
                             </ul>
 
                         </li>
 
                         </li>
Line 71: Line 71:
 
<div class="container-fluid">
 
<div class="container-fluid">
 
             <div class ="row">
 
             <div class ="row">
                 <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/e/e5/HeadlineImage.adapt.1460.high.plastic_bottle_ocean_070114.1451328564891.jpg" class="img-responsive">
+
                 <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/db/Header_for_site_6.png" class="homeBack img-responsive">
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
Line 79: Line 79:
 
                 <div class="abstractBox">
 
                 <div class="abstractBox">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
                         <div class="col-lg-6">
+
                         <div class="col-lg-8">
 
                             <p class="bigAssHeader">Abstract</p>
 
                             <p class="bigAssHeader">Abstract</p>
 
                             <div class="abstractText">
 
                             <div class="abstractText">
 
                                 <p>
 
                                 <p>
                                     Plastic pollution effects on our eco system is a major concern, damging our envoirment and causing harm to plants, animals and humans.
+
                                     Plastic pollution effects on our eco system is of a major concern, damaging our environment and harming plants, animals and humans. As plastic exists only a century, evolution could not catch up and natural biodegradation is still slow and inefficient. Meanwhile plastic has been massively accumulating in nature.
                                    As plastic exists only for about 100 years, evolution could not catch up and the natural biodegredtion  is slow and inefficient meanwhile plastic has been massivly accumulating in nature.
+
 
                                 </p>
 
                                 </p>
 
                                 <p>
 
                                 <p>
                                    We, the BGU iGEM team want to solve this problem combing tools of exerimental evolution, synthetic biology and computational biology.
+
                                  We, the BGU iGEM team want to solve this problem combing tools of synthetic and computational biology. Using these tools, we have taken two complementing routes to try and solve the problem of polyethylene -terephthalate (PET) degradation whereas our major aim is to completely degrade PET to CO<sub>2</sub> while utilizing the energy stored in these chemical bonds in a biofuel cell anode made of a biofilm of engineered <i> Pseudomonas putida (P. putida)</i>:
                                    Using these tools we made three different approches to try and solve the problem:
+
 
                                 </p>
 
                                 </p>
 
                                 <ol>
 
                                 <ol>
 
                                     <li>
 
                                     <li>
                                         Serial passaging of the bacteria Rhodococcus ruber which has been found to bio-degrade plastic, we hope to enhance the ability of it to biodegrade using this tool.  
+
                                         Rational mutation design - Using PROSS algorithm: we aim to improve the catalytic activity of the enzyme LC-Cutinase which breaks down PET to terephthalate and ethylene glycol (its monomers).
 
                                     </li>
 
                                     </li>
 
                                     <li>
 
                                     <li>
                                         Raional mutation design -  Using PROSS  we aim to improve the catalytic activity of the enzyme LC-Cutinase which break down PET to terephthalate and ethylene glycol.
+
                                         Genetic engineering of metabolic pathways – we will use a symbiotic approach where one bacteria,<i> E. coli</i>, will fully degrade one PET monomer (ethylene glycol) upon the initial breaking of the PET bonds to monomers and the second bacteria, <i>P. putida</i>, will fully degrade the second monomer (terephthalic acid), while utilizing it as a sole carbon source using a genetically engineered metabolic pathway inserted to it. Thus<i> P. putida</i> will depend on<i> E. coli</i> activity for nutrients while <i>E. coli </i>cannot survive without <i>P. putida</i> metabolizing terephthalate which is toxic.
                                    </li>
+
                                    <li>
+
                                        Genetic engineering of metabolic pathways–we will modify two metabolic pathways using engineered enzymatic cascades which will be transformed into Pseudomonas putida
+
 
                                     </li>
 
                                     </li>
 
                                 </ol>
 
                                 </ol>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                         <div class="col-lg-6">
+
                         <div class="col-lg-4">
 
                             <img class="abstractPic" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/9/9f/Puti_and_cuti.png">
 
                             <img class="abstractPic" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/9/9f/Puti_and_cuti.png">
 
                             <br>
 
                             <br>
                             <a href="#" class="btn btn-primary infobtn" role="button">For More Information</a>
+
                             <a href="https://2016.igem.org/Team:BGU_ISRAEL/Project" class="btn btn-primary infobtn" role="button">For More Information</a>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
Line 118: Line 113:
 
                     <div class="col-lg-2"></div>
 
                     <div class="col-lg-2"></div>
 
                     <div class ="col-lg-10">
 
                     <div class ="col-lg-10">
                         <video class="plasticureMovie" controls>
+
                         <video class="plasticureMovie" controls poster="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/d7/VideoPosterBGU.PNG">
                             <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/4/48/Plastic_igem_bgu_2016.mp4" type="video/mp4">
+
                             <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/d7/IGEM_BGU_2016_Movie.mp4" type="video/mp4">
 
