Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Projectsafety"

(Created page with "{{IONIS_HEADER}} <html> <!-- ====Google font==== --> <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic...")
 
 
(15 intermediate revisions by 4 users not shown)
Line 7: Line 7:
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
 
         <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:400,600,700,600italic,400italic,700italic,300,300italic' rel='stylesheet' type='text/css'>
  
        <!-- Nos feuilles de style -->
+
          <!-- Nos feuilles de style -->
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-test?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css-template?action=raw&ctype=text/css" />
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
+
    <!-- Version minifiée dans le bon ordre de toutes les feuilles de style du template -->
 +
    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2016.igem.org/Template:IONIS_Paris-style-css?action=raw&ctype=text/css" />
 
    
 
    
 
         <!-- ====BREADCUM START==== -->  
 
         <!-- ====BREADCUM START==== -->  
         <section class="blog_banner_cloning">
+
         <section class="blog_banner_labo">
 
             <div class="container">
 
             <div class="container">
 
                 <div class="row">
 
                 <div class="row">
 
                     <div class="col-sm-12">
 
                     <div class="col-sm-12">
 
                         <div class="banner_title">
 
                         <div class="banner_title">
                             <h1>Safety</h1>
+
                             <h1 style="color :#960c38;" id="back_to_the_top">Project Safety</h1>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
Line 26: Line 27:
 
          
 
          
 
         <!-- ====START BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====START BLOG TABLE==== -->
         <section class="blog_area section-padding">
+
         <section id="about" class="about_area section-padding">
 
             <div class="container">
 
             <div class="container">
 
                 <div class="row">
 
                 <div class="row">
                    <div class="blog_grid_area">
+
     
                        <div class="col-xs-12 col-sm-9">
+
                    <div class="col-xs-12">
                            <div class="bloggrid_right">
+
       
                                <div class="blog_top">
+
                                    <h4 class="blog_topHd" style="margin-top:20px">
+
                                      Project Safety
+
                                    </h4>
+
                                <p>In order to obtain synthesized DNA fragments without error, we chose to synthesis our big biosensor part of 3,305 bp in 3 smaller parts between 500 bp and 1,800 bp that we planned to then assemble together in the pSB1C3 backbone.</p>
+
                                  <h4 class="blog_topHd">
+
                                    Part 1 (532 bp)
+
                                    </h4>
+
                                 
+
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/87/T--Ionis_Paris--Cloning_StrategyFig1.png" alt="">
+
<p><i>Figure 1: Biosensor Part 1: (532bp)</i></p>
+
                               
+
                                  <h4 class="blog_topHd">
+
                                    Part 2 (1,785 bp)
+
                                    </h4>
+
                               
+
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/a/ac/T--Ionis_Paris--Cloning_StrategyFig2.png" alt="">
+
<p><i>Figure 2: Biosensor Part 2: (1 785bp)</i></p>
+
                             
+
                                  <h4 class="blog_topHd">
+
                                    Part 3 (1,215 bp)
+
                                    </h4>
+
                               
+
                                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/7/71/T--Ionis_Paris--Cloning_StrategyFig3.png" alt="">
+
<p><i>Figure 3: Biosensor Part 3: (1 215 bp)</i></p>
+
                             
+
  
<p></br>We began with the amplification of this parts by PCR in order to increase our stock. We used primers A12 and A13, that respectively bind the prefix and the suffix.</p>
+
                                    <h2 class="sec">Safe Project Design</h2>
 +
                          </div>
  
                          <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/0/0d/T--Ionis_Paris--CSprimers2.jpg" alt="">
+
<div class="col-sm-9">
<p><i>Figure 4: Primers A12 and A13</i></p>
+
                                </div>
+
 
                                  
 
                                  
                                <div class="blog_top">
 
                                    <h4 class="blog_topHd" >
 
                                        Step 2: Storage of our 3 parts in pSB1C3 => BB1, BB2, BB3
 
                                    </h4>
 
  
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/e/eb/T--Ionis_Paris--CSstep2.jpg" alt="">
+
<h2 class="secHd">Choosing a non-pathogenic chassis</h2>
<p><i>Figure 5: Part inclusion in pSB1C3</i></p>
+
  
