Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Bioluminescence"

 
(12 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 7: Line 7:
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
  
−
        <!-- Nos feuilles de style -->
+
  <!-- Nos feuilles de style -->
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-test?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css-template?action=raw&ctype=text/css" />
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
+
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 +
       
 
          
 
          
  
Line 19: Line 21:
 
                     <div class="col-sm-12">
 
                     <div class="col-sm-12">
 
                         <div class="banner_title">
 
                         <div class="banner_title">
−
                             <h1>Bioluminescence</h1>
+
                             <h1 id="back_to_the_top">Bioluminescence</h1>
 
                              
 
                              
 
                         </div>
 
                         </div>
Line 35: Line 37:
 
                         <div class="col-xs-12 col-sm-8">
 
                         <div class="col-xs-12 col-sm-8">
 
                             <div class="bloggrid_left">
 
                             <div class="bloggrid_left">
−
                                <figure class="postImg waves-effect">
+
                             
−
                                    <img src="img/blog_full.jpg" alt="">
+
                                <h5 class="smallHd">What is bioluminescence ?</h5>
−
                                </figure>
+
                                <h2 class="secHd">Description & mechanisms</h2>
−
                                <div class="blog_top">
+
−
                                    <h4 class="blog_topHd">What is Bioluminescence ? </h4>
+
−
                                 
+
−
                                </div>
+
 
                                 <div class="blog_content">
 
                                 <div class="blog_content">
  
Line 49: Line 47:
  
  
−
                                <figure class="postImg waves-effect">
+
                             
−
                                     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/6a/T--Ionis_Paris--Biosensorfig1.png" alt="">
+
                                     <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/0/00/T--Ionis_Paris--Biosensorfig2.png" alt="">
−
                                 </figure>
+
                                  
  
  
  
−
                                   <h4 class="blog_topHd">Application of Bioluminescence in environmental monitoring </h4>
+
                                   <h5 class="smallHd">Environmental monitoring </h5>
−
                              <p>Those applications include construction of biosensors for detection of contaminants, measurement of pollutant toxicity, indicators of cellular metabolic activity, detection of pathogens and monitoring of genetically engineered bacteria released into the environment.
+
                                  <h2 class="secHd">Application</h2>
−
Biosensors are particularly useful in bioremediation studies and can be utilized to determine the presence and concentrations of specific pollutants as well as to distinguish between bioavailable forms of pollutants from those that exist in the environment in inert, unavailable forms[1]
+
                             
−
</p>  
+
<p>Applications include construction of biosensors for detection of pollutants and pathogens. It can be used to monitor genetically engineered bacteria released into the environment.
−
<p>[1]Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.
+
Biosensors are particularly useful in bioremediation studies in which they can be used to determine the presence, bioavailability, and concentrations of specific pollutants. </p>
−
[2] Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.
+
 
−
[3] Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.
+
<p>Bioluminescence as an indicator of cellular metabolic activity can be used to monitor the biological activity and toxicity of pollutants.[1]<p>
−
</p>
+
 
−
                               
+
 
 +
                                   
 +
 
 +
<p><b>Rferences (Links are provided when available):</b></p>
 +
 
 +
<ol>
 +
      <li><p><a href="http://www.scielo.br/scielo.php?pid=s1517-83822003000200001&script=sci_arttext"><font color="DeepPink">Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.</font></a></p>
 +
    </li>
 +
 
 +
      <li><p><a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S157096391500148X"><font color="DeepPink">Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.</font></a></p>
 +
    </li>
 +
 
 +
      <li><p><a href="http://aem.asm.org/content/71/7/3427.short"><font color="DeepPink">Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.</font></a></p>
 +
    </li>
 +
</ol>
 +
                     
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                                
 
                                
Line 83: Line 96:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
−
        <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
+
  <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
−
        <div class="footer_social">
+
    <div class="footer_social">
−
            <div class="container-fluid">
+
        <div class="container-fluid">
−
                <div class="row">
+
            <div class="row">
−
                    <ul class="ft_top clearfix">
+
                <ul class="ft_top clearfix">
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
+
                            <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
+
                            <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                            <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
+
                            <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
 
