Team:LMU-TUM Munich/Materials

Materials

Enzymes and Proteins

Enzymes

• Lysozym (22770 U/mg) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Pfu-Ultra II DNA Polymerase (Promega GmbH, Mannheim)
• T4-DNA-Ligase (200 CEU/μl) (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• Alkalische Phosphatase aus der arktischen Garnele (1 U/μl)(Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)
• FastAP thermosensitive alkalische Phosphatase (1 U/μl) (Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)

Restriction enzymes

• AfeI / Eco47III (Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)
• HindIII (Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)
• DpnI (Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)
• MlyI (New England Biolabs GmbH, Frankfurt am Main)
• NcoI (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• NheI (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• SapI (New England Biolabs GmbH, Frankfurt am Main)
• StuI / Eco147I (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• NgoMIV (New England Biolabs GmbH, Frankfurt am Main)
• XbaI (Thermo Fisher Scientific Inc., St. Leon-Rot)

Proteins

Albumin Fraktion V (BSA) (AppliChem GmbH, Darmstadt)

Chemicals

• 2,2'-Dithiodipyridin (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• 2-Mercaptoethanol (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Acetonitril (LC-MS grade) (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• 30% Acrylamid mit 0,8% Bisacrylamid (Serva Electrophoresis GmbH, Heidelberg)
• Agarose (peqlab Biotechnologie GmbH, Erlangen)
• Agarose (low melting point) (InvitrogenAG, Basel, Schweiz)
• Ameisensäure (LC-MS grade) (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Ammoniak, 25 %ig (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• Ammoniumacetat (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Ammoniumchloris (NH4Cl) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Ammoniumperoxodisulfat (APS) (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Ampicillin, Natriumsalz (Formedium, Hunstanton, UK)
• Anhydrotetrazyklin (aTc) (Acros Oranics, Geel, Belgien)
• Antifoam A, 30 %ige Stammlösung (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Bacto Agar Becton (DIFCO Laboratories GmbH, Augsburg)
• Bacto Tryptone Becton (BD, DIFCO Laboratories GmbH, Augsburg)
• Bacto Yeast Extract Becton (BD, DIFCO Laboratories GmbH, Augsburg)
• Betain, Monohydrat (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Borsäure (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Bromphenolblau (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Coomassie Brilliantblau R-250 (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Chloramphenicol (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• D(+)-Glukose, Monohydrat (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• D(+)-Saccharose (AppliChem GmbH, Darmstadt
• Dimethylformamid (DMF) (Merck KG, Darmstadt)
• Dithiodiethanol (Acros Oranics, Geel, Belgien)
• dNTPs (InvitrogenAG, Basel, Schweiz)
• Essigsäure, 99,9 % (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• Ethanol p. a., 99,9 % (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• Ethidiumbromid (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Ethylendinitrilo-tetraessigsäure-Na2 (EDTA) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• L-Glycin (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Glycerin (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Guanidiniumchlorid (Nigu Chemie GmbH, Waldkraiburg)
• Harnstoff (CH4N2O) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Helipur H plus N (B. Braun Melsungen AG, Melsungen)
• Imidazol (Merck KG, Darmstadt)
• Isopropanol (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• Kaliumchlorid (KCl) (Merck KG, Darmstadt)
• Kaliumdihydrogenphosphat (KH2PO4) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Kaliumsulfat (K2SO4) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Magnesiumchlorid (MgCl2 · 6 H2O) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Methanol (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• N,N,N͛,N͛-Tetramethylethylendiamin (TEMED) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Natriumacetat (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Natriumcarbonat (Na2CO3) (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Natriumchlorid (NaCl) (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Natriumdihydrogenphosphat (NaH2PO4) (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Dinatriumhydrogenphosphat (Na2HPO4) (VWR International GmbH, Ismaning)
• Natriumdodecylsulfat (SDS) (Serva Electrophoresis GmbH, Heidelberg)
• Natriumhydroxid (NaOH) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Nickelsulfat (Ni(II)SO4· 6 H2O) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• L-Prolin (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Puffer-Standardlösungen für pH-Meter (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)
• Salzsäure, konz. (HCl) (Honeywell Deutschland AG, Neunkirchen)
• Tris-(hydroxymethyl)-aminomethan (Tris) (AppliChem GmbH, Darmstadt)
• Tween 20 SigmaUltra (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Xylencyanol (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Zinksulfat (ZnSO4· 7 H2O) (Carl Roth GmbH & Co. KG, Karlsruhe)

Standards

DNA standars

• GeneRuler 1 kb DNA Ladder (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• GeneRuler 100 bp DNA Ladder (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)

Proteinstandard for SDS-PAGE

• Unstained Protein MW Marker (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)
• PageRuler Prestained Protein Ladder (Fermentas GmbH, St. Leon-Rot)

Proteinstandard for size exclusion chromatography

• Aprotinin; 6,5 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Cytochrom C; 12,4 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Carboanhydrase; 29 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Rinderserumalbumin; 66 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• β-Amylase; 200 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Apoferritin; 443 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Thyroglobulin 669 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• Dextranblau 2000 kDa (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)

Proteinstandard for isoelectric focussing

• IEF mix 3.6-9.3 (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)

Kits

Kits for molecular biology work

• QIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen GmbH, Hilden)
• QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen GmbH, Hilden)
• QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen GmbH, Hilden)

Kits for protein quantification

• Dual-Luciferase Reporter Assay (Promega GmbH, Mannheim)
• BTS-Tabletten (Roche Deutschland Holding GmbH, Grenzach-Wyhlen)

Kit for DNA sequencing

• Big Dye Terminator Cycle Sequencing (Life Technologies GmbH, Darmstadt)
• TSR-Puffer = Formamid GC-grade (Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Taufkirchen)
• ZR DNA Sequencing Clean-up Kit (Zymo Research Europe GmbH, Freiburg)