Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/21 07 16"

 
(3 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
 
{{IONIS_HEADER}}   
 
{{IONIS_HEADER}}   
 
<html>  
 
<html>  
−
        <!-- ====Google font==== -->
 
−
        <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic,300' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
 
          
 
          
−
        <!-- ====Open Sans==== -->
 
−
        <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
  
−
        <!-- Nos feuilles de style -->
+
  <!-- Nos feuilles de style -->
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-test?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css-template?action=raw&ctype=text/css" />
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 
    
 
    
 
          
 
          
Line 34: Line 30:
 
                         <div class="col-xs-12 col-sm-9">
 
                         <div class="col-xs-12 col-sm-9">
 
                             <div class="bloggrid_right">
 
                             <div class="bloggrid_right">
−
                                <div class="blog_top">
 
−
                                    <h4 class="blog_topHd">
 
−
                                    Transformation: competent DH5⍺ cells with ligation products BB1, BB2 and BB3</h4>
 
−
                                  </div>           
 
 
                                  
 
                                  
−
                                     <h4 class="blog_topHd">Objectives</h4>                      
+
                                     <h2 class="blog_topHd"> <font color =”#279AD3”>Transformation: competent DH5⍺ cells with ligation products BB1, BB2 and BB3</font></h2>
 +
                               
 +
                                  <h3><font color =”94FAF1”> Objectives </font></h3>                    
 
             <p>The objective is to transforme competent DH5⍺ cells with the ligation products BB1, BB2 and BB3 to create a stock of transformed bacteria.</p>
 
             <p>The objective is to transforme competent DH5⍺ cells with the ligation products BB1, BB2 and BB3 to create a stock of transformed bacteria.</p>
  
−
                                     <h4 class="blog_topHd">Materials</h4>
+
                                     <h3><font color =”94FAF1”> Materials </font></h3>
 
    
 
    
 
                               <li><p>6 aliquots of NEB DH5⍺ Competent E.coli (C2287)</p></li>
 
                               <li><p>6 aliquots of NEB DH5⍺ Competent E.coli (C2287)</p></li>
Line 49: Line 43:
 
                          
 
                          
  
−
                                            <h4 class="blog_topHd">Protocol</h4>
+
                                        <h3><font color =”94FAF1”> Protocol </font></h3>
  
−
                                  <h4>Experimental conditions achieved : </h4>
+
                          <h5><font color =”#3CB5E1”>Experimental conditions achieved : </font></h5>  
  
 
                     <figure class="postImg waves-effect">
 
                     <figure class="postImg waves-effect">
Line 59: Line 53:
 
                           <p>We need 20 LB+Cm plates + 11 LB plates</p>
 
                           <p>We need 20 LB+Cm plates + 11 LB plates</p>
 
                                        
 
                                        
−
                                      <h4>Transformations protocol:</h4>
+
                              <h5><font color =”#3CB5E1”>Transformations protocol:</font></h5>  
  
 
                                             <ol> <li><p>haw 2 tubes of DH5⍺ competent cells on ice for 10 min. Mix gently and carefully pipette 50 µL of cells into the 4 transformation tubes on ice.        </p></li>
 
                                             <ol> <li><p>haw 2 tubes of DH5⍺ competent cells on ice for 10 min. Mix gently and carefully pipette 50 µL of cells into the 4 transformation tubes on ice.        </p></li>
Line 76: Line 70:
 
                         </ol>
 
                         </ol>
 
                              
 
                              
−
                                          <h4 class="blog_topHd">Results (obtain the 22/07)</h4>
+
                                        <h3><font color =”94FAF1”>Results (obtain the 22/07)</font></h3>
  
−
                              <h4>Expected results:</h4>
+
                        <p><font color= ”46BB0A”> Expected results:</font></p>
  
 
                           <p>Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 50 µL of bacteria transformed with the different ligation products and more on the petri dishes LB+Cm plated with 200 µL of bacteria.<br/>
 
                           <p>Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 50 µL of bacteria transformed with the different ligation products and more on the petri dishes LB+Cm plated with 200 µL of bacteria.<br/>
Line 84: Line 78:
 
No colonies on the LB+Cm petri dish plated with bacteria transformed with no plasmid (- control).</p>
 
No colonies on the LB+Cm petri dish plated with bacteria transformed with no plasmid (- control).</p>
  
−
                              <h4>Obtained results:</h4>
+
                            <p> <font color= ”46BB0A”> Obtained results:</font><br/>
  
 
                           <p>We obtained expected results for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB1 and BB2, but there is no colonies for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB3.</p>
 
                           <p>We obtained expected results for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB1 and BB2, but there is no colonies for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB3.</p>
  
  
−
                                          <h4 class="blog_topHd">Interpretation</h4>
+
                                          <h3><font color =”94FAF1”> Interpretation</font></h3>
  
 
                         <p>The transformation worked for BB1 and BB2. Colonies contain a plasmid with the Chloramphenicol resistance gene, present in pSB1C3. A PCR colonie is necessary to check the size of the plasmid present in colonies, and therefore in order to know if bacteria incorpore the correct plasmids BB1 and BB2. A new digestion, ligation and transformation is necessary for BB3.</p>
 
