Difference between revisions of "Team:Peking/Model"

 
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             </style>
 
          
 
          
 
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     <body>
−
        <!--sidebar 引用==============================================================================-->
+
 
−
        <style>
+
             <!-- Navigation -->
−
             #primary span{
+
−
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+
−
                word-break:break-all
+
−
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+
−
       
+
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        #page-wrap {
+
−
            width: 25%;
+
−
            margin: 0px;
+
−
            position: relative;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #sidebar {
+
−
            width: 25%;
+
−
            margin-left: 0px;
+
−
        }
+
−
        @media (min-width:1024px){
+
−
            #sidebar{position:relative;top:120px;max-width:200px;}}
+
−
        @media (max-width: 1023px){
+
−
            #sidebar{display:none;
+
−
            }
+
−
            #page-wrap{display:none;}
+
−
        }
+
−
        </style>
+
−
       
+
−
       
+
−
        <script type="text/javascript">
+
−
            function menuFixed(id){
+
−
                var obj = document.getElementById(id);
+
−
                var _getHeight = obj.offsetTop;
+
−
               
+
−
                window.onscroll = function(){
+
−
                    changePos(id,_getHeight);
+
−
                }
+
−
            }
+
−
        function changePos(id,height){
+
−
            var obj = document.getElementById(id);var windowBottom = $(window).scrollTop() + $(window).innerHeight();
+
−
            if(w>=1024){
+
−
                if($(window).scrollTop() + $(window).height() > $(document).height() - 230){
+
−
                    $('#sidebar').fadeOut("fast");}else{$('#sidebar').fadeIn("fast");}
+
−
            }
+
−
            var scrollTop = document.documentElement.scrollTop || document.body.scrollTop -230;
+
−
            var windowBottom = $(window).scrollTop() + $(window).innerHeight();
+
−
            var w = window.innerWidth;
+
−
           
+
−
            if(scrollTop < height){ obj.style.position = 'relative';
+
−
            }else{
+
−
                obj.style.position = 'fixed';
+
−
            }
+
−
        }
+
−
        </script>
+
−
       
+
−
        <script type="text/javascript">
+
−
            window.onload = function(){
+
−
                menuFixed('sidebar');
+
−
            }
+
−
        </script>
+
−
        <script>
+
−
            function naver(id){
+
−
                var obj=document.getElementById(id);
+
−
                var oPos=obj.offsetTop;
+
−
                return window.scrollTo(0,oPos+250);
+
−
            }
+
−
        </script>
+
−
        <!--sidebar 引用 end ==============================================================================-->
+
−
        <!--panel 引用==================================================================================-->
+
−
        <style type="text/css">
+
−
            .panel-default .panel-heading a{
+
−
                text-decoration: none;
+
−
                display:block;
+
−
                padding:10px;
+
−
            }
+
−
        .panel-heading.panel-title{
+
−
            text-decoration: none;
+
−
            padding-top:0px;
+
−
            padding-bottom:0px;
+
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            padding-left:0px;
+
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            padding-right:0px;
+
−
            text-align:center;
+
−
            font-size:19px;
+
−
           
+
−
        }
+
−
        a[aria-expanded="true"] {
+
−
            background-color:rgba(70, 73, 76, 0.95);
+
−
            text-decoration: none;
+
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            color:white;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="false"]{
+
−
            -o-transition: background-color 1s linear;
+
−
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+
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            -khtml-transition: background-color 1s linear;
+
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            -webkit-transition: background-color 1s linear;
+
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+
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+
−
        }
+
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        .panel-default .panel-heading a[aria-expanded="false"]:hover{
+
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+
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+
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        </style>
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−
       
+
−
        <script type="text/javascript">
+
−
            $(document).ready(function(){
+
−
                              $("#button1").click(function(){
+
−
                                                  $(".panel-collapse").collapse("show");
+
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                                                  });
+
−
                              });
+
−
                              $(document).ready(function(){
+
−
                                                $("#button2").click(function(){
+
−
                                                                    $(".panel-collapse").collapse("hide");
+
−
                                                                    });
+
−
                                                });
+
−
                                                $("#notebook").addClass("navbar-active");
+
−
            </script>
+
−
        <!--panel 引用 end ==================-->
+
−
       
