Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Protocol 7"

(Created page with "{{IONIS_HEADER}} <html> <!-- ====Google font==== --> <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic...")
 
Line 197: Line 197:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
 +
 
         <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
 
         <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
 
         <div class="footer_social">
 
         <div class="footer_social">
Line 203: Line 204:
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
                                 <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                                 <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
                            </a>
+
                        </li>
+
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
                            </a>
+
                        </li>
+
 
                     </ul>
 
                     </ul>
 
                 </div>
 
                 </div>
Line 245: Line 237:
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                             <div class="scroll_area">
 
                             <div class="scroll_area">
 +
                                <div class="sroll_top">
 +
                                  <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a> 
 +
                                </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 +
                      <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>IONIS IGEM</h4>
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
            Read More</p>
+
                               <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
                               <a href="#">Read More</a>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
             
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 263: Line 259:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
                                     
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                         <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
 
                            <div class="footer_Widgets">
+
                          
                                <h4>Galleries</h4>
+
 
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 347: Line 284:
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/At_the_lab.html">At the Lab</a></li>
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/CelloCad"> Side Projects</a></li>
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="Results">Results</a></li>
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Human_Practice">Human Practice</a></li>
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team.html">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 358: Line 295:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>   
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>   
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>   
 
                             </div>   
Line 366: Line 303:
 
             </div>               
 
             </div>               
 
         </footer>
 
         </footer>
 +
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
 
        
 
        
 
         <!-- Nos scripts -->
 
         <!-- Nos scripts -->
 +
<!-- TODO: Debug these scripts
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Venobox&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_MDB&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Carousel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
-->
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 +
 
        
 
        
 
</html>
 
</html>

Revision as of 12:33, 16 October 2016

Protocol 7 : PCR and PCR purification

Aim: DNA fragment amplification and purification

PCR

Prepare the following reaction in a 0,2 mL PCR tube :
NB : All components must be vortexed before use

Gently mix the reaction and spin down microcentrifuge.
Transfer PCR tubes from ice to a PCR machine with the block preheated to 95°C
Set the following parameters for the PCR reaction :
- Lid température 95°C
- Initial denaturation : 95°C 30 s
- 25 cycles of : 95°C 30 s
58°C 60 s
68°C 1 min per kB to amplify
- Final extension : 68°C 5 min
- Hold : 4°C

PCR purification

Add 5 volumes Buffer PB to 1 volume of the PCR reaction and mix. If the color of the mixture is orange or violet, add 10 µL 3 M sodium acetate, pH 5.0, and mix. The color of the mixture will turn yellow.
Place a QIAquick column in a provided 2 mL collection tube.
To bind DNA, apply the sample to the QIAquick column and centrifuge for 60 s. Discard flow-through and place the QIAquick column back in the same tube.
To wash, add 0.75 mL Buffer PE to the QIAquick column, centrifuge for 60 s. Discard flow-through and place the QIAquick column back in the same tube.
Centrifuge the QIAquick column once more in the provided 2 mL collection tube for 1 min to remove residual wash buffer.
Place each QIAquick column in a clean 1.5 mL microcentrifuge tube.
To elute DNA, add 30 µL Buffer EB (10 mM Tris·Cl, pH 8.5) elution buffer to the center of the QIAquick membrane, let the column stand for 1 min, and then centrifuge for 1 min at 13000 rpm.