Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Protocol 9"

Line 148: Line 148:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
 +
 
         <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
 
         <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
 
         <div class="footer_social">
 
         <div class="footer_social">
Line 154: Line 155:
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
                                 <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                                 <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
                            </a>
+
                        </li>
+
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
                            </a>
+
                        </li>
+
 
                     </ul>
 
                     </ul>
 
                 </div>
 
                 </div>
Line 196: Line 188:
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                             <div class="scroll_area">
 
                             <div class="scroll_area">
 +
                                <div class="sroll_top">
 +
                                  <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a> 
 +
                                </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 +
                      <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>IONIS IGEM</h4>
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
            Read More</p>
+
                               <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
                               <a href="#">Read More</a>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
             
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 214: Line 210:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
                                     
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                         <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
 
                            <div class="footer_Widgets">
+
                          
                                <h4>Galleries</h4>
+
 
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 298: Line 235:
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/At_the_lab.html">At the Lab</a></li>
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/CelloCad"> Side Projects</a></li>
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="Results">Results</a></li>
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Human_Practice">Human Practice</a></li>
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team.html">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 309: Line 246:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>   
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>   
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>   
 
                             </div>   
Line 318: Line 255:
 
         </footer>
 
         </footer>
 
         <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
 
         <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
       
 
 
        
 
        
 
         <!-- Nos scripts -->
 
         <!-- Nos scripts -->
 +
<!-- TODO: Debug these scripts
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Venobox&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_MDB&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Carousel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
-->
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 +
 
        
 
        
 
</html>
 
</html>

Revision as of 12:34, 16 October 2016

Protocol 9: Miniprep

Aim: Extract and purify plasmidic DNA from transformed bacteria


Centrifuge the bacterial O/N mini-cultures (1 to 5 mL) at 9000 rpm for 3 min at room temperature to pellet cells. Discard the supernatant.

Resuspend the pellet in 200 μL Plasmid Resuspension Buffer (B1). Vortex or pipet to ensure cells are completely resuspended. There should be no visible clumps.

Lyse cells by adding 200 μl Plasmid Lysis Buffer (B2). Invert tube immediately and gently 5–6 times until color changes to dark pink and the solution is clear and viscous. Do not vortex! Incubate for 1 min.

Neutralize the lysate by adding 400 μl of Plasmid Neutralization Buffer (B3). Gently invert tube until color is uniformly yellow and a precipitate forms. Do not vortex! Incubate for 2 min.
Clarify the lysate by spinning for 4 min at 13000 rpm.

Carefully transfer supernatant to the spin column and centrifuge for 1 min. Discard flow-through.

Re-insert column in the collection tube and add 200 μl of Plasmid Wash Buffer 1. Plasmid Wash Buffer 1 removes RNA, protein and endotoxin. Centrifuge for 1 min. Discard the flow-through.

Add 400 μl of Plasmid Wash Buffer 2 and centrifuge for 1 min.

Transfer column to a clean 1.5 mL microfuge tube. Use care to ensure that the tip of the column has not come into contact with the flow-through. If there is any doubt, re-spin the column for 1 min before inserting it into the clean microfuge tube.

Add ≥ 30 μl DNA Elution Buffer to the center of the matrix. Wait for 1 min, then spin for 1 min to elute DNA. Store the purified DNA at -20°C