+
−
        <!-- Navigation -->
+
 
         <div id="navigation" class="navbar navbar-fixed-top">
 
         <div id="navigation" class="navbar navbar-fixed-top">
 
             <div class="navbar-inner ">
 
             <div class="navbar-inner ">
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                             <li class="dropdown menu-2"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" > Achievements</a>
 
                             <li class="dropdown menu-2"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" > Achievements</a>
 
                                 <ul class="dropdown-menu">
 
                                 <ul class="dropdown-menu">
−
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Demonstrate" >Results</a></li>
+
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Results" >Results</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Basic_Part" >Parts</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Basic_Part" >Parts</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Collaborations" >Collaborations</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Collaborations" >Collaborations</a></li>
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                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Clearance" >Clearance</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Clearance" >Clearance</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Secretion" >Secretion</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Secretion" >Secretion</a></li>
−
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Proof" >Final Performance</a></li>
+
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Demonstrate" >Final Performance</a></li>
 
                                 </ul>
 
                                 </ul>
 
                             </li>
 
                             </li>
 
                             <li class="dropdown menu-4"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" >Modeling</a>
 
                             <li class="dropdown menu-4"><a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" href="#" >Modeling</a>
 
                                 <ul class="dropdown-menu">
 
                                 <ul class="dropdown-menu">
−
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Model" >Protein polymerization</a></li>
+
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Model/GelPoint" > Model of Gel Point </a></li>
 +
                                    <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Model/MassDistribution" > Model of Mass Distribution</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Software" >Software</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Software" >Software</a></li>
 
                                 </ul>
 
                                 </ul>
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                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/questionnaire" >Questionnaire</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/questionnaire" >Questionnaire</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/consulting" >Consulting</a></li>
 
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/consulting" >Consulting</a></li>
−
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/otherHP" >Other work</a></li>
+
                                     <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/HP/otherHP" >Education&nbsp;&amp;&nbsp;Other</a></li>
 
                                 </ul>
 
                                 </ul>
 
                             </li>
 
                             </li>
Line 243: Line 118:
 
         </div>
 
         </div>
 
         <!--/Navigation -->
 
         <!--/Navigation -->
−
       
+
 
−
       
+
           
−
        <!-- Page Title======================================================================== -->
+
            <style>
−
        <div id="page-title">
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−
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−
                <div class="twelve columns centered text-center">
+
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−
                    <h1>Model<span>.</span></h1>
+
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−
                    <p class="title1" style="text-align:center">    </p>
+
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−
                </div>
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−
            </div>
+
                }
−
        </div><!-- Page Title End-->
+
            .home_text{
−
       
+
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−
        <div id="page-content" class="row page">
+
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−
            <div id="primary" class="twelve columns">
+
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−
                <section>
+
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            }
 +
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                     <div class="row">
 +
                        <div class="twelve columns centered text-center">
 +
                            <h1>Model</h1>
 +
                            <p class="title1" style="text-align:center">The Peking iGEM team 2016 has set up a model on the basis of the principles of polymer science, to describe the fundamental properties of our bio-materials.</p>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div><!-- Page Title End-->
 +
               
 +
                <div id="page-content">
 +
                    <div class="row add-bottom">
 
                          
 
                          
−
                       
+
                         <section id="description" class="content">
−
                       
+
                             <div class="row">
−
                       
+
                           
−
                         <div class="three columns">
+
                               
−
                             <div id="page-wrap">
+
                                 <div class="four columns" style="text-align:center;">
−
                                 <div id="sidebar" style="color:#000000">
+
                                     <p style="text-align:center;"><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Model/MassDistribution"><img style="width: %;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/d/da/T--Peking--images_modelgelpoint.png " alt="" /></p></a>
−
                                     <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('intro')">Introduction</a></h4>
+
                          <p style="font-family:raleway, sans-serif !important; font-weight:100;font-size:18px !important; text-align:justify; margin-top:20px;">The Peking iGEM Team has learned Wallace H. Carothers’s and Paul J. Flory’s methods to predict the gel point of three-dimensional polymerization, and developed the latter as a way to forecast that point of their SpyTag/SpyCatcher crosslinking system. They made it a way to choose the monomers suitable for crosslinking reaction.</p>
−
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('body')">Main&nbsp;Body</a></h4>
+
                                   
