Difference between revisions of "Team:Pasteur Paris/Microbiology week3"

Line 1: Line 1:
 
 
{{Paris_Pasteur_Microbiology}}
 
{{Paris_Pasteur_Microbiology}}
  
Line 246: Line 245:
  
  
         <div class="lightbox" id="exp12">
+
         <div class="lightbox" id="exp1">
 
           <figure>
 
           <figure>
 
                 <a href="#" class="closemsg"></a>
 
                 <a href="#" class="closemsg"></a>
Line 821: Line 820:
 
         </figcaption>
 
         </figcaption>
 
     </figure>
 
     </figure>
</div>
 
 
<div class="lightbox" id="exp11">
 
  <figure>
 
    <a href="#" class="closemsg"></a>
 
    <figcaption>
 
 
              <p>
 
                <U> Aim:</U> Measure the quantity of plasmid using a Nanodrop (Thermofisher) before sending for sequencing (inserts B1 and C2)</br></br>
 
                <U> Protocol:</U> follow in this link </br></br>
 
                <U>What we did in the lab:</U></br>
 
                <U>Materials:</U></br>
 
 
                &bull; Nanodrop (Thermofisher)</br>
 
              &bull; Elution buffer from QIAGEN kit</br>
 
              &bull; Microbiology equipment (Follow this link)</br></br>
 
 
                <U>Method:</U></br>
 
                    Analyze absorbance at 260nm</br>
 
                    1. Clean the Nanodrop with water</br>
 
                    2. Make the blank with 1 &#181;l of elution buffer</br>
 
                    3. Put 1ul of your sample on the Nanodrop</br>
 
                    4. Make the measure and clean the Nanodrop between each measure</br></br>
 
                <U>Results:</U></br>
 
 
              <table>
 
                <thead>
 
                  <tr>
 
                    <th>&#x3BB;= 260 nm</th>
 
                    <th>B1(1)</th>
 
                    <th>B1(2)</th>
 
                    <th>C2>th>
 
                  </tr>
 
                </thead>
 
 
                <tbody>
 
                  <tr>
 
                    <td><strong><p>A<sub>DNA</sub></p></strong></td>
 
              <td>0.725</td>
 
                    <td>0.741</td>
 
                    <td>0.761</td>
 
                  </tr>
 
 
                  <tr>
 
                    <tr>
 
                    <td><strong>C final</strong></td>
 
                    <td>36.3 ng/&#181;l</td>
 
                    <td>37.0 ng/&#181;l</td>
 
                    <td>38.0 ng&#181;l</td>
 
                  </tr>
 
 
                </tbody>
 
              </table>
 
              <U>Absorbance</U>
 
              </br></br></br>
 
 
              5. Preparation of the samples for sequencing: put 15 &#181;l of DNA and add 2 &#181;l of fitted primers</br>
 
              6. Send the samples for sequencing</br>
 
              </p>
 
    </figcaption>
 
  </figure>
 
 
</div>
 
</div>
  

Revision as of 18:31, 30 September 2016