Difference between revisions of "Team:Ionis Paris/Protocol 13"

(Created page with "{{IONIS_HEADER}} <html> <!-- ====Google font==== --> <link href='https://fonts.googleapis.com/css?family=Merriweather:400,700,700italic,400italic,300italic...")
 
Line 256: Line 256:
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                     <ul class="ft_top clearfix">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.facebook.com/ionisigem/?fref=ts" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                                 <i class="zmdi zmdi-facebook "></i>Facebook
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://twitter.com/igem_ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                                 <i class="zmdi zmdi-twitter"></i>Twitter
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.youtube.com/channel/UC0RyQsB5YpweSRBYQlAdZDA" target="_blank">
                                 <i class="zmdi zmdi-flickr"></i>Flickr
+
                                 <i class="zmdi zmdi-youtube"></i>youtube
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
 
                         <li class="waves-effect waves-light">
                             <a href="#" target="_blank">
+
                             <a href="https://www.linkedin.com/company/igem-ionis" target="_blank">
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                                 <i class="zmdi zmdi-linkedin"></i>LinkedIn
 
                             </a>
 
                             </a>
 
                         </li>  
 
                         </li>  
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-dribbble"></i>Dribble
+
                            </a>
+
                        </li>
+
                        <li class="waves-effect waves-light">
+
                            <a href="#" target="_blank">
+
                                <i class="zmdi zmdi-vimeo"></i>Vimeo
+
                            </a>
+
                        </li>
+
 
                     </ul>
 
                     </ul>
 
                 </div>
 
                 </div>
Line 298: Line 289:
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                         <div class="col-xs-12">
 
                             <div class="scroll_area">
 
                             <div class="scroll_area">
 +
                                <div class="sroll_top">
 +
                                  <a href="#ancre"> <i class="zmdi zmdi-chevron-up btn waves-effect"> </i> </a> 
 +
                                </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
 +
                      <div class="row">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                         <div class="col-lg-5 col-md-5 col-sm-12">
 
                             <div class="middle_content">
 
                             <div class="middle_content">
                                 <h4>More about us</h4>
+
                                 <h4>IONIS IGEM</h4>
                                 <p>If you’ve followed along and done the steps above, you’ve created a good starting place. You’re going to need to make sure your pages are optimized properly. This will ensure you get your page ranked high in the search engines. ou’re going to need to make sure your pages are optimized properly.
+
                                 <p> We're a group of six different schools from the IONIS Education Group. For this competition we wanted to take advantages of the multiple schools and activity field given by the IONIS education group to create a solid project.</p>
            Read More</p>
+
                               <a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Team">Read More</a>
                               <a href="#">Read More</a>
+
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 +
             
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                         <div class="col-lg-3 col-lg-offset-1 col-md-4 col-sm-7">
 
                             <div class="footer_Widgets">
 
                             <div class="footer_Widgets">
Line 316: Line 311:
 
                                     <ul>
 
                                     <ul>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-pin"></i>
                                             <span>Location: Lorance Road 542B,5248 MT, Wordwide Country</span>
+
                                             <span>Location: 66 Rue Guy Môquet, 94800 Villejuif, France</span>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-phone"></i>
+
                                            <a href="tel:123-456-7890">Phone: 123-456-7890</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
 
                                         <li><i class="zmdi zmdi-email"></i>
                                             <a href="mailto:contact@domain.com">email: contact@domain.com</a>
+
                                             <a href="mailto:igem.ionis@gmail.com">email: igem.ionis@gmail.com</a>
                                        </li>
+
                                        <li><i class="zmdi zmdi-globe"></i>
+
                                            <a href="#">www.domain.com</a>
+
 
                                         </li>
 
                                         </li>
 +
                                     
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
                         <div class="col-lg-3 col-md-3 col-sm-5">
+
 
                            <div class="footer_Widgets">
+
                          
                                <h4>Galleries</h4>
+
 
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_1.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_1.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_2.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_2.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_3.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_3.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_4.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_4.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_5.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_5.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                                <figure class="widget_gallery">
+
                                    <div class="RXcircleEffect"></div>
+
                                    <img src="img/gallery_6.jpg" alt="" />
+
                                    <figcaption>
+
                                        <a class="veno vbox-item" href="img/gallery_6.jpg" data-gall="group_4">
+
                                            <i class="zmdi zmdi-link"></i>
+
                                        </a>
+
                                    </figcaption>
+
                                </figure>
+
                            </div>
+
                        </div>
+
 