−
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('experi')">Experiment&nbsp;&amp;&nbsp;Improvement</a></h4>
+
−
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('results')">Results&nbsp;and&nbsp;Conlusions<／a></h4>
+
−
                                    <h4><a href="javascript:void(0);" onclick="naver('software')">Realated&nbsp;Software<／a></h4>
+
 
                                 </div>
 
                                 </div>
−
                            </div>
+
                               
−
                        </div>
+
                               
−
 
+
                               
−
                       
+
                                <div class="four columns" style="text-align:center;">
−
                    <div class="nine columns">
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                                    <p style="text-align:center;"><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Model/MassDistribution"><img style="width:  %;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/0/0b/T--Peking--image_modelmass.png" /></p></a>
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                                    <p style="font-family:raleway, sans-serif !important; font-weight:100;font-size:18px !important; text-align:justify; margin-top:20px;">The Peking iGEM Team has studied and expanded Paul J. Flory's method to predict the molecular weight distribution of polymer. They compared their reaper’s experimental molecular weight distribution data with the theoretical one and find it is necessary to improve the polymer network's orthogonality with its functional protein. To optimize the reaper's design, they have brought up some compare standards. </p>
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                        <div class="texttitle">Introduction</div>
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                                    <p style="text-align:center;"><a href="https://2016.igem.org/Team:Peking/Software"><img style="width:  %;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/f/f1/T--Peking--image_H51.png" alt=""/></p></a>
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                        <div class="texttitle">Main Body of Our Model</div>
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                                    <p style="font-family:raleway, sans-serif !important; font-weight:100;font-size:18px !important; text-align:justify; margin-top:20px;">SoP is originally built to help our team members work out molecular weight distribution results more efficiently, at least more efficient than excel. Now for the wish of sharing, the software was published on webpage so that everyone can try our method or even compare it with experiments. Note that this application exclusively uses the formula described in our "Model-Mass Distribution" part.</p>
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                        <div class="texttitle" style="font-size:30px;">Related Experiment and Model Improvement</div>
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                        <div class="texttitle">Software</div>
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                         <li><a href="2016.igem.org/Team:Peking">Home</a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:pkuigem2016@126.com">Contact</a></li>
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                         <span> &copy;2016 PEKING IGEM. All Rights Reserved.</span>
 
                         <span> &copy;2016 PEKING IGEM. All Rights Reserved.</span>
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                        <li style="padding-right:20px"><a href="https://twitter.com/iGEM_Peking"><i class="fa fa-twitter"><img style="height:22px; margin-top:4px; margin-bottom:-4px;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/3/39/T--Peking--image_hometwitter.png"/></i></a></li>
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                        <li style="padding-right:20px"><a href="#"><i class="fa fa-skype"><img style="height:22px; margin-top:4px; margin-bottom:-4px;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2016/c/cc/T--Peking--image_homeskype.png"/></i></a></li>
 
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Latest revision as of 03:09, 2 December 2016

Model

Model

The Peking iGEM team 2016 has set up a model on the basis of the principles of polymer science, to describe the fundamental properties of our bio-materials.

The Peking iGEM Team has learned Wallace H. Carothers’s and Paul J. Flory’s methods to predict the gel point of three-dimensional polymerization, and developed the latter as a way to forecast that point of their SpyTag/SpyCatcher crosslinking system. They made it a way to choose the monomers suitable for crosslinking reaction.

The Peking iGEM Team has studied and expanded Paul J. Flory's method to predict the molecular weight distribution of polymer. They compared their reaper’s experimental molecular weight distribution data with the theoretical one and find it is necessary to improve the polymer network's orthogonality with its functional protein. To optimize the reaper's design, they have brought up some compare standards.

SoP is originally built to help our team members work out molecular weight distribution results more efficiently, at least more efficient than excel. Now for the wish of sharing, the software was published on webpage so that everyone can try our method or even compare it with experiments. Note that this application exclusively uses the formula described in our "Model-Mass Distribution" part.


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