                         <p>The transformation worked for BB1 and BB2. Colonies contain a plasmid with the Chloramphenicol resistance gene, present in pSB1C3. A PCR colonie is necessary to check the size of the plasmid present in colonies, and therefore in order to know if bacteria incorpore the correct plasmids BB1 and BB2. A new digestion, ligation and transformation is necessary for BB3.</p>
Line 166: Line 160:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
−
        <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
+
  <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
−
        <div class="footer_social">
+
    <div class="footer_social">
−
            <div class="container-fluid">
+
        <div class="container-fluid">
−
                <div class="row">
+
            <div class="row">
−
                    <ul class="ft_top clearfix">
+
                <ul class="ft_top clearfix">
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
+
                            <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
+
                            <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                            <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
+
                            <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
 
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                 </ul>
−
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>
+
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
−
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>  
+
−
                    </ul>
+
−
                 </div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
−
        <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
+
    </div>
−
       
+
    <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
−
      <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
+
 
−
        <footer class="footer_area">
+
    <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
−
            <div class="footer_middle">
+
    <footer class="footer_area">
−
                <div class="container">
+
        <div class="footer_middle">
−
                    <div class="row">
+
            <div class="container">
−
                        <div class="col-xs-12">
+
                <div class="row">
−
                            <div class="scroll_area">
+
                    <div class="col-xs-12">
−
                                  
+
                        <div class="scroll_area">
 +
                            <div class="sroll_top">
 +
                                 <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
−
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>iGEM IONIS</h4>
−
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this
−
            Read More</p>
+
                                    competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field
−
                              <a href="#">Read More</a>
+
                                    given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
 +
                                <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 233: Line 223:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
−
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
−
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
−
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
−
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
−
                                 <h4>Galleries</h4>
+
                                 <h4>Download the app</h4>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://itunes.apple.com/us/app/quantifly/id1166875690?ls=1&mt=8"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/8d/IONIS_IGEM_paris_logo_apple.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                     </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                 </figure>
+
                                 </a>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://play.google.com/store/apps/details?id=fr.plnech.quantifly&hl=en"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/65/IONIS_IGEM_paris_google_play.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                    </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                </figure>
+
                                 </a>
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
 
−
                                     <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                       
−
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>  
 
                         </div>  
 +
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 316: Line 274:
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
−
                                     <ul class="ft_bottom">    
+
                                     <ul class="ft_bottom">
−
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">in the Lab</a></li>
−
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Measurement"> Side Projects</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Parts">Results</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/HPintro">Human
−
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                            Practice</a></li>
 +
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 328: Line 287:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
−
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>  
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
−
                             </div>
+
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
             </div>            
+
             </div>
−
        </footer>
+
    </footer>
−
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
+
    <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
−
     
+
 
−
        <!-- Nos scripts -->
+
    <!-- ====Google Maps API==== -->
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script src="https://maps.googleapis.com/maps/api/js"></script>
−
     
+
 
 +
    <!-- Nos scripts -->
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 20:06, 19 October 2016

Transformation: competent DH5⍺ cells with ligation products BB1, BB2 and BB3

Objectives

The objective is to transforme competent DH5⍺ cells with the ligation products BB1, BB2 and BB3 to create a stock of transformed bacteria.

Materials

  • 6 aliquots of NEB DH5⍺ Competent E.coli (C2287)

  • Plasmid DNA : Ligation product BB1, BB2 and BB3 (from the 20/07/16)

  • Petri dish LB+Cm: Cm concentration = 25 µg/mL

    • Protocol

    Experimental conditions achieved :

    We need 20 LB+Cm plates + 11 LB plates

    Transformations protocol:

    1. haw 2 tubes of DH5⍺ competent cells on ice for 10 min. Mix gently and carefully pipette 50 µL of cells into the 4 transformation tubes on ice.

    2. Add the 20 µL / 30 µL plasmid DNA to the cell mixture.

    3. Carefully flick the tubes 4-5 times to mix cells and DNA. Do not vortex.

    4. Place on ice for 30 min. Do not mix.

    5. Heat shock at exactly 42°C for 45 s. Do not mix.

    6. Place on ice for 5 min. Do not mix.

    7. Pipette 250 µL of room temperature SOC into the mixture.

    8. Place at 37°C for 1h at 250 rpm.

    9. Warm selection plates to 25°C.

    10. Mix the cells thoroughly by flicking the tubes and inverting.

    11. Spread the corresponding volume onto each plate.

    12. Incubate all the plates O/N at 37°C.

    Results (obtain the 22/07)

    Expected results:

    Some colonies on the petri dishes LB+Cm plated with 50 µL of bacteria transformed with the different ligation products and more on the petri dishes LB+Cm plated with 200 µL of bacteria.
    A bacterial lawn on the LB petri dish without antibiotic.
    No colonies on the LB+Cm petri dish plated with bacteria transformed with no plasmid (- control).

    Obtained results:

    We obtained expected results for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB1 and BB2, but there is no colonies for petri-dishes plated with bacteria transformed with BB3.

    Interpretation

    The transformation worked for BB1 and BB2. Colonies contain a plasmid with the Chloramphenicol resistance gene, present in pSB1C3. A PCR colonie is necessary to check the size of the plasmid present in colonies, and therefore in order to know if bacteria incorpore the correct plasmids BB1 and BB2. A new digestion, ligation and transformation is necessary for BB3.

    Creative and impressive building

    How you can be a super creative

    World best photographer and photography