                                <p>The second step was to store our 3 parts in plasmids and then bacteria. For this we digested and ligated our 3 parts in pSB1C3 (forming BB1, BB2, BB3), and transformed these biobricks in E.Coli DH5 alpha in order to amplify them. After a check of correct clones thanks to colony PCR, we purified our correct biobricks and sequenced them.</p>
+
<p>For our project, we chose to use chassis lab strains of  <i>E. coli</i> bacteria (DH5a and BL21 strains). As non-pathogenic to humans, these E. coli strains belong to Risk Group 1 and thus require only basic precautions. We chose these organisms for convenience reasons: their genomes are entirely sequenced (we knew that the sigma factor required for our transcription factor biosensor was in the bacteria), they are easy to grow and safe to handle.</p>
  
                               
+
                           
                                </div>
+
<h2 class="secHd">Choosing parts that will not harm humans/animals/plants</h2>
                                <div class="blog_top">
+
                                    <h4 class="blog_topHd" style="margin-top:20px">
+
                                      Step 3: Assembling of BB1 with P2 => BB12
+
                                    </h4>
+
  
                                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/cd/T--Ionis_Paris--CSstep3.jpg" alt="">
 
<p><i>Figure 6: Assembly of Biosensor Part 1 with Biosensor Part 2</i></p>
 
  
                                <p>The third step was to assemble Part 2 with Part 1.For this we digested and ligated Part 2 and BB1, and transformed the obtained biobrick (BB12) in E.Coli DH5 alpha in order to amplified them. After a check of correct clones thanks to a PCR colony, we purified our correct biobricks and sequenced them.</p>
+
<p>We designed our project in a way that it should not include parts that could be harmful to humans, animals or plants. Our project involves a XylR transcription factor and a luciferase reporter and neither of these parts are known to have safety issues.</p>
                             
+
 
                                </div>
+
<h2 class="secHd">Biological Containment</h2>
                                <div class="blog_top">
+
 
                                    <h4 class="blog_topHd"  style="margin-top:20px">
+
<p>Our project is designed for a use in everyday life which is why we were particularly aware of safety issues.
                                    Step 4: Assembling of BB12 with P3 => BB123 (Whole Biosensor)
+
The main risks we have identified can be linked to the use of biological elements. We planned to use genetically engineered bacteria and therefore an ethical dimension had to be taken in account. <br/>
                                    </h4>
+
As those modified bacteria will be used in the field, our biggest challenge was to safely contain them. To adress this problem, we developed a containment method that will allow us to separate the bacteria from the environment. The container will be an enclosed device that allows air to be sampled and presented to the bacteria while preventing their accidental release (see <a href="2016.Team:Ionis_Paris/Hardware">Hardware</a>).
 +
The first BioBrick tests were done in the laboratory under simulated environmental conditions. In the meantime, our Engineering team was developing a containment method similar to an airlock that would allow an efficient sampling of the air with no bacteria escaping the collection tube. However no field tests were made during the iGEM competition. <br/>
 +
Although our biggest challenge comes from biology, we also identified a mechanical risk in the drone. There is the possibility that the drone will have an accident. We thought of a security system for this event that will allow us to handle such accident without harm and pollution (see <a href="2016.Team:Ionis_Paris/Hardware">Hardware)</a>.</p>
 +
 
 +
<h2 class="secHd">Thinking about the future</h2>
 +
 
 +
<p>We are also aware of the issues caused by the use of a drone in urban areas and the problems of selling our system to the general public. These issues motivated us to think of an economic model based on the sale of a service, not a product. In this way, our system will only be use by trained person belonging to our company and we will sell only data.</p>
 +
 
 +
</div>
 +
</div>
 +
</div>
 +
</div>
 +
 
  
                                  <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/0/02/T--Ionis_Paris--CSstep4.jpg" alt="">
 
<p><i>Figure 7: Assembly of Biosensor Part 3 to the Biosensor Part 1+2</i></p>
 
  
                                <p>The fourth step was to assemble Part 3 with Part 1 and 2. For this we digested and ligated Part 3 and BB12, and transformed the obtained biobrick (BB123) in E.Coli DH5 alpha in order to amplify them. After a check of correct clones thanks to a PCR colony, we purified our correct biobricks and sequenced them.</p>
 
  
<p><b>Please note that all parts and primers can be found in the "Parts and Characterization" page, along with the primer sequences and the sequencing files</b></p>
 
                           
 
                                </div>
 
                               
 
                                </div>
 
                           
 
                             
 
                        </div>
 
                        <aside class="col-xs-12 col-sm-3 right_sidebar_area">
 
                         
 
                            <div class="sidebarBlog_list mb80">
 
                                <h4 class="sidebar_Hd">Categories</h4>
 
                                <ul class="sidebarList">
 
                                    <li>
 
                                        <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">
 
                                            <span>Working at Lapaillasse</span>
 
                                     
 
