Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Bioluminescence"

 
(6 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 7: Line 7:
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
  
−
        <!-- Nos feuilles de style -->
+
  <!-- Nos feuilles de style -->
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-test?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css-template?action=raw&ctype=text/css" />
−
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
+
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 +
       
 
          
 
          
  
Line 37: Line 39:
 
                                
 
                                
 
                                 <h5 class="smallHd">What is bioluminescence ?</h5>
 
                                 <h5 class="smallHd">What is bioluminescence ?</h5>
−
                                 <h2 class="secHd">Description &mechanisms</h2>
+
                                 <h2 class="secHd">Description & mechanisms</h2>
 
                                 <div class="blog_content">
 
                                 <div class="blog_content">
  
Line 51: Line 53:
  
  
−
                                   <h4 class="blog_topHd">Application of Bioluminescence in environmental monitoring </h4>
+
                                   <h5 class="smallHd">Environmental monitoring </h5>
 +
                                  <h2 class="secHd">Application</h2>
 
                                
 
                                
 
<p>Applications include construction of biosensors for detection of pollutants and pathogens. It can be used to monitor genetically engineered bacteria released into the environment.
 
<p>Applications include construction of biosensors for detection of pollutants and pathogens. It can be used to monitor genetically engineered bacteria released into the environment.
Line 64: Line 67:
  
 
<ol>
 
<ol>
−
       <li><p><a href="http://www.scielo.br/scielo.php?pid=s1517-83822003000200001&script=sci_arttext">Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.</a></p>
+
       <li><p><a href="http://www.scielo.br/scielo.php?pid=s1517-83822003000200001&script=sci_arttext"><font color="DeepPink">Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.</font></a></p>
 
     </li>
 
     </li>
  
−
       <li><p><a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S157096391500148X">Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.</a></p>
+
       <li><p><a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S157096391500148X"><font color="DeepPink">Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.</font></a></p>
 
     </li>
 
     </li>
  
−
       <li><p><a href="http://aem.asm.org/content/71/7/3427.short">Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.</a></p>
+
       <li><p><a href="http://aem.asm.org/content/71/7/3427.short"><font color="DeepPink">Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.</font></a></p>
 
     </li>
 
     </li>
 
</ol>  
 
</ol>  
Line 93: Line 96:
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
−
        <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
+
  <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
−
        <div class="footer_social">
+
    <div class="footer_social">
−
            <div class="container-fluid">
+
        <div class="container-fluid">
−
                <div class="row">
+
            <div class="row">
−
                    <ul class="ft_top clearfix">
+
                <ul class="ft_top clearfix">
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
+
                            <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
+
                        <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
+
                            <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
+
                            <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
−
                            <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
+
                        <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
−
                                <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
+
                            <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
−
                            </a>
+
                        </a>
−
                        </li>  
+
                    </li>
−
+
 
−
                    </ul>
+
                </ul>
−
                </div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
−
        <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
+
    </div>
−
       
+
    <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
−
        <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
+
 
−
        <footer class="footer_area">
+
    <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
−
            <div class="footer_middle">
+
    <footer class="footer_area">
−
                <div class="container">
+
        <div class="footer_middle">
−
                    <div class="row">
+
            <div class="container">
−
                        <div class="col-xs-12">
+
                <div class="row">
−
                            <div class="scroll_area">
+
                    <div class="col-xs-12">
−
                                <div class="sroll_top">
+
                        <div class="scroll_area">
−
                                  <a href="#back_to_the_top"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a> 
+
                            <div class="sroll_top">
−
                                </div>
+
                                <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
−
                      <div class="row">
 
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
−
                                 <h4>IONIS IGEM</h4>
+
                                 <h4>iGEM IONIS</h4>
−
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this
−
                              <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
+
                                    competition we wanted to take advantage of the multiple schools and fields of activity
 +
                                    given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
 +
                                <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
             
+
 
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 160: Line 165:
 
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
 
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
 
                                         </li>
 
                                         </li>
−
                                     
+
 
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
 +
                            <div class="footer_Widgets">
 +
                                <h4>Download the app</h4>
 +
                                <a href="https://itunes.apple.com/us/app/quantifly/id1166875690?ls=1&mt=8"
 +
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
 +
                                    <figure class="widget_gallery">
 +
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/8d/IONIS_IGEM_paris_logo_apple.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                        <figcaption>
 +
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 +
                                        </figcaption>
 +
                                    </figure>
 +
                                </a>
 +
                                <a href="https://play.google.com/store/apps/details?id=fr.plnech.quantifly&hl=en"
 +
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
 +
                                    <figure class="widget_gallery">
 +
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
 +
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/65/IONIS_IGEM_paris_google_play.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                        <figcaption>
 +
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 +
                                        </figcaption>
 +
                                    </figure>
 +
                                </a>
  
−
                          
+
                       
 +
                            </div>
 +
                         </div>
  
 
                     </div>
 
                     </div>
Line 178: Line 210:
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
−
                                     <ul class="ft_bottom">    
+
                                     <ul class="ft_bottom">
 
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
 
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
−
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/At_the_lab.html">At the Lab</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">in the Lab</a></li>
−
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/CelloCad"> Side Projects</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Measurement"> Side Projects</a></li>
−
                                         <li><a href="Results">Results</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Parts">Results</a></li>
−
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Human_Practice">Human Practice</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/HPintro">Human
−
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team.html">Team</a></li>
+
                                            Practice</a></li>
 +
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 190: Line 223:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
−
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>  
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
−
                             </div>
+
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
−
             </div>            
+
             </div>
−
        </footer>
+
    </footer>
−
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
+
    <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
−
     
+
 
−
        <!-- Nos scripts -->
+
    <!-- ====Google Maps API==== -->
−
<!-- TODO: Debug these scripts
+
    <script src="https://maps.googleapis.com/maps/api/js"></script>
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Venobox&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
 
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_MDB&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <!-- Nos scripts -->
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Carousel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
−
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
−
-->
+
−
     
+
  
−
     
 
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 20:43, 19 October 2016

What is bioluminescence ?

Description & mechanisms

Bioluminescence is a chemical reaction based on the oxidation of a substrate called luciferin (a light emitting pigment) by the luciferase enzyme, which results in energy emission in the form of light. This process requires six ATP molecules for each photon emitted.
This phenomenon is widely observable in nature: it is used by numerous organisms (bacteria, fungi, marine organisms) for different purposes such as reproduction and predation. It must not be mistaken with fluorescence, which comes from the restitution of an absorbed photon by an excited molecule [1][2][3]

Environmental monitoring

Application

Applications include construction of biosensors for detection of pollutants and pathogens. It can be used to monitor genetically engineered bacteria released into the environment. Biosensors are particularly useful in bioremediation studies in which they can be used to determine the presence, bioavailability, and concentrations of specific pollutants.

Bioluminescence as an indicator of cellular metabolic activity can be used to monitor the biological activity and toxicity of pollutants.[1]

Rferences (Links are provided when available):

  1. Nunes-Halldorson, V. da S., and Duran, N.L. (2003). Bioluminescent bacteria: lux genes as environmental biosensors. Brazilian Journal of Microbiology 34.

  2. Wu, N., Rathnayaka, T., and Kuroda, Y. (2015). Bacterial expression and re-engineering of Gaussia princeps luciferase and its use as a reporter protein. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1854, 1392–1399.

  3. Wiles, S., Ferguson, K., Stefanidou, M., Young, D.B., and Robertson, B.D. (2005). Alternative Luciferase for Monitoring Bacterial Cells under Adverse Conditions. Applied and Environmental Microbiology 71, 3427–3432.