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
                 </ul>
−
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>
+
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
−
                            <a href="#" target="_blank">
+
−
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
−
                            </a>
+
−
                        </li>  
+
−
                    </ul>
+
−
                 </div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
−
        <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
+
    </div>
−
       
+
    <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
−
        <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
+
 
−
        <footer class="footer_area">
+
    <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
−
            <div class="footer_middle">
+
    <footer class="footer_area">
−
                <div class="container">
+
        <div class="footer_middle">
−
                    <div class="row">
+
            <div class="container">
−
                        <div class="col-xs-12">
+
                <div class="row">
−
                            <div class="scroll_area">
+
                    <div class="col-xs-12">
 +
                        <div class="scroll_area">
 +
                            <div class="sroll_top">
 +
                                <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
−
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>iGEM IONIS</h4>
−
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this
−
            Read More</p>
+
                                    competition we wanted to take advantage of the multiple schools and fields of activity
−
                              <a href="#">Read More</a>
+
                                    given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
 +
                                <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 149: Line 159:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
−
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
−
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
−
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
−
                                        </li>
+
−
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
−
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                        <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
−
                                 <h4>Galleries</h4>
+
                                 <h4>Download the app</h4>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://itunes.apple.com/us/app/quantifly/id1166875690?ls=1&mt=8"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/8d/IONIS_IGEM_paris_logo_apple.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                     </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                 </figure>
+
                                 </a>
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://play.google.com/store/apps/details?id=fr.plnech.quantifly&hl=en"
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
−
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
−
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
−
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/65/IONIS_IGEM_paris_google_play.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
−
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
−
                                    </figcaption>
+
                                     </figure>
−
                                </figure>
+
                                 </a>
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
 
−
                                     <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                       
−
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                 <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
−
                                <figure class="widget_gallery">
+
−
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
−
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
−
                                    <figcaption>
+
−
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
−
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
−
                                        </a>
+
−
                                    </figcaption>
+
−
                                </figure>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>  
 
                         </div>  
 +
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 232: Line 210:
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
−
                                     <ul class="ft_bottom">    
+
                                     <ul class="ft_bottom">
−
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">in the Lab</a></li>
−
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Measurement"> Side Projects</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Parts">Results</a></li>
−
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/HPintro">Human
−
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                            Practice</a></li>
 +
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 244: Line 223:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
−
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>  
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
−
                             </div>
+
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
             </div>            
+
             </div>
−
        </footer>
+
    </footer>
−
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
+
    <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
−
     
+
 
−
        <!-- Nos scripts -->
+
    <!-- ====Google Maps API==== -->
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script src="https://maps.googleapis.com/maps/api/js"></script>
−
     
+
 
 +
    <!-- Nos scripts -->
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 20:43, 19 October 2016

What is bioluminescence ?

Description & mechanisms

Bioluminescence is a chemical reaction based on the oxidation of a substrate called luciferin (a light emitting pigment) by the luciferase enzyme, which results in energy emission in the form of light. This process requires six ATP molecules for each photon emitted.
This phenomenon is widely observable in nature: it is used by numerous organisms (bacteria, fungi, marine organisms) for different purposes such as reproduction and predation. It must not be mistaken with fluorescence, which comes from the restitution of an absorbed photon by an excited molecule [1][2][3]

Environmental monitoring

Application

Applications include construction of biosensors for detection of pollutants and pathogens. It can be used to monitor genetically engineered bacteria released into the environment. Biosensors are particularly useful in bioremediation studies in which they can be used to determine the presence, bioavailability, and concentrations of specific pollutants.

Bioluminescence as an indicator of cellular metabolic activity can be used to monitor the biological activity and toxicity of pollutants.[1]

Rferences (Links are provided when available):

  1. Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.

  2. Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.

  3. Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.