                                        </a>
 
                                    </li>
 
                                    <li>
 
                                        <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Biobrick_Design">
 
                                            <span>Biobrick Design</span>
 
                                   
 
                                        </a>
 
                                    </li>
 
                                    <li>
 
                                        <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Protocols">
 
                                            <span>Protocols</span>
 
                                     
 
                                        </a>
 
                                    </li>
 
                                    <li>
 
                                        <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Notebook">
 
                                            <span>Notebook</span>
 
                                         
 
                                        </a>
 
                                    </li>
 
                               
 
                                </ul>
 
                            </div>
 
                         
 
                                    <div role="tabpanel" class="tab-pane fade" id="popular_post">
 
                                        <div class="post_list">
 
                                            <figure class="post_listImg">
 
                                                <a href="blog_grid.html">
 
                                                    <img src="img/blog_list_1.jpg" alt="">
 
                                                </a>
 
                                            </figure>
 
                                            <div class="post_text">
 
                                                <ul class="blog_s">
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#"><i class="zmdi zmdi-calendar-alt"></i>June 18,2015</a>
 
                                                    </li>
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#">
 
                                                            <i class="fa fa-comments" aria-hidden="true"></i>2
 
                                                        </a>
 
                                                    </li>
 
                                                </ul>
 
                                                <h4><a href="#">Creative and impressive building</a></h4>
 
                                            </div>
 
                                        </div>
 
                                        <div class="post_list">
 
                                            <figure class="post_listImg">
 
                                                <a href="blog_grid.html">
 
                                                    <img src="img/blog_list_2.jpg" alt="">
 
                                                </a>
 
                                            </figure>
 
                                            <div class="post_text">
 
                                                <ul class="blog_s">
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#"><i class="zmdi zmdi-calendar-alt"></i>June 18,2015</a>
 
                                                    </li>
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#">
 
                                                            <i class="fa fa-comments" aria-hidden="true"></i>2
 
                                                        </a>
 
                                                    </li>
 
                                                </ul>
 
                                                <h4><a href="#">How you can be a super creative</a></h4>
 
                                            </div>
 
                                        </div>
 
                                        <div class="post_list">
 
                                            <figure class="post_listImg">
 
                                                <a href="blog_grid.html">
 
                                                    <img src="img/blog_list_3.jpg" alt="">
 
                                                </a>
 
                                            </figure>
 
                                            <div class="post_text">
 
                                                <ul class="blog_s">
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#">
 
                                                            <i class="zmdi zmdi-calendar-alt"></i>June 18,2015
 
                                                        </a>
 
                                                    </li>
 
                                                    <li>
 
                                                        <a href="#">
 
                                                            <i class="fa fa-comments" aria-hidden="true"></i>2
 
                                                        </a>
 
                                                    </li>
 
                                                </ul>
 
                                                <h4><a href="#">World best photographer and photography</a></h4>
 
                                            </div>
 
                                        </div>
 
                                    </div>
 
                                </div>
 
                            </div>
 
                     
 
                        </aside>
 
                    </div>
 
                </div>
 
            </div>
 
 
         </section>
 
         </section>
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
         <!-- ====END BLOG TABLE==== -->
 
          
 
          
        <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
+
        <div class="footer_social">
+
  <!-- ====START SOCIAL Link==== -->
            <div class="container-fluid">
+
    <div class="footer_social">
                <div class="row">
+
        <div class="container-fluid">
                    <ul class="ft_top clearfix">
+
            <div class="row">
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                <ul class="ft_top clearfix">
                            <a href="#" target="_blank">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
                                <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
+
                        <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
                            </a>
+
                            <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
                        </li>  
+
                        </a>
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    </li>
                            <a href="#" target="_blank">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
                                <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
+
                        <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
                            </a>
+
                            <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
                        </li>  
+
                        </a>
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    </li>
                            <a href="#" target="_blank">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
                                <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                        <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
                            </a>
+
                            <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>YouTube
                        </li>
+
                        </a>
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    </li>
                            <a href="#" target="_blank">
+
                    <li class="waves-effect waves-light">
                                <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
+
                        <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
                            </a>
+
                            <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
                        </li>  
+
                        </a>
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                    </li>
                            <a href="#" target="_blank">
+
 
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
                 </ul>
                            </a>
+
                        </li>
+
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
                            </a>
+
                        </li>  
+
                    </ul>
+
                 </div>
+
 
             </div>
 
             </div>
 
         </div>
 
         </div>
        <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
+
    </div>
       
+
    <!-- ====END FOOTER TOP==== -->
      <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
+
 