                     </div>
 
                     </div>
 +
 
                 </div>
 
                 </div>
 
             </div>
 
             </div>
Line 400: Line 336:
 
                                 <nav>
 
                                 <nav>
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
 
                                     <ul class="ft_bottom">       
                                         <li><a href="#">Home</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris">Home</a></li>
                                         <li><a href="#">Services</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/At_the_lab.html">At the Lab</a></li>
                                         <li><a href="#"> About </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/CelloCad"> Side Projects</a></li>
                                         <li><a href="#">Portfolio</a></li>
+
                                         <li><a href="Results">Results</a></li>
                                         <li><a href="#">Blog </a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris/Human_Practice">Human Practice</a></li>
                                         <li><a href="#">Contact US</a></li>
+
                                         <li><a href="https://2016.igem.org/Team.html">Team</a></li>
 
                                     </ul>
 
                                     </ul>
 
                                 </nav>
 
                                 </nav>
Line 411: Line 347:
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                             <div class="col-md-5 fix_p">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
 
                                 <div class="ft_paragraph">
                                     <p>©2016 Design by <a href="https://www.behance.net/googoling">Faridul Haque</a> and Develop by <a href="http://themeebit.com">ThemeeBiT</a>.</p>   
+
                                     <p>©IONIS_IGEM_2016</a>.</p>   
 
                                 </div>
 
                                 </div>
 
                             </div>   
 
                             </div>   
Line 420: Line 356:
 
         </footer>
 
         </footer>
 
         <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
 
         <!-- ====END FOOTER AREA==== -->
       
 
 
        
 
        
 
         <!-- Nos scripts -->
 
         <!-- Nos scripts -->
 +
<!-- TODO: Debug these scripts
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Venobox&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_MDB&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
        <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS_Carousel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
-->
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
         <script type="text/javascript" src="https://2016.igem.org/wiki/index.php?title=Template:IONIS_PARIS_JS&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 +
 
        
 
        
 
</html>
 
</html>

Revision as of 12:36, 16 October 2016

Protocol 13: Luciferase assay

Aim: Assess the luminescence of our biosensor when exposed to toluene

Warning: in order to get proper result analysis, it is better to perform 3 replicates for each toluene concentration

Toluene preparation: stock solutions

100mg/L: Dilution of absolute liquid toluene to obtain a final toluene concentration at 100mg/L: Add 11,53uL of toluene into 100mL water (calculations done from toluene's molecular weight)
100µg/L: Dilute 10µL of the first stock solution into 10mL of water

Inoculation

From 1 UFC: Resuspend colony in 20 mL of LB medium containing chloramphenicol at 25µg/mL but free of toluene and grow over night.
When turbidity is high, inoculate the appropriate volume of bacteria culture to liquid LB medium containing chloramphenicol to reach 0,1 OD in the flask (100mL). Incubate culture at 37°C and 250 rpm .
When the OD reach 0.3, separate the initial bacterial culture to several falcon tubes (5mL in each tube) and add toluene to reach the desired toluene concentration.

Incubate culture at 37°C and 250 rpm.
Prepare the GLuc assay solution (e.g. 100 samples) by adding 50 μl of BioLux GLuc Substrate to 5 ml of BioLux GLuc Assay Buffer immediately before performing the assay. Mix well by inverting the tube several times (Do not vortex). Set the camera.
At several time (t= 30min, t=1h, t=1h30…, t=4h), pipet samples (5–20 μl per well) into a 96-well white (opaque) or black plate, or a luminometer tube.
Add the GLuc assay solution (50 μl) to a sample (i.e. Add the assay solution to only one sample at a time) and promptly measure the luminescence.
NB : Approximately 90% of GLuc is secreted out into the growth media after transfection and thus, the GLuc activity is typically assayed from the supernatant (i.e. growth media of GLuc-transfected cells). However, as long as the cells are alive, approximately 10% of GLuc is present inside the cells. Therefore, GLuc activity can also be assayed from the cell lysate.