                         </video>
 
                         </video>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                    <div class="col-lg-4"></div>
 +
                    <div class="plasticureMovieLink">
 +
                        <div class="col-lg-4">
 +
                            <a href="https://www.youtube.com/watch?v=LkK21H5TZVY">See Our Video</a>
 +
                        </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
Line 142: Line 145:
 
                 });
 
                 });
 
             </script>
 
             </script>
            <div class="container-fluid">
+
 
                <div class="row">
+
<div class="container-fluid">
                    <footer class="mainfooter">
+
            <div class="row footerColor">
                        <div class="row">
+
                <div class="col-lg-2"></div>
                            <div class="col-sm-4 text-center" >
+
                <div class="col-lg-4 text-center" >
                                <h4>Address:</h4>
+
                    <h4>Address:</h4>
                                <p>
+
                    <p>
                                    <b>
+
                        Ben-Gurion University of the Negev<br>
                                        Ben-Gurion University of the Negev<br>
+
                        Ben Gurion 1, Beer Sheva 8410501, Israel
                                        Ben Gurion 1, Beer Sheva 8410501, Israel
+
                    </p>
                                    </b>
+
                    <h5>
                                </p>
+
                        <b><u>Mail:</u></b> igembgu2016@gmail.com
                                <h5>
+
                    </h5>
                                    <b><u>Mail:</u> igembgu2016@gmail.com</b>
+
                </div>
                                </h5>
+
                <div class="col-lg-4 text-center">
                            </div>
+
                    <h4>Connect With Us!</h4>
                            <div class="col-sm-4 text-center">
+
                    <div class="row">
                                <h4>Connect With Us!</h4>
+
                        <div class="col-lg-3"></div>
                                <ul>
+
                        <div class="col-lg-6">
                                    <li>
+
                            <div class="row">
                                        <a href="https://www.facebook.com/iGEMBGU/?fref=ts" target="_blank"><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/7d/FacebookFlatIcon.png" alt="facebook"></a>
+
                                <div class="col-lg-4 socialWrapper">
                                    </li>
+
                                    <a href="https://www.facebook.com/iGEMBGU/?fref=ts" target="_blank"><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/7d/FacebookFlatIcon.png" alt="facebook"></a>
                                    <li>
+
                                </div>
                                        <a ><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/1/15/InstagramFlatIcon.png" alt="instagram"></a>
+
                                <div class="col-lg-4 socialWrapper">
                                    </li>
+
                                    <a href=""><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/1/15/InstagramFlatIcon.png" alt="instagram"></a>
                                    <li>
+
                                </div>
                                        <a href="https://twitter.com/igembgu2016" target="_blank"><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/34/TwitterFlatIcon.png" alt="twitter"></a>
+
                                <div class="col-lg-4 socialWrapper">
                                    </li>
+
                                    <a href="https://twitter.com/igembgu2016" target="_blank"><img class="socialMediaIcon" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/34/TwitterFlatIcon.png" alt="twitter"></a>
                                 </ul>
+
                                 </div>
                            </div>
+
                            <div class="col-sm-4 text-center">
+
                                <h4>CopyRights</h4>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                     </footer>
+
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
 +
        </div>
 +
  
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 09:19, 13 December 2016

PlastiCure

Abstract

Plastic pollution effects on our eco system is of a major concern, damaging our environment and harming plants, animals and humans. As plastic exists only a century, evolution could not catch up and natural biodegradation is still slow and inefficient. Meanwhile plastic has been massively accumulating in nature.

We, the BGU iGEM team want to solve this problem combing tools of synthetic and computational biology. Using these tools, we have taken two complementing routes to try and solve the problem of polyethylene -terephthalate (PET) degradation whereas our major aim is to completely degrade PET to CO2 while utilizing the energy stored in these chemical bonds in a biofuel cell anode made of a biofilm of engineered Pseudomonas putida (P. putida):

  1. Rational mutation design - Using PROSS algorithm: we aim to improve the catalytic activity of the enzyme LC-Cutinase which breaks down PET to terephthalate and ethylene glycol (its monomers).
  2. Genetic engineering of metabolic pathways – we will use a symbiotic approach where one bacteria, E. coli, will fully degrade one PET monomer (ethylene glycol) upon the initial breaking of the PET bonds to monomers and the second bacteria, P. putida, will fully degrade the second monomer (terephthalic acid), while utilizing it as a sole carbon source using a genetically engineered metabolic pathway inserted to it. Thus P. putida will depend on E. coli activity for nutrients while E. coli cannot survive without P. putida metabolizing terephthalate which is toxic.

Address:

Ben-Gurion University of the Negev
Ben Gurion 1, Beer Sheva 8410501, Israel

Mail: igembgu2016@gmail.com

Connect With Us!