        <footer class="footer_area">
+
    <!-- ====START FOOTER AREA==== -->
            <div class="footer_middle">
+
    <footer class="footer_area">
                <div class="container">
+
        <div class="footer_middle">
                    <div class="row">
+
            <div class="container">
                        <div class="col-xs-12">
+
                <div class="row">
                            <div class="scroll_area">
+
                    <div class="col-xs-12">
                                  
+
                        <div class="scroll_area">
 +
                            <div class="sroll_top">
 +
                                 <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>iGEM IONIS</h4>
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this
            Read More</p>
+
                                    competition we wanted to take advantage of the multiple schools and fields of activity
                              <a href="#">Read More</a>
+
                                    given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
 +
                                <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 280: Line 137:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                        <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
                    <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
                                 <h4>Galleries</h4>
+
                                 <h4>Download the app</h4>
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://itunes.apple.com/us/app/quantifly/id1166875690?ls=1&mt=8"
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/8/8d/IONIS_IGEM_paris_logo_apple.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
                                     </figcaption>
+
                                     </figure>
                                 </figure>
+
                                 </a>
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                 <a href="https://play.google.com/store/apps/details?id=fr.plnech.quantifly&hl=en"
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                  target="_blank" style="target-new: tab;">
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figure class="widget_gallery">
                                    <figcaption>
+
                                        <div class="RXcircleEffect"></div>
                                         <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/6/65/IONIS_IGEM_paris_google_play.png"
 +
                                            alt="" />
 +
                                         <figcaption>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
 
                                             <i class="zmdi zmdi-link"></i>
                                         </a>
+
                                         </figcaption>
                                    </figcaption>
+
                                     </figure>
                                </figure>
+
                                 </a>
                                <figure class="widget_gallery">
+
 
                                     <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                       
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                 <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>  
 
                         </div>  
 +
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 363: Line 188:
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                             <div class="col-md-7 fix_p_l">
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
                                     <ul class="ft_bottom">    
+
                                     <ul class="ft_bottom">
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Working_at_La_Paillasse">in the Lab</a></li>
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Measurement"> Side Projects</a></li>
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Parts">Results</a></li>
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/HPintro">Human
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                            Practice</a></li>
 +
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 375: Line 201:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>  
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
                             </div>
+
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                 </div>
 
                 </div>
             </div>            
+
             </div>
        </footer>
+
    </footer>
        <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
+
    <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
       
+
 
     
+
    <!-- ====Google Maps API==== -->
        <!-- Nos scripts -->
+
    <script src="https://maps.googleapis.com/maps/api/js"></script>
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
 
     
+
    <!-- Nos scripts -->
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 21:03, 19 October 2016

Safe Project Design

Choosing a non-pathogenic chassis

For our project, we chose to use chassis lab strains of  E. coli bacteria (DH5a and BL21 strains). As non-pathogenic to humans, these E. coli strains belong to Risk Group 1 and thus require only basic precautions. We chose these organisms for convenience reasons: their genomes are entirely sequenced (we knew that the sigma factor required for our transcription factor biosensor was in the bacteria), they are easy to grow and safe to handle.

Choosing parts that will not harm humans/animals/plants

We designed our project in a way that it should not include parts that could be harmful to humans, animals or plants. Our project involves a XylR transcription factor and a luciferase reporter and neither of these parts are known to have safety issues.

Biological Containment

Our project is designed for a use in everyday life which is why we were particularly aware of safety issues. The main risks we have identified can be linked to the use of biological elements. We planned to use genetically engineered bacteria and therefore an ethical dimension had to be taken in account.
As those modified bacteria will be used in the field, our biggest challenge was to safely contain them. To adress this problem, we developed a containment method that will allow us to separate the bacteria from the environment. The container will be an enclosed device that allows air to be sampled and presented to the bacteria while preventing their accidental release (see Hardware). The first BioBrick tests were done in the laboratory under simulated environmental conditions. In the meantime, our Engineering team was developing a containment method similar to an airlock that would allow an efficient sampling of the air with no bacteria escaping the collection tube. However no field tests were made during the iGEM competition.
Although our biggest challenge comes from biology, we also identified a mechanical risk in the drone. There is the possibility that the drone will have an accident. We thought of a security system for this event that will allow us to handle such accident without harm and pollution (see Hardware).

Thinking about the future

We are also aware of the issues caused by the use of a drone in urban areas and the problems of selling our system to the general public. These issues motivated us to think of an economic model based on the sale of a service, not a product. In this way, our system will only be use by trained person belonging to our company and